Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,048,573 | C→A | 6.7% | V343F (GTC→TTC) | PP_0907 ← | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,048,573 | 0 | C | A | 6.7% | 226.0 / 4.2 | 72 | V343F (GTC→TTC) | PP_0907 | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/36); new base A (2/3); total (33/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
CGTTGTCCTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGGCAGCAGAATC > NC_002947/1048426‑1048721 | cGTTGTCCTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGAc > 7:348879/1‑148 (MQ=255) ttGTCCTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGTCAGCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCACTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGAc > 1:314658/1‑148 (MQ=255) cTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTggg > 7:224397/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTggg > 2:114611/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTC‑TTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTggg < 2:266933/148‑1 (MQ=255) gCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGtt > 5:319131/1‑149 (MQ=255) ccTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTg < 4:65313/149‑1 (MQ=255) cTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGCGGTAgg > 5:356586/1‑149 (MQ=255) tATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGc > 4:382910/1‑149 (MQ=255) tGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGccc < 5:24285/149‑1 (MQ=255) tGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGccc < 3:268842/149‑1 (MQ=255) tGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGcc < 6:319131/148‑1 (MQ=255) gTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTg < 8:224397/149‑1 (MQ=255) ttGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTgtc < 8:235695/148‑1 (MQ=255) cACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTa > 6:14837/1‑148 (MQ=255) ccGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTacac < 4:373567/149‑1 (MQ=255) gggTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCg > 2:22927/1‑149 (MQ=255) tttCAGCTGCCCGGCGGTGCCCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTgtc > 5:325566/1‑129 (MQ=255) tttCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTgtc > 5:320193/1‑129 (MQ=255) tttCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTgtc < 6:325566/129‑1 (MQ=255) tttCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGGCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTgtc < 6:320193/129‑1 (MQ=255) tCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATcc > 7:271441/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATcc < 8:156140/148‑1 (MQ=255) cAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCt > 1:258282/1‑149 (MQ=255) aGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCtt < 5:39424/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGt < 1:341908/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTg > 8:14041/1‑137 (MQ=255) gCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTg < 7:14041/137‑1 (MQ=255) cccGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTc < 1:135040/147‑1 (MQ=255) ggTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCg < 5:14837/149‑1 (MQ=255) tGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGt < 3:158053/149‑1 (MQ=255) gACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGTGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGCCCAGCTGGGGTTGGTCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCCTCCTTGTCCTTTCTCGGt > 6:188398/1‑148 (MQ=255) accaccTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTg < 8:271441/148‑1 (MQ=255) caccTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAgg > 4:353308/1‑149 (MQ=255) t‑‑tCCCCGGCCTGCAGGCCTTCTCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACa < 2:133044/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATc < 5:369037/120‑1 (MQ=255) cccGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATc > 6:369037/1‑120 (MQ=255) tGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCtt > 3:271266/1‑116 (MQ=255) tGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCtt < 4:271266/116‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCCGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGAACAGCTGGGGTTGGCACTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGtt < 5:275068/147‑1 (MQ=255) ggCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTTCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCa < 2:314658/149‑1 (MQ=255) aCAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAgg > 6:162962/1‑148 (MQ=255) cAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGtt > 3:17969/1‑130 (MQ=255) cAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGtt < 4:17969/130‑1 (MQ=255) cAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAgg < 8:111381/147‑1 (MQ=255) cAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAgg < 1:114611/147‑1 (MQ=255) cAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGt > 8:287199/1‑148 (MQ=255) aaCCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTaa > 2:78955/1‑149 (MQ=255) aaCCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCAATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTaa > 5:35010/1‑149 (MQ=255) ccACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATg > 4:358586/1‑149 (MQ=255) cACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATgg < 5:151723/149‑1 (MQ=255) tcGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCg > 5:21608/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATTCAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGc < 1:22927/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTcc < 3:382910/146‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCAAAAATTGTACTTTATAGGTGAGGCGAAATAAACCGAGTTGACAAAAAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTACGGc > 8:248635/1‑149 (MQ=255) gcTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGcac > 4:106023/1‑148 (MQ=255) tCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGc > 7:68750/1‑149 (MQ=255) tttACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGCGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCgg > 7:176416/1‑149 (MQ=255) tACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCgg < 7:248635/147‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGc > 7:12491/1‑149 (MQ=255) gTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCgg > 4:193961/1‑149 (MQ=255) gTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCgg < 3:353308/149‑1 (MQ=255) cccagcTGGTCGCCGAACAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAg > 4:318969/5‑111 (MQ=255) cccagcTGGTCGCCGAACAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAg < 3:318969/107‑1 (MQ=255) tGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCggg < 7:287199/149‑1 (MQ=255) cagcTGGTCGCCGAACAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGt > 5:330674/3‑149 (MQ=255) gcTGGTCGCCGAACAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTg < 6:330674/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACa < 2:87668/98‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACa > 1:87668/1‑98 (MQ=255) tCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGgcag > 3:66839/1‑149 (MQ=255) cGGCGACCAGCTTGGGTTGGCCCTTGTCTTCCTACACCGCTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGATTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGgcag < 6:356586/148‑1 (MQ=255) cGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGgcag < 3:193961/148‑1 (MQ=255) ggCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGgcagca < 6:35010/149‑1 (MQ=255) gACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGGCAGCAGaa < 1:78955/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGGCAGCAGAATc < 3:358586/149‑1 (MQ=255) | CGTTGTCCTGGCCTATGCGTATTGCGGCACCGGGTGTGAGTTTCAGCTGCCCGGCGGTGACCACCTGT‑‑TCCCCGGCCTGCAGGCCTTCGCTGACTACAACCACGCCGTCTCGGCGCTCGCCAGTCTTTACCGTGCGCTGTTCGGCGACCAGCTGGGGTTGGCCCTTGTCGTCGTACACCGGTTTGCCATCCTTGTCCTTTCTCGGTGAGGCGACATACACCGAGTTGCCATACAGGGTGTAGGTAATGGCGCTTTCCGGCACCACCACTTGCGGCTGCGGGTTGGGCAGCAGAATC > NC_002947/1048426‑1048721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |