| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,580,735 | C→T | 12.4% | G221D (GGC→GAC) | ttgB ← | efflux pump membrane protein TtgB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,580,735 | 0 | C | T | 12.4% | 187.1 / 12.7 | 72 | G221D (GGC→GAC) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/31); new base T (4/5); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
GCCTACTTGGGCGACATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCAC > NC_002947/1580590‑1580879 | gCCTACTTGGGCGACATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGgtcg‑c < 3:72244/149‑1 (MQ=255) gcctGGGCGATGTCGCCCAAGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTAGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAg > 4:70780/4‑149 (MQ=255) gACATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCgg < 3:29280/149‑1 (MQ=255) cATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGaa < 4:96250/149‑1 (MQ=255) cATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGaa < 4:157569/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCgg > 6:164553/1‑146 (MQ=255) gCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGaca > 4:347046/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCACCTGTGCACCCGCTGTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGACCTGCTCGGCGGTTTGCACGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGGGCCCGGCAGGGCGGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACAcc < 8:113994/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGacagc > 8:211417/1‑147 (MQ=255) ccAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACAcc > 2:310623/1‑149 (MQ=255) ggCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTg > 2:281678/1‑148 (MQ=255) gcgcACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCa > 4:86711/1‑149 (MQ=255) gcACCTGTGAAGCGTCTTTGTTGAGCTGGAGCAGGATCGGCTCGACCTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGGCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCGGGAGGACACCTGCACg > 4:117309/1‑149 (MQ=255) ccTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTc > 3:381464/1‑149 (MQ=255) cTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCt > 5:110869/1‑149 (MQ=255) aCCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCGACCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCg < 1:64105/149‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGAGCgg < 3:186555/149‑1 (MQ=255) tCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGc > 7:244576/1‑114 (MQ=255) tCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGc < 8:244576/114‑1 (MQ=255) tgttgCCCTTGATCATGATACTCTGGAACTGCTCAGCTGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTGAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGTCAGGTGG‑CAGAGCTGGCCGGAAGACTCCTTCACGTTCTGTGCGGCCACAg < 3:349181/147‑1 (MQ=255) gttgACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCgg > 3:295858/1‑149 (MQ=255) gttgACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCACGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCgg > 7:255373/1‑149 (MQ=255) ttgACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGt > 5:389450/1‑149 (MQ=255) aCCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCAGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCtt > 5:208255/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGt > 5:299316/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGATACTCTCGAACAGCTCGGCGCTTAGCAGGCGGGTCTTCCCGATGATGGTGCCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCAAGTACTGTGCGGCCACAGCGGTCTAGACGt > 5:299317/1‑149 (MQ=255) ggATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGAcc < 5:125860/149‑1 (MQ=255) tACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGATGTCGACCggg < 3:347046/149‑1 (MQ=255) tACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCggg < 4:381464/149‑1 (MQ=255) tACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCggg < 4:295858/149‑1 (MQ=255) tctcGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGt > 6:342672/1‑148 (MQ=255) ggcggTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACtt < 5:342672/147‑1 (MQ=255) ggcggTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTAt > 4:222680/1‑149 (MQ=255) gcggTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTAtt < 6:208255/149‑1 (MQ=255) gcggTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTAtt < 1:310623/149‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGc > 6:179508/1‑149 (MQ=255) tttGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGc < 1:22583/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTg < 4:220898/148‑1 (MQ=255) gCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCg < 3:47912/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCg > 6:8894/1‑149 (MQ=255) gggTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGa > 3:192596/1‑149 (MQ=255) ggTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGAt < 3:70780/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATc > 3:149786/1‑148 (MQ=255) tCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATc > 3:204973/1‑148 (MQ=255) ttGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAg > 2:353127/1‑149 (MQ=255) gCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACAGCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGa < 7:211417/146‑1 (MQ=255) gCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGc < 8:255373/148‑1 (MQ=255) ccGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGcc < 6:389450/148‑1 (MQ=255) ccGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGcc < 5:46261/148‑1 (MQ=255) ccGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCa < 3:222680/149‑1 (MQ=255) gatgatGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGc > 3:184855/1‑145 (MQ=255) gatgatGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGa < 1:281678/149‑1 (MQ=255) tgatgGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATa < 6:182972/149‑1 (MQ=255) gttgCGTTGAGGTGGGTGCCCGGCAGGGCGGGCAGGCCG‑GCGAGCTGGCCGGTCGACACCTGCAGGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGAAGTCGACCGGGGTGAGGTGGTAGTTCTTCAGCTTGGCGGGATCGAGCCAGATActgat < 6:299317/146‑5 (MQ=255) gtggCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGGCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCAt < 6:299316/149‑1 (MQ=255) tggCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATg < 4:184855/149‑1 (MQ=255) tggCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATg > 2:206636/1‑149 (MQ=255) gCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATgg < 5:179508/148‑1 (MQ=255) gTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCg > 2:113114/1‑148 (MQ=255) gTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGt < 3:86711/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGAt > 6:263747/1‑137 (MQ=255) ttCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGAt < 5:263747/137‑1 (MQ=255) cAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTAc < 6:110869/148‑1 (MQ=255) aGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTg > 2:31082/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTgcg > 6:299014/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTgcg > 6:13075/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCAc < 3:189621/149‑1 (MQ=255) cccGGCAGGGCTGGCAGGTCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATTGCGTACTGCGCACCGaa < 3:117309/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGCCACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATCCGCATGGCGAACTGcgcaccgcacc > 6:396431/1‑148 (MQ=255) cAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCt > 5:164838/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCa > 6:144209/1‑149 (MQ=255) cAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCAc < 4:192596/149‑1 (MQ=255) cAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCAc > 4:48252/1‑149 (MQ=255) | GCCTACTTGGGCGACATCGCCCAGGCGCACCTGTGAACCGTCTTTGTTGACCTTGAGCAGGATACTCTCGAACTGCTCGGCGGTTTGCAGGCGGGTCTTGCCGATGATGGTGGCGTTCAGCTGGGTGCCCGGCAGGGCTGGCAGGCCG‑CCGAGCTGGCCGGAAGACACCTGCACGTTCTGTGCGGCCACAGCGGTCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCAC > NC_002947/1580590‑1580879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |