| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,414,212 | C→G | 10.5% | S86T (AGC→ACC) ‡ | PP_1236 ← | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,414,212 | 0 | C | G | 10.5% | 266.0 / 19.6 | 95 | S86T (AGC→ACC) ‡ | PP_1236 | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/38); new base G (4/6); total (51/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.26e-01 | |||||||||||
CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACC > NC_002947/1414064‑1414358 | cgcCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCgcgc > 6:266327/1‑149 (MQ=255) cAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGc < 4:332574/149‑1 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCg > 5:228542/1‑149 (MQ=255) ggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCgg > 8:96768/1‑149 (MQ=255) ggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑cc < 7:288891/148‑1 (MQ=255) ggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCa < 3:84269/149‑1 (MQ=255) ggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCa < 3:115519/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCAc > 7:49244/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCAc < 6:104962/149‑1 (MQ=255) tgtCGCATGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGTTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCTCGTAGGCCACATACGGAAGGGGCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCagg < 6:287112/149‑3 (MQ=255) tCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGCTGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTc < 4:287495/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCaggaa < 5:331073/149‑5 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGa < 1:288285/149‑1 (MQ=255) aGGGCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAgg < 5:326354/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCGACATACGGAAGGGCCTGCTGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAgg > 5:204587/1‑149 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGt < 3:351777/144‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGt > 4:351777/1‑144 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCaggaag < 6:201366/139‑6 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCAGCGCGGA‑CCaggaag > 5:201366/1‑134 (MQ=255) tCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTg > 7:47085/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGTA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGct > 6:319037/1‑149 (MQ=255) gCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttc > 2:303072/1‑149 (MQ=255) gCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttc < 4:374218/149‑1 (MQ=255) tCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttctt > 1:160514/1‑149 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttctt < 5:143145/147‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttctt < 6:89772/147‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTg < 5:112109/148‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGc < 5:266327/149‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGc < 1:306787/149‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGGCAAGGAACAACTGGACCAGCGCGTTGATGATGTCCGGGCGGAAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGc < 4:216869/149‑1 (MQ=255) tggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGcc < 8:303367/149‑1 (MQ=255) gtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg > 7:347129/1‑149 (MQ=255) gtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCCGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg > 5:337136/1‑149 (MQ=255) aGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGAGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 8:306200/1‑149 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCg > 7:210751/1‑103 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCg < 8:210751/103‑1 (MQ=255) aagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 6:228542/149‑1 (MQ=255) aagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 4:261186/149‑1 (MQ=255) aagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 1:331366/149‑1 (MQ=255) agaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTg > 5:121912/1‑149 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCga < 7:96768/149‑1 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgaga < 8:47085/149‑1 (MQ=255) aGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACg > 6:25305/1‑149 (MQ=255) cgttttggatgGCGGGGGGTTAGGAATCGCTCACGTCGGCAACATACGCATGGCCCTGCGGGGGCACTTCC‑TGGTCCGCGCGGCGCA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCACAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGc < 8:333632/141‑1 (MQ=255) gTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGTA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGc < 5:319037/147‑1 (MQ=255) gTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGc > 5:179606/1‑147 (MQ=255) gatgatGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAggg > 5:372398/1‑149 (MQ=255) gatgatGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAggg > 7:339540/1‑149 (MQ=255) gatgatGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAAACGTGCCAggg > 2:232762/1‑149 (MQ=255) atgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGc < 5:25305/149‑1 (MQ=255) tgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg > 1:253576/1‑120 (MQ=255) tgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg < 2:253576/120‑1 (MQ=255) tgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCAAGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCTCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTAAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCg > 6:146786/1‑149 (MQ=255) gatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGt > 6:44142/1‑149 (MQ=255) gatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTATTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGAGTCGAGACGTGCCAGGGCGt > 6:38486/1‑149 (MQ=255) tCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTcc > 8:82972/1‑147 (MQ=255) ggCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTg > 2:126647/1‑149 (MQ=255) gCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGGCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTgc < 2:160514/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCAGCCCTCCCGTCGGCCACATAGGTACGGGCCGGCGGGCGCACTTCC‑TGGGCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTgcc < 4:234366/148‑1 (MQ=255) ggTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACCTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTgcc > 3:234366/1‑148 (MQ=255) gcTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTg > 1:327156/1‑147 (MQ=255) tCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCGTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCCCCTgcagc > 7:249141/1‑149 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 7:146460/101‑1 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt > 8:146460/1‑101 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgaga > 4:22773/1‑111 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAc > 1:29133/1‑149 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAc < 1:303072/149‑1 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAc > 6:165666/1‑149 (MQ=255) cgtcgcccACATCCGGACGGGCCGGGGGGCGCACTACC‑TGGGCCGCGCGGCGTA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAcc < 8:313459/143‑1 (MQ=255) cacaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGgcgc > 4:383235/1‑149 (MQ=255) acaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgcag < 7:102338/137‑1 (MQ=255) acaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgcag > 8:102338/1‑137 (MQ=255) caTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTg < 3:172414/149‑1 (MQ=255) caTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTg > 2:206226/1‑149 (MQ=255) aTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTTGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTg > 1:29267/1‑149 (MQ=255) aCGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 8:155131/88‑1 (MQ=255) aCGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt > 7:155131/1‑88 (MQ=255) ggCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGt > 2:373518/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTg > 7:152994/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTg > 1:80956/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGACCCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 2:80956/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 2:82935/148‑1 (MQ=255) cGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 7:82972/148‑1 (MQ=255) gcACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAgg > 8:123809/1‑149 (MQ=255) aCTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGgcg > 2:129787/1‑149 (MQ=255) tcgacgtGGTCCGCAGCGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAAGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGgcg > 1:269217/7‑149 (MQ=255) cgtGGTCCGCAGCGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgc < 2:239522/105‑1 (MQ=255) cgtGGTCCGCAGCGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgc > 1:239522/3‑107 (MQ=255) c‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg < 7:306200/148‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGTGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 5:261406/1‑149 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 6:291262/1‑149 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 1:387885/1‑149 (MQ=255) tGGTCCGCAGCGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 1:144117/1‑149 (MQ=255) ggTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGCCGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCCCCTGCAGCCCCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 4:213517/1‑148 (MQ=255) gTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt > 5:324452/1‑147 (MQ=255) tCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGac < 1:206226/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 4:302866/1‑140 (MQ=255) gcgcTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa < 3:302866/140‑1 (MQ=255) ctcTGCGGA‑CCACTTCGAGGGTCATGCCCTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGTATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCTTTGATGCTCAGGCTCGAGGTGaccacc < 6:337483/147‑1 (MQ=255) | CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCC‑TGGTCCGCGCTGCGGA‑CCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACC > NC_002947/1414064‑1414358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |