| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 670,786 | A→G | 11.6% | Q743R (CAG→CGG) ‡ | pbpC → | peptidoglycan glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 670,786 | 0 | A | G | 11.6% | 217.2 / 17.3 | 86 | Q743R (CAG→CGG) ‡ | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/39); new base G (5/5); total (42/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.63e-01 | |||||||||||
CAGGCGCCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCC > NC_002947/670638‑670934 | cctgcggcgGGCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCa < 2:24794/146‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGcc > 5:382956/1‑149 (MQ=255) cgcCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCg < 6:70882/149‑1 (MQ=255) gcCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGt > 6:185401/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTg < 2:264062/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCTCCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTTAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGGGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTgg < 7:136363/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTga < 5:185401/149‑2 (MQ=255) ggCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTga < 2:10695/149‑2 (MQ=255) gCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTggg < 7:29359/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTgagg < 7:101930/149‑4 (MQ=255) ccAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt < 8:289668/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt < 2:281617/149‑1 (MQ=255) caccGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGAGCCGCCCGGCCACCCGCACTGAGCCGTTGCAATTCCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGCTTCCTCAACCGCCAGCCCTTCCGTGAAACCCAg > 2:224127/1‑149 (MQ=255) cGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAgggg > 1:261535/1‑149 (MQ=255) tGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAg > 2:139533/1‑149 (MQ=255) gATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGa > 4:237476/1‑147 (MQ=255) tcgtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGc < 1:392945/149‑1 (MQ=255) gtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGATGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCtt < 1:224127/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCttgttg < 1:372917/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGtt > 8:2215/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGAGttt > 2:183090/1‑149 (MQ=255) aGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGc < 7:313051/149‑1 (MQ=255) gCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCca > 2:269613/1‑149 (MQ=255) cAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAgg > 2:279808/1‑149 (MQ=255) aaTCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGt < 2:325117/149‑1 (MQ=255) aaTCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGt < 3:237476/149‑1 (MQ=255) tCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCg > 4:327432/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCggg > 3:308040/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCggg < 3:146798/147‑1 (MQ=255) gccgccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGCCGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAg > 5:78705/1‑149 (MQ=255) ccgccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTg < 3:320574/94‑1 (MQ=255) ccgccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTg > 4:320574/1‑94 (MQ=255) gccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGcc > 3:132488/1‑149 (MQ=255) cGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGaa < 4:308040/149‑1 (MQ=255) cGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGACGTTGGGTGAAACCCAGTGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGACACAGGTCGGGCAGGCCGaa > 1:311264/1‑149 (MQ=255) caccaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCa < 7:129074/149‑1 (MQ=255) ccaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgc < 1:269613/149‑1 (MQ=255) caGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCttgttg > 8:188951/1‑112 (MQ=255) caGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCttgttg < 7:188951/112‑1 (MQ=255) caGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgcg > 8:60734/1‑149 (MQ=255) aGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt < 7:260025/84‑1 (MQ=255) aGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt > 8:260025/1‑84 (MQ=255) aCTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCt < 6:382956/149‑1 (MQ=255) tGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg > 6:217851/1‑148 (MQ=255) aGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCa < 2:250739/91‑1 (MQ=255) gCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGAc > 3:390502/1‑148 (MQ=255) gTTGCATTTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTTGTTCCTCAACTGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACTGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGTTCGGTCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGaaa < 1:54934/149‑1 (MQ=255) aaTTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGt > 2:260855/1‑149 (MQ=255) aTTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTc < 7:45575/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGt > 4:297424/1‑146 (MQ=255) gCAGGTATCTGCCTTGGGTCGTGGTGCACGGCTCTGGTGCTTACTCAACTGCAAGCCGTTGCGAGAAACACAGGGGAAGGACAGCTAGTTGCTGCGTATGCCACAGGTCGCACAGGCAGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAg > 4:331439/1‑148 (MQ=255) aGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACg > 6:386818/1‑149 (MQ=255) gTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGgc > 3:84139/1‑149 (MQ=255) tCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGgcgc < 6:201060/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGt > 1:17201/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCCCAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTg > 3:336733/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCAGAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGt < 3:331439/148‑1 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCgg < 7:312776/146‑1 (MQ=255) cTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTgg > 8:150211/1‑149 (MQ=255) gggTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGTAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGt > 4:310226/1‑149 (MQ=255) gtggtggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 3:327432/149‑1 (MQ=255) gtggtggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 7:150211/149‑1 (MQ=255) gtggtggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 3:377938/149‑1 (MQ=255) gtgggtgACGGAGCTGGTGGTTACTAAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 2:311264/143‑1 (MQ=255) ggggtggCCGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 7:60734/147‑1 (MQ=255) gtggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg > 2:251188/1‑110 (MQ=255) tggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGTGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCa < 1:139533/149‑1 (MQ=255) gACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGt < 4:84139/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAg > 2:373639/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGTAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGt < 3:310226/149‑1 (MQ=255) gtggtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGgt < 1:183090/147‑1 (MQ=255) tggtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGtt > 8:106859/1‑149 (MQ=255) 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> 5:297701/1‑148 (MQ=255) tCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgacga > 3:165428/1‑148 (MQ=255) tCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgacga > 6:387498/1‑148 (MQ=255) ccAACGGCTGGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgacga > 5:74827/2‑148 (MQ=255) ccAACGGCTGGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGAGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCgacgac > 8:202925/2‑149 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACTGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGGTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACa < 4:44539/148‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAg > 7:132209/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGcc < 8:132209/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCgg < 3:297424/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGc < 7:31846/149‑1 (MQ=255) aGCCGTTGGGTGAAAGCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGcc < 7:106859/149‑1 (MQ=255) aGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGCGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGcc < 1:279808/149‑1 (MQ=255) | CAGGCGCCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCC > NC_002947/670638‑670934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |