Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,449,365 | C→G | 7.4% | R106T (AGG→ACG) | yhaV ← | toxin antitoxin system SohB(PrlF)‑YhaV toxin endoribonuclease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,449,365 | 0 | C | G | 7.4% | 199.0 / 6.8 | 68 | R106T (AGG→ACG) | yhaV | toxin antitoxin system SohB(PrlF)‑YhaV toxin endoribonuclease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/28); new base G (3/2); total (38/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.93e-01 |
ATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCG > NC_002947/1449217‑1449513 | aTCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATcc > 8:100714/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGCAGCATCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGATAGACTCGTAATTGATCCAGGCCAGCCCGATGATCct > 6:360369/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCctg < 7:100714/146‑1 (MQ=255) ccTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGgtg > 1:212766/1‑149 (MQ=255) gcagcaACTGGTCCCACTCGTCCGGGTGGTTGCCGCTATGCAACTTCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTgg < 2:395236/146‑1 (MQ=255) cagcaACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATTGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGc < 4:125115/149‑1 (MQ=255) cagcaACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGc < 1:214969/149‑1 (MQ=255) aaCTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGgaa < 4:133814/149‑1 (MQ=255) aaCTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGgaa < 1:8315/149‑1 (MQ=255) gTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGaac > 6:32081/1‑148 (MQ=255) cccAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGaacaac > 6:41577/1‑149 (MQ=255) aTCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCgg > 7:186314/1‑148 (MQ=255) tCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTActg < 5:209501/149‑1 (MQ=255) tCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTActg > 7:133314/1‑149 (MQ=255) tCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTActg < 8:186314/149‑1 (MQ=255) acGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCTCTACTTTCATATGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGgaatatct < 5:360369/147‑6 (MQ=255) tGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGctct < 4:135996/149‑1 (MQ=255) cAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTg > 5:177184/1‑148 (MQ=255) aaCATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGaa > 2:391463/1‑149 (MQ=255) ttttGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACCGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTg > 8:9874/1‑149 (MQ=255) tttGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGc > 6:201790/1‑149 (MQ=255) aaaGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCAGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTtgt > 6:161587/1‑149 (MQ=255) cTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACCGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCAc < 7:9874/149‑1 (MQ=255) tAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGcc < 5:41577/149‑1 (MQ=255) tAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGc > 7:26894/1‑148 (MQ=255) aaGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGcc > 1:221745/1‑148 (MQ=255) aaGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGGGAGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGcc > 7:249941/1‑148 (MQ=255) aGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGcc > 8:354923/1‑147 (MQ=255) aTCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAg‑tg > 1:4110/1‑149 (MQ=255) gtcgCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTg < 8:133314/149‑1 (MQ=255) tcgCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGc < 5:32081/149‑1 (MQ=255) cTACTTTCATAGGCCCGCGTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGcccc < 4:378030/149‑1 (MQ=255) tttCATAGGCCCGCTTGCTCGCCTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGc > 6:43539/1‑149 (MQ=255) tttCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACACCCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGc > 3:352362/1‑149 (MQ=255) tttCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGCAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGc > 2:181493/1‑149 (MQ=255) tCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGcc < 1:181493/148‑1 (MQ=255) aTAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCgg > 1:338379/1‑148 (MQ=255) ccGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCgg > 1:18631/1‑149 (MQ=255) gCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTgg > 3:282390/1‑149 (MQ=255) cTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCTGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGATTGTCGTCACCGCCAAG‑TGTTTCCCATTGACGGTATTCGGGTTTgg > 4:105515/1‑148 (MQ=255) gACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCgg > 1:197246/1‑149 (MQ=255) gACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCgg < 6:177184/149‑1 (MQ=255) gACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGCATTCGGGTGTGGTc < 2:338379/147‑1 (MQ=255) gTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTc < 7:354923/147‑1 (MQ=255) gTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCtt > 2:107084/1‑149 (MQ=255) tCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCtt > 3:26383/1‑148 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCgg < 3:82062/46‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCgg > 4:82062/1‑46 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGa < 4:26383/148‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAg < 8:26894/149‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAg < 2:4110/149‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAg > 7:260073/1‑149 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAg < 2:197246/149‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATACTGCTGGGGGCGTGGTATCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGACGAACTTTCCGCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAg < 8:266798/149‑1 (MQ=255) ttGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAgg > 7:19369/1‑149 (MQ=255) tGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAgg > 4:11743/1‑148 (MQ=255) aTCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGAt > 7:301556/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGAtt < 6:378893/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACAAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGAt > 6:18429/1‑148 (MQ=255) tCCAGGCCAGAACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTATGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCACTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGAt > 8:282166/1‑148 (MQ=255) acacccccAGCAGGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCgg > 4:351579/7‑126 (MQ=255) acacccccAGCAGGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCgg < 3:351579/120‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTa > 4:294246/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTa > 5:371506/1‑149 (MQ=255) ccccAGCAGGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACAt > 7:332943/3‑149 (MQ=255) cccAGCAGGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCgg < 1:37094/130‑1 (MQ=255) cccAGCAGGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCgg > 2:37094/2‑131 (MQ=255) gCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAAc < 1:391463/149‑1 (MQ=255) cGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGCTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGc < 1:107084/149‑1 (MQ=255) atgatCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCaa < 8:19369/149‑1 (MQ=255) tgatCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAAc > 2:70228/1‑149 (MQ=255) ctgctgGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAAccgccg > 8:285225/1‑149 (MQ=255) | ATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAAGACCTTGTAAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAG‑TGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCG > NC_002947/1449217‑1449513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |