| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,485,293 | G→C | 7.6% | W61S (TGG→TCG) ‡ | yhdY → | amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,485,293 | 0 | G | C | 7.6% | 224.1 / 6.3 | 76 | W61S (TGG→TCG) ‡ | yhdY | amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/30); new base C (3/3); total (43/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
CCACCGGTGAAAACCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGC > NC_002947/1485145‑1485440 | ccACCGGTGAAAACCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTg < 5:82784/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGAAAACCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTCAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTggg < 6:19700/149‑1 (MQ=255) tGAAAACCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGc < 8:257650/149‑1 (MQ=255) aaaaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcac > 3:313260/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGca < 4:209485/148‑1 (MQ=255) aaaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcacc < 4:209834/149‑1 (MQ=255) aaaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcac > 4:302199/1‑148 (MQ=255) aaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTTCCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcacca < 8:89438/149‑1 (MQ=255) aaCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcacca > 3:240656/1‑149 (MQ=255) aCCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGcaccac > 6:361744/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCAcgc > 1:13242/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACCCAGTTGGcatcgatc < 7:5932/149‑7 (MQ=255) ggCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTTCTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACgcgcgc > 1:354101/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGcc < 2:13242/149‑1 (MQ=255) tCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTg > 6:28155/1‑148 (MQ=255) tCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACCCAGTTGGcat > 2:21392/1‑132 (MQ=255) tCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACCCAGTTGGcat < 1:21392/133‑2 (MQ=255) gCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTTCTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCa < 2:354101/148‑1 (MQ=255) ggATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCaag > 3:133326/1‑149 (MQ=255) gATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCaagg < 8:366587/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCaaggaa < 5:361744/149‑1 (MQ=255) cGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCaaggaagg < 3:186763/149‑1 (MQ=255) gTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGgc > 2:57138/1‑149 (MQ=255) tGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACATGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGgcg > 1:347561/1‑149 (MQ=255) gCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCGCCAAGGAAGgcgc > 4:58745/1‑149 (MQ=255) aaTCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCctg > 1:327667/1‑149 (MQ=255) aTCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCctgc > 5:95842/1‑149 (MQ=255) gTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTggg > 1:219754/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCctgct < 6:11453/145‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACCCAGTTGGcatc < 8:4876/111‑3 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACCCAGTTGGcatc > 7:4876/1‑109 (MQ=255) ctcCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgtg < 5:28155/148‑1 (MQ=255) ctcCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGGTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgtgt > 2:229134/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCg > 3:291295/1‑149 (MQ=255) aGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGt < 4:261523/149‑1 (MQ=255) gCTTAACACGCTGTAGACCCTCTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTAACAGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGAGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTCTTCGAgcag > 2:54671/1‑148 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTgg < 4:217618/94‑1 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTgg > 3:217618/1‑94 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGcagcag > 6:264592/1‑149 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGcagcag > 6:346518/1‑149 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGcagcag > 7:28400/1‑149 (MQ=255) cacGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCt < 6:95842/149‑1 (MQ=255) cacGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCt > 6:139684/1‑149 (MQ=255) cacGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCt > 8:135440/1‑149 (MQ=255) tGACCATGTTCGCCATCTTCCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTTGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGAGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCa < 2:347561/148‑1 (MQ=255) gACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGt > 8:306306/1‑129 (MQ=255) gACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGt < 7:306306/129‑1 (MQ=255) cccTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTc < 2:327667/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTAATGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCa > 7:196401/1‑149 (MQ=255) cGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTAc < 4:291295/148‑1 (MQ=255) aCCTGGTCTGGCTGATCGTGCCGCAGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAAATTGGTTGGAACCACGCGCGCCTATTGCACCAAGCAACCCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGAACAGCTTTGGCCAGTTCAAGTACgg > 5:313845/1‑142 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAcc < 5:346518/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGAGCGTGCCGCCGTTACTGCAGGGGGGGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAc < 8:360713/148‑1 (MQ=255) ggTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATCTACGGTTATTACCCGa > 6:7876/1‑149 (MQ=255) gtgtGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGAc > 5:292502/1‑149 (MQ=255) gtgtGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGAc > 2:202691/1‑149 (MQ=255) tgtgGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACt < 5:264592/149‑1 (MQ=255) gCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGaa < 4:347637/148‑1 (MQ=255) gCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGaa < 7:204848/148‑1 (MQ=255) gCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGaa < 4:133326/148‑1 (MQ=255) tGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTg > 2:98527/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACt > 5:125295/1‑141 (MQ=255) aTCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACt < 6:125295/141‑1 (MQ=255) gccgTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCgtg < 1:98527/149‑1 (MQ=255) gTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTTGCCAGTTCTTGTTCGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTgg < 1:54671/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCgtgt < 4:313260/149‑1 (MQ=255) cGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTgg < 3:302199/149‑1 (MQ=255) gTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAccc < 4:50405/111‑1 (MQ=255) gTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAccc > 3:50405/1‑111 (MQ=255) tGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCtt > 5:217364/1‑149 (MQ=255) aTCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGc > 2:386627/1‑149 (MQ=255) gtGCCAACCCAGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTg > 7:23291/2‑149 (MQ=255) aaCTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGTAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCgg > 2:312231/1‑149 (MQ=255) aaCTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGTAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCgg > 2:307213/1‑149 (MQ=255) aCTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGgc > 7:333700/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGgcg > 7:258402/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCATGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGACAGTTCATGTACGGTTATTACACGACTGCACTGCGCTCGCGTGTGGACATGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTAGgcg > 1:141186/1‑149 (MQ=255) tGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGgcgc > 1:193681/1‑149 (MQ=255) | CCACCGGTGAAAACCGTCGGCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGC > NC_002947/1485145‑1485440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |