| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 59,226 | G→A | 9.0% | intergenic (‑42/+90) | PP_0050 ← / ← PP_0051 | hypothetical protein/sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 59,226 | 0 | G | A | 9.0% | 189.4 / 5.3 | 66 | intergenic (‑42/+90) | PP_0050/PP_0051 | hypothetical protein/sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/32); new base A (3/3); total (31/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
GCGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCATGCCAA > NC_002947/59079‑59371 | gCGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTattga > 7:344287/1‑149 (MQ=255) cGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTattgat > 7:224771/1‑149 (MQ=255) cGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTattgat < 7:307445/149‑1 (MQ=255) cGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTattga < 3:176604/148‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGAATGAGCGCTGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTTATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTattgatt < 4:170958/149‑1 (MQ=255) tGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGc > 8:236321/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGcc < 4:129951/148‑1 (MQ=255) gccgccATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAg < 6:73454/149‑1 (MQ=255) ccgccATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAgg > 7:133281/1‑149 (MQ=255) ccgccATCATGCCGATCAGGCGAGCCCGGTTGCGCGAAGCTAGCCAGCGGTGTGCTGAACATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGATAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAgg > 4:371463/1‑149 (MQ=255) gccATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTTCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAgg < 7:148717/147‑1 (MQ=255) gccATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAgg > 8:148717/1‑147 (MQ=255) gccATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGtt > 4:250665/1‑149 (MQ=255) catcatGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCTCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCg < 6:253617/149‑1 (MQ=255) 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gggCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCa > 6:31688/1‑149 (MQ=255) cccGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAggcgatt < 3:68576/130‑6 (MQ=255) cccGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAggcgatt > 4:68576/1‑125 (MQ=255) ggTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGAttt > 4:66206/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTccc < 7:236321/149‑1 (MQ=255) gcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCt > 4:16336/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCt > 7:280519/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCt > 4:249471/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCt > 2:348076/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGCTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCt > 5:371223/1‑149 (MQ=255) cgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGAttttt > 2:153293/1‑144 (MQ=255) cgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGAttttt < 1:153293/144‑1 (MQ=255) cgAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCtt < 3:249471/149‑1 (MQ=255) gAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGt > 8:71229/1‑120 (MQ=255) gAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGt < 7:71229/120‑1 (MQ=255) gAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTcc > 4:3130/1‑145 (MQ=255) gAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTcc < 3:3130/145‑1 (MQ=255) gAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCttt < 8:224771/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCaa < 7:1998/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGAAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGGTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATg > 5:368053/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTTGGTCTTTCTTCATTTTGTTGCGGTCCTCTTCCTGTTAATCTCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTGGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGt < 3:371463/148‑1 (MQ=255) aGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCTGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAgg < 8:321880/149‑1 (MQ=255) aGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAgg < 8:344287/149‑1 (MQ=255) gtgtGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGgcgc < 1:348076/149‑1 (MQ=255) tgCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAgg > 5:74628/1‑149 (MQ=255) tgCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAg < 3:250665/148‑1 (MQ=255) aGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTaa < 2:25938/147‑1 (MQ=255) aGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAg > 4:186867/1‑149 (MQ=255) gAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCg > 4:280522/1‑149 (MQ=255) aGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCg < 2:323183/148‑1 (MQ=255) aGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGCTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCg < 6:371223/148‑1 (MQ=255) gcgcGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAgg < 4:353563/85‑1 (MQ=38) gcgcGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAATCAATACTTGCCAgg > 3:353563/1‑85 (MQ=38) cAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTg < 8:280519/149‑1 (MQ=255) cGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAgg > 8:137043/1‑122 (MQ=255) ggCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTttcagt > 5:156786/1‑148 (MQ=255) cTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCATGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTttcagttca < 3:66206/149‑1 (MQ=255) tcATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTc < 2:330245/85‑1 (MQ=255) aTTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTc < 3:279509/113‑1 (MQ=255) aTTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTc > 4:279509/1‑113 (MQ=255) tGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCt < 3:186867/148‑1 (MQ=255) ggTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAAAGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAgc < 2:82633/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAgcggc < 3:280522/148‑1 (MQ=255) ccTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATa < 6:156786/147‑1 (MQ=255) gTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAgcg > 5:175593/1‑149 (MQ=255) gTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAgcg > 7:356024/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAgcgtgcg > 4:67975/1‑149 (MQ=255) ccTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCCATACAGCGTGCGTTCa > 5:289882/1‑149 (MQ=255) cTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCAc < 3:16336/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACt > 5:79964/1‑148 (MQ=255) cAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTGTGGGGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCAt > 8:104849/1‑149 (MQ=255) gTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTATGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCAGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCATGc > 5:133472/1‑148 (MQ=255) attgattgCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCATGcc > 7:87796/1‑147 (MQ=255) ttgattgCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCATGCCaa < 8:87796/148‑1 (MQ=255) | GCGATGGGCCGCCATCATGCCGATCAGGCGGGCCCGGTTGCGCGAAGCTTGCCAGCGGTGTGCTGAGCATGAGCGCGGCGCAGATCACGGTTAGGGCTTTCTTCATTTTGATGCGGTCCTCTGCCTGTTAATCGCCTGGCAAGTATTGATTGCCAGGTTCGGTTAACTGATCAGACCACGATTTTTCCCTTTCAATGTCAGGGCGCAGGTAAAGGTCCGGTAAAGTCTGGCGTTCTTTCAGTTCAGCCCGAGCGCTTTCAAGCGGCGATACAGCGTGCGTTCACTCATGCCAA > NC_002947/59079‑59371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |