| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 911,786 | T→C | 7.5% | L765S (TTG→TCG) | fruB → | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 911,786 | 0 | T | C | 7.5% | 185.9 / 2.6 | 67 | L765S (TTG→TCG) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/30); new base C (2/3); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGCTGGTGGTGCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTATGG > NC_002947/911638‑911926 | ccGCTGGTGGTGCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGtt > 8:8138/1‑149 (MQ=255)ccGCTGGTGGTGCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGtt > 6:247877/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGTGCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTtgc > 3:195698/1‑149 (MQ=255) gggtgCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTTCCGAGGAAAATGCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGTCCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCgg < 4:379290/148‑1 (MQ=255) gtgCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCCGTTGCGCGCGTTGCTGCGGgc > 8:193801/1‑149 (MQ=255) gtgCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGgc < 2:259635/149‑1 (MQ=255) gcgcACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCTTGCGAGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGgccg > 4:53496/1‑149 (MQ=255) cgcACCCTGGATGTGGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGgccgc < 6:181252/149‑1 (MQ=255) cACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGccgccg > 5:288775/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGa > 4:167281/1‑149 (MQ=255) cccTTGATGTTGTCTGCGACAAAGCGGAGCCTTACTGGACGATGGATGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCGGCGGGCCGCCGAc < 7:169263/149‑1 (MQ=255) cccTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGAc < 5:247877/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTTTGCGGCGTCAAACCGTTTCCTTTCTGGCCGATCGCTGCCTAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGGGTGCGTTTGCCCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGAc < 7:174378/148‑1 (MQ=255) cTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGAc > 5:180425/1‑147 (MQ=255) tGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTAGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGcc > 4:137436/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGt > 8:289807/1‑149 (MQ=255) cggcgACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGc < 8:222137/149‑1 (MQ=255) ggcgACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCg < 5:334899/149‑1 (MQ=255) gACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTAt < 7:289807/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGtt > 2:160064/1‑149 (MQ=255) cGTTGACTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAACTCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGCAAGACCAGTTGAGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCTACCAGCGCCAGTGGCGTATCATGTTc > 4:18011/1‑149 (MQ=255) cTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATg > 8:157807/1‑149 (MQ=255) cTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATg > 1:259470/1‑149 (MQ=255) ttACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATgg > 5:19043/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGtt > 4:372499/1‑149 (MQ=255) tGGCCGATCGCTTCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTCGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTgg > 4:146978/1‑149 (MQ=255) tGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCATCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTCGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTgg > 4:141213/1‑149 (MQ=255) cGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGTCCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTcc < 1:262746/135‑1 (MQ=255) cGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGTCCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTcc > 2:262746/1‑135 (MQ=255) aTCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGt < 1:160064/149‑1 (MQ=255) aGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATgg > 3:72021/1‑149 (MQ=255) ggAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGc < 2:21103/149‑1 (MQ=255) ggAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGc < 5:310668/149‑1 (MQ=255) aaaaTCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGt > 5:123514/1‑149 (MQ=255) aaaTCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTg < 1:138866/149‑1 (MQ=255) aaTCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGa < 7:303156/149‑1 (MQ=255) aTCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAg < 6:180425/149‑1 (MQ=255) cccTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGgc > 5:126865/1‑149 (MQ=255) cTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGgcgc > 7:116162/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCGGGTGCACGAATGGCGTGAGGcgcg > 5:361957/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGc < 4:72021/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATg < 3:346165/133‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATg > 4:346165/1‑133 (MQ=255) tGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCAtggtg < 8:299211/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCAtggtg < 6:288775/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTCGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGa < 3:137436/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAgcgc < 3:167281/149‑1 (MQ=255) ggcccGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGcc < 5:228412/145‑1 (MQ=255) gCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGc > 1:129332/1‑149 (MQ=255) gTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGa > 6:223055/1‑139 (MQ=255) gTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGa < 5:223055/139‑1 (MQ=255) gTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGAGCGCCTTGCTCCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCCTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCTCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGt > 8:102545/1‑149 (MQ=255) tttGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTg > 7:318881/1‑149 (MQ=255) gACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCCTGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGTGCCTGCGTGCa < 3:53496/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAg < 6:123514/148‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGaaa > 4:220852/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGaaa > 8:79076/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGAGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGAGCACGAATGGCGTGAGGCGAGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATc > 7:183201/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATcc < 8:318881/148‑1 (MQ=255) gcgcCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCgg < 3:372499/149‑1 (MQ=255) ccGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGc > 4:190394/1‑149 (MQ=255) ggAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAAt > 8:220840/1‑149 (MQ=255) gAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAAtt < 6:19043/149‑1 (MQ=255) aGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTgg < 8:116162/149‑1 (MQ=255) aGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGGTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTgg > 1:106931/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTggg > 5:75555/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCTCGTCGCTGCGGGCCGCCGAACAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGATGCGCTGGCCATGGTGGAGCGCCTTCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTa < 3:146978/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTa > 1:358904/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCGCGTCGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCGGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTa < 3:141213/149‑1 (MQ=255) cgcgcgTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTATgg < 7:193801/148‑1 (MQ=255) | CCGCTGGTGGTGCGCACCCTGGATGTTGGCGGCGACAAACCGTTGCCTTACTGGCCGATCGCTGCCGAGGAAAATCCCTTCCTCGGCGTGCGCGGTGTGCGTTTGACCCTGCAGCGCCCGCAAGTGATGGAAGACCAGTTGCGCGCGTTGCTGCGGGCCGCCGACCAGCGCCCGTTGCGTATCATGTTCCCCATGGTTGGCCAGGTGCACGAATGGCGTGAGGCGCGGGCCATGGTGGAGCGCCTGCGTGCAGAAATCCCGGTAGCCGACCTGCAATTGGGCATTATGG > NC_002947/911638‑911926 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |