| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 859,283 | A→T | 5.3% | L144Q (CTG→CAG) | PP_0740 ← | MerR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 859,283 | 0 | A | T | 5.3% | 222.3 / 2.3 | 76 | L144Q (CTG→CAG) | PP_0740 | MerR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/35); new base T (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.15e-01 | |||||||||||
GCCAGGCGCACAACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCGGCGATG > NC_002947/859137‑859429 | gCCAGGCGCACAACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGc < 3:284125/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCACAACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGcc > 4:339896/1‑148 (MQ=255) gcgcACAACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGc > 6:135156/1‑149 (MQ=255) cacaACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGtt < 1:98637/149‑1 (MQ=255) cacaACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCACAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGtt > 3:286118/1‑149 (MQ=255) aaCCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGaa < 1:245291/149‑1 (MQ=255) aaCCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGaa < 5:181390/149‑1 (MQ=255) ccATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAg > 3:303781/1‑148 (MQ=255) gCTGAACGTCCGATCGCTGTCTTCTGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCACCAGCTGGTTGTCGTCGAACACGCTCGCACCGAGCTTTCTCCGCATCCACCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGGTGAACTAATTGCGCCAgc > 6:25390/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAgcg > 4:86528/1‑148 (MQ=255) ggTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGt < 5:135156/149‑1 (MQ=255) gTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTc > 1:130011/1‑149 (MQ=255) cGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAg > 6:58413/1‑149 (MQ=255) gTTCGCTGTCTTCTGCCAGCAACACGGCATGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCATCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGc < 5:269415/149‑1 (MQ=255) gCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGt < 2:134377/149‑1 (MQ=255) tGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAg < 8:225952/142‑1 (MQ=255) tGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAg > 7:225952/1‑142 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCgagg < 3:36189/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCgag > 4:371812/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCgag > 3:140372/1‑147 (MQ=255) gCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCgg < 2:360628/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGgc < 8:270753/149‑1 (MQ=255) aGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAACAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGgcag > 8:219833/1‑149 (MQ=255) cAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGgcagca < 5:104216/149‑1 (MQ=255) acacGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGgcagcag > 1:59918/1‑148 (MQ=255) cacGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGAGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGgcagcagc > 6:287786/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTg > 2:101958/1‑149 (MQ=255) ccTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCTGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCgag < 7:261992/125‑1 (MQ=255) ccTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCTGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCgag > 8:261992/1‑125 (MQ=255) cagcagCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAgg < 8:530/148‑1 (MQ=255) cagcagCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAgg < 5:25390/148‑1 (MQ=255) agcagcTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGt < 5:58413/149‑1 (MQ=255) agcTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCTCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGAc < 4:286118/149‑1 (MQ=255) gcTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGAcc > 7:187238/1‑149 (MQ=255) gTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGAccgccg > 3:47904/1‑149 (MQ=255) ttGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCgg > 8:78092/1‑149 (MQ=255) gTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCggg < 4:338996/148‑1 (MQ=255) gTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCggg < 3:371812/148‑1 (MQ=255) tCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGGGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTa > 4:138806/1‑149 (MQ=255) gTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTAc < 2:52033/148‑1 (MQ=255) ggTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAgc > 6:282338/1‑149 (MQ=255) gTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGCTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAgcg > 3:182082/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATg > 3:283776/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAACACACCTGCTCCCGCCGAGCGTGGAAGTAATTGCGCCAGCGCCGGTCGAGCAGGTCGAGGCGCGGCAGCCGCAA‑TTGCTCGCCCAGGGTGCCCGCCGGGGACAGCGCCATGGCCAGGt > 3:11250/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGaa > 4:113581/1‑57 (MQ=255) ccGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGtt < 3:85027/149‑1 (MQ=255) cGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCTGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGTCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAgc < 2:55373/134‑1 (MQ=255) cGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCTGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGTCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAgc > 1:55373/1‑134 (MQ=255) gAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTACTTGCCCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGTCAGCAGCAA‑TTGCTCTCACAGGGTGACCGCCTGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGa < 8:1605/149‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCt > 5:118459/1‑149 (MQ=255) ctgcGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAACCTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCt < 1:101958/149‑1 (MQ=255) ctgcGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCt < 5:32510/148‑1 (MQ=255) cagccagcTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTc > 1:231861/1‑147 (MQ=255) gccagcTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAgg < 4:303781/149‑1 (MQ=255) cagcTGTGAAAAACCCCCTGCGCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATAGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATCTCGAGGAGCGGCAGCAGCAC‑TTGCGCGCACAGGGGGACCGCCGGGTACAGCGCCCTGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgc < 6:118459/149‑1 (MQ=255) cagcTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgc < 8:187238/149‑1 (MQ=255) agcTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgcg < 4:140372/149‑1 (MQ=255) cTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgcgcg > 3:127821/1‑149 (MQ=255) tgtgAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgcgcgc > 1:356663/1‑149 (MQ=255) tgtgAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGgcgcgc > 8:317243/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCATCAA‑TTGCTAGCACAGGGTGACCGCCTGGTACAGCGCCATGGCCTTGGTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCtgg > 4:252908/1‑147 (MQ=255) aaaaaaCACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCtgt < 8:122395/148‑1 (MQ=255) aaaaaCACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCtgtg > 4:48074/1‑148 (MQ=255) aaaaCACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCACCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGaa < 3:335186/149‑1 (MQ=255) acCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGcc > 7:276561/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCg < 3:86528/149‑1 (MQ=255) cTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCgg > 2:47902/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCgg > 4:389120/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCgg < 5:287786/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCGAGCTCAGTTCGAGAATGTCGAGGATCGGCAGGAGTAA‑TTGCTCGCACAGTGTGACCGACGGGTACAGCGGCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGTCGAGCTGTGAAAGGGCGGCGAt < 4:182082/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCGGCGAt > 4:365264/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCGGCGATg < 7:78092/149‑1 (MQ=255) cAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCtgtg > 6:49603/1‑134 (MQ=255) cAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGaaa > 2:384314/1‑137 (MQ=255) cAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGaaa < 1:384314/137‑1 (MQ=255) cAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGGCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCtgtg < 5:49603/134‑1 (MQ=255) | GCCAGGCGCACAACCATAAGTCCGGGCTGAAGGTGCGTTCGCTGTCTTCGGCCAGCAACACGGCAGGCCCTTGCAGCAGCTGGTTGTCGTGGTACACGCGGGCACCGAGCTTGCTGCGCAGCCAGCTGTGAAAAAACACCTGCTCCAGCCGAGCGTTGAAGTAATTGCGCCAGCGCAGGTCGAGCATGTCGAGGAGCGGCAGCAGCAA‑TTGCTCGCACAGGGTGACCGCCGGGTACAGCGCCATGGCCTGGTTGAGTTGCTGGTCGAGGGCGCGCTGTGAAAGGCCGGCGATG > NC_002947/859137‑859429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |