| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 907,406 | T→A | 5.7% | intergenic (+17/+28) | PP_0790 → / ← yjjV | inner membrane protein AmpE/putative hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 907,406 | 0 | T | A | 5.7% | 211.3 / 2.2 | 70 | intergenic (+17/+28) | PP_0790/yjjV | inner membrane protein AmpE/putative hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/34); new base A (2/2); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
CCGATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCGGGCTGTTGC > NC_002947/907262‑907552 | ccGATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCTAATCGCATCCCa > 1:313923/1‑149 (MQ=255) cGATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCAc < 4:229830/149‑1 (MQ=255) gATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCAcg > 7:181645/1‑149 (MQ=255) gATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCAcg > 6:397376/1‑149 (MQ=255) aTGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTATGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTCGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCAGAcgc > 4:301575/1‑149 (MQ=255) ttCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCTAATCGCATCCCACGCGAATcc < 2:313923/149‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGAGTACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCgg < 3:301575/149‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCgg > 8:304089/1‑149 (MQ=255) aagaagAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCa > 8:191933/1‑149 (MQ=255) agaagaGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCAc < 2:2837/149‑1 (MQ=255) ggACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGc < 7:191933/149‑1 (MQ=255) agccagcGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGATCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGc < 5:32900/145‑1 (MQ=255) agccagcGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGATCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGc > 6:32900/1‑145 (MQ=255) cccgcgcGGTTGGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCAcc < 6:111174/146‑1 (MQ=255) gcgGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGcc > 3:315955/1‑148 (MQ=255) ggggCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACg > 7:21771/1‑149 (MQ=255) ggcTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGc > 3:151662/1‑147 (MQ=255) tGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCa > 4:210101/1‑149 (MQ=255) gACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCAt < 6:136377/148‑1 (MQ=255) 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tgTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGc > 5:193220/1‑148 (MQ=255) cgcTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCAc > 5:214002/1‑149 (MQ=255) cgcTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCACAGGCCAGCAc < 7:304089/149‑1 (MQ=255) cTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCAGGTGCTGGCACAGGCCAGCAccc < 6:28175/149‑2 (MQ=255) tgtgCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTc > 7:102284/1‑149 (MQ=255) tgtgCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATACGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTc < 8:337546/149‑1 (MQ=255) tgCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCg < 4:260917/148‑1 (MQ=255) tgtgGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGc < 8:3309/130‑1 (MQ=255) tgtgGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGc > 7:3309/1‑130 (MQ=255) tgtgGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGc > 6:307962/1‑149 (MQ=255) gtgGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGcc > 7:65130/1‑149 (MQ=255) ccGGATTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCg > 4:94546/1‑106 (MQ=255) ccGGATTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCg < 3:94546/106‑1 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt < 3:347005/149‑1 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt > 3:237328/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt > 7:349965/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTAACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt < 3:22933/149‑1 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCAACCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt > 1:207690/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCAACCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGt > 1:201325/1‑149 (MQ=255) gggTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTg < 8:181645/149‑1 (MQ=255) ggTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTgc < 7:8695/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCaa > 3:251676/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTGGGCCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAg < 3:347809/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTGGGCCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAg < 5:316280/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCaa < 4:151662/148‑1 (MQ=255) gcgcTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAg > 7:18577/1‑149 (MQ=255) cTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTg < 5:107511/102‑1 (MQ=255) cTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTg > 6:107511/1‑102 (MQ=255) gACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCAACCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTgg < 2:207690/149‑1 (MQ=255) gACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCAACCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTgg < 2:201325/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTGGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTg < 6:368431/145‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTg > 5:368431/1‑145 (MQ=255) cGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCaa > 7:261334/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAAttt > 5:247621/1‑149 (MQ=255) cTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTc < 5:397376/149‑1 (MQ=255) gTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACg > 2:199952/1‑67 (MQ=255) gTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACg < 1:199952/67‑1 (MQ=255) gTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCgg > 5:94763/1‑149 (MQ=255) tCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCTgg > 5:59053/1‑148 (MQ=255) tCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGc < 8:102284/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGAt < 1:113513/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGAt > 2:127591/1‑149 (MQ=255) gCCAATCGCATCCCCCGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCgg < 4:237328/149‑1 (MQ=255) gCCAATCGAATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTGCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCgg < 4:155903/149‑1 (MQ=255) gCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCGGGCTGtt < 6:247621/148‑1 (MQ=255) cATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCGGGCTGTTGc < 6:193220/149‑1 (MQ=255) | CCGATGACATTCCCGAAGAAGAGGACAGCCAGCGCGGTTTGGGGCGGCTGGACAGTCTGTGGGAACTGCTGTTGCGCTGTGCAGTGCTGTGGTATGCCGGGTTCGCGCTGTGGACCGTGCTGGTCTGATTCGGGGCCAATCGCATCCCACGCGAATCCCGGTCACCCGAGCTTCACCAGCCGAACAACGTGCAAGCATTGCGGGTGCTGGCCTGTGCCAGCACCTCGACATCCAGCCCCATCACGTGCGCAAGCGCCGTGGCAATTTCCGGCAGATGCTCCGGGCTGTTGC > NC_002947/907262‑907552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |