| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,183,456 | A→T | 7.4% | I310N (ATT→AAT) | mltF ← | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,183,456 | 0 | A | T | 7.4% | 193.4 / 5.5 | 68 | I310N (ATT→AAT) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/34); new base T (3/2); total (32/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
GTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGG > NC_002947/1183308‑1183602 | gTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCaa < 6:248156/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGc < 6:36926/147‑1 (MQ=255) cTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgc > 5:195435/1‑149 (MQ=255) ggATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc < 6:155724/149‑1 (MQ=255) ggATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACAAGCCCATGGCCTGGGAGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGTCTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc > 2:207362/1‑149 (MQ=255) gATGCTGTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc < 1:147214/148‑1 (MQ=255) gATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc < 6:5713/148‑1 (MQ=255) gATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc < 1:28159/148‑1 (MQ=255) aTGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCa < 1:220990/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGt < 3:27383/148‑1 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCt > 8:371224/1‑149 (MQ=255) gtCGGGGCCTGTCGGTTCGACACGCCCATGGCGTGGGCGGTGGGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGagcag < 6:263760/148‑5 (MQ=255) cAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCt > 8:202525/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCt > 8:208069/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGCTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCCCACGCCGGTCTTGCAGGCCACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGACTGCCAGCAGGCGCCATTCGACCTGCTCGACCt > 8:254211/1‑149 (MQ=255) aGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCtt > 8:192377/1‑149 (MQ=255) ggcGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 8:126453/147‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGAGCTTg < 2:147196/149‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 7:202525/149‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 7:208069/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca < 7:258792/119‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca > 8:258792/1‑119 (MQ=255) ggTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGc < 7:192377/148‑1 (MQ=255) ttCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGTTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCGAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGt < 5:165285/148‑1 (MQ=255) gACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGAc > 7:232555/1‑128 (MQ=255) gACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGAc < 8:232555/128‑1 (MQ=255) gACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGct > 5:313946/1‑149 (MQ=255) acGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCtt > 4:150902/1‑149 (MQ=255) gCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGa < 7:371224/149‑1 (MQ=255) cccATGGACTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGaa < 6:55229/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACATGATCGACCATGGCGTAGATATTGaatt > 6:269423/1‑147 (MQ=255) tGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGc < 6:195435/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACtt < 7:340617/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGgc > 3:96402/1‑149 (MQ=255) catcatCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCACGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGtt > 1:128417/1‑149 (MQ=255) tcatcaGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGc < 6:313946/149‑1 (MQ=255) atcaGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATGGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAg > 5:301518/1‑149 (MQ=255) atcaGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAg > 2:242575/1‑149 (MQ=255) cGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAg < 8:82931/149‑1 (MQ=255) tCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAg < 4:345546/149‑1 (MQ=255) aCTTCCGGCTGCCACATCTATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCTACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATa < 7:254211/149‑1 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGc > 1:128752/1‑149 (MQ=255) cGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCaa < 6:301518/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGACAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGCCCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGATGGTGTAGGCGGCGACATAGcc > 4:142748/1‑147 (MQ=255) gcacaTCGATTACTGGTAGAAAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGAACTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTAAAGTGCTTCTCGTACTTTGGCAGGCGCTGTTGCTGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACga > 4:210/2‑148 (MQ=255) cacaTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGCACGTc > 6:255277/1‑149 (MQ=255) caTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGa > 3:221763/1‑149 (MQ=255) aTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGa > 4:214389/1‑148 (MQ=255) cGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGgtg > 7:261249/1‑118 (MQ=255) cGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGgtg < 8:261249/118‑1 (MQ=255) cGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACAt > 2:196497/1‑149 (MQ=255) cGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACAt < 1:253869/149‑1 (MQ=255) gcctgcTGGCAGCCATTGGCTACCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATg > 5:42652/6‑149 (MQ=255) aTTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGGCATgg < 1:207362/149‑1 (MQ=255) ctgcTGGCAGCCATTGGCTACCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCGTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGc > 4:11085/4‑149 (MQ=255) tCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCg > 7:344219/1‑108 (MQ=255) tCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCg < 8:344219/108‑1 (MQ=255) cTGGTAGCCAATGGCTTCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGctg < 3:150902/148‑3 (MQ=255) cTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCg > 5:288863/1‑148 (MQ=255) tGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCg > 3:33040/1‑147 (MQ=255) gTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtag > 8:53626/1‑148 (MQ=255) tAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtagta < 1:242575/149‑1 (MQ=255) tAGCCAATGGCTGACAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTTGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtagta < 5:269423/149‑1 (MQ=255) aaGCCAATGGCTTCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAATTTCTTCTCGTACTTGGGCAGGCTCTGTTGCAGGTGGTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtagta < 3:210/148‑1 (MQ=255) aGCCATTGGCTACCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGtagtag < 3:11085/149‑1 (MQ=255) aGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGgcgc < 6:276483/114‑1 (MQ=255) aGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGgcgc > 5:276483/1‑114 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCg < 2:128417/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCgg > 1:267366/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCa < 8:265473/85‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCa > 7:265473/1‑85 (MQ=255) | GTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGG > NC_002947/1183308‑1183602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |