Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 704,122 | T→A | 5.3% | L72H (CTC→CAC) | PP_5745 → | paraquat‑inducible protein A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 704,122 | 0 | T | A | 5.3% | 234.8 / 2.8 | 76 | L72H (CTC→CAC) | PP_5745 | paraquat‑inducible protein A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/35); new base A (2/2); total (39/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
AGCACTTCGCAAACCTGCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGT > NC_002947/703977‑704269 | aGCACTTCGCAAACCTGCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCgg > 5:359917/1‑149 (MQ=255) gCAAACCTGCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAggg > 5:113984/1‑147 (MQ=255) gCAAACCTGCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGAGGGTACTCACGGTCatgatc < 5:69287/149‑6 (MQ=255) gCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGa > 6:304857/1‑148 (MQ=255) cacGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACAcc < 1:78940/149‑1 (MQ=255) acGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACca < 6:80363/149‑1 (MQ=255) acGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACca < 5:105327/149‑1 (MQ=255) gTTGCGGCGCTATAGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCAAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGCGTACCCTAGGTCAGGGTAGCCCGGACACcat > 1:57982/1‑148 (MQ=255) ggcgCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTTATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTTAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTc < 1:360377/149‑1 (MQ=255) cgcTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCg < 6:113984/149‑1 (MQ=255) cTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGCTCATAGACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACATGATGGTGTCCgg < 1:289214/149‑1 (MQ=255) cTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGgt < 7:170376/149‑1 (MQ=255) cTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGgt < 6:359917/149‑1 (MQ=255) tATCGTTCATGCACGCCGGCCGAAGAGTATCGTGCGCACGTGGGCGTTTCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACTTCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGTTCAGGGTAGACCGGACACCATCATGTCCGgtg < 5:119866/149‑1 (MQ=255) tATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGgtg > 3:60067/1‑149 (MQ=255) tATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGCCCGgtg > 3:376277/1‑149 (MQ=255) tATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCAGGCCAACATACTGCCGATCAT‑TACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGACCGGACACCATCATGTCAGgtg > 3:46804/1‑149 (MQ=255) gTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGtcat < 7:84236/149‑1 (MQ=255) gTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGtca > 4:74064/1‑148 (MQ=255) tgcatgcaCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGtcatc < 2:298712/149‑1 (MQ=255) catgcaCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAg < 4:248397/114‑1 (MQ=255) catgcaCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAg > 3:248397/1‑114 (MQ=255) atgcaCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCAcc < 4:232433/149‑1 (MQ=255) gcaCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCt > 4:354257/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGgt > 4:99933/1‑136 (MQ=255) aCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGgt < 3:99933/136‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGc > 2:72214/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGATGATTGCGGGGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGc < 3:374694/149‑1 (MQ=255) gccggccgAACAGTATAGTGCGGACCTGGGCGTTGCTGATTGCTGCGTCTATCCTCTACATGCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCTGTCAGGGTAGGCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCTCCCTGCTc < 4:323548/149‑1 (MQ=255) ccgAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCa > 7:357601/1‑149 (MQ=255) gAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACg < 4:60067/149‑1 (MQ=255) gTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGCTGTCATCACCCTGCTCAAGAACGGCATg > 1:125211/1‑149 (MQ=255) tCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCTTCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTg > 5:333897/1‑149 (MQ=255) cagcTGGGCGGTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTg < 4:46804/146‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCt > 4:384817/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCtgtg < 3:384817/149‑1 (MQ=255) tGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGtt > 1:376219/1‑148 (MQ=255) aTTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCAt > 3:48910/1‑149 (MQ=255) ttGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCAtt < 3:74064/149‑1 (MQ=255) gcggcgTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGGTGTGGTGTTCATTg > 4:168580/1‑148 (MQ=255) ggcgTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCa < 7:249895/149‑1 (MQ=255) gcggcgATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAg < 5:200156/149‑1 (MQ=255) gATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATcc < 8:357601/149‑1 (MQ=255) aTCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCt > 5:284525/1‑149 (MQ=255) ctctACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGt > 3:351874/1‑149 (MQ=255) tctACATCCCGGCCAAAATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTggac > 5:226469/1‑147 (MQ=255) tACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCAAGTATCCTGGTccc > 4:247087/1‑149 (MQ=255) cccGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGt > 3:107776/1‑149 (MQ=255) cccGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTCAGTACCCTCCGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATCTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCTGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGt < 2:57982/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGtt < 2:251488/149‑1 (MQ=255) aaCATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCt > 1:7612/1‑149 (MQ=255) cATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCtgg > 2:151568/1‑149 (MQ=255) cATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCtgg > 2:127679/1‑149 (MQ=255) cATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCtgg > 6:196049/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCtggtgg > 2:56724/1‑149 (MQ=255) cTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGt < 7:278121/89‑1 (MQ=255) cTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGt > 8:278121/1‑89 (MQ=255) tGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTggg > 2:112730/1‑148 (MQ=255) ccGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCAt > 2:26096/1‑149 (MQ=255) ccGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGGTCAAGCTGGTGGGCAt > 6:263127/1‑149 (MQ=255) gATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGATACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCg > 5:83122/1‑149 (MQ=255) tCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGACCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGc < 6:226469/149‑1 (MQ=255) aT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCt < 3:354257/148‑1 (MQ=255) t‑GACCGAGGGTACTCACGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTg > 5:42272/1‑149 (MQ=255) t‑GACCGAGGGTACTCACGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTg > 3:162366/1‑149 (MQ=255) aCCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGc < 6:284525/148‑1 (MQ=255) gagggTACTCACGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgtt < 6:42272/145‑1 (MQ=255) gTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGATACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgtt < 6:83122/149‑1 (MQ=255) gTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgtt < 5:304857/149‑1 (MQ=255) tGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCa < 6:121354/102‑1 (MQ=255) tGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCa > 5:121354/1‑102 (MQ=255) tGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgttg > 4:388787/1‑149 (MQ=255) tGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgttg < 3:168580/149‑1 (MQ=255) tGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCtgttg < 2:376219/149‑1 (MQ=255) cccTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTcc > 8:370452/1‑149 (MQ=255) cTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGt < 4:48910/149‑1 (MQ=255) | AGCACTTCGCAAACCTGCACACGTTGCGGCGCTATCGTGCATGCACGCCGGCCGAACAGTATCGTGCGCACCTGGGCGTTGCTGATTGCGGCGTCGATCCTCTACATCCCGGCCAACATACTGCCGATCAT‑GACCGTGAGTACCCTCGGTCAGGGTAGCCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGT > NC_002947/703977‑704269 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |