Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,892,228 | T→G | 6.5% | L157R (CTG→CGG) | PP_1697 → | transcriptional regulator, GntR family |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,892,228 | 0 | T | G | 6.5% | 239.3 / 6.3 | 77 | L157R (CTG→CGG) | PP_1697 | transcriptional regulator, GntR family |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/35); new base G (3/2); total (40/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 |
GTCGCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCC > NC_002947/1892082‑1892373 | gttgCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCgctgc > 1:260124/4‑149 (MQ=255) tCGCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCgctgct > 6:360482/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGctgctg < 4:174857/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGctgctg > 7:69777/1‑148 (MQ=255) ccGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGAc < 7:270275/147‑1 (MQ=255) ccGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGt < 8:91017/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGt < 6:215106/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCAGCGGCTGGatgg < 2:231024/149‑4 (MQ=255) ccGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGAGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGt > 5:385125/1‑149 (MQ=255) gcCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATc < 6:385125/149‑1 (MQ=255) ttCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTg > 7:323892/1‑148 (MQ=255) ttCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCAGCGGCTGGaag < 4:48280/140‑3 (MQ=255) ttCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCAGCGGCTGGaag > 3:48280/1‑138 (MQ=255) gcgGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAg > 1:363773/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGc < 2:231047/149‑1 (MQ=255) cGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATGATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGTTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGcc > 4:100338/1‑149 (MQ=255) cATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctg < 2:26207/149‑1 (MQ=255) aTTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctgc < 8:73252/149‑1 (MQ=255) aTTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctgc > 7:147095/1‑149 (MQ=255) aTTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctgc > 1:77810/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctg > 5:73469/1‑145 (MQ=255) gggCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCgctg < 6:73469/145‑1 (MQ=255) gCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTAc > 1:25463/1‑149 (MQ=255) ggCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGTCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGa < 3:152493/149‑1 (MQ=255) aGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATc > 4:92644/1‑148 (MQ=255) aGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCt < 8:69777/149‑1 (MQ=255) ggAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCt < 5:32235/114‑1 (MQ=255) ggAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCt > 6:32235/1‑114 (MQ=255) gATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCg > 4:14555/1‑149 (MQ=255) cGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGACGCGCTGTGCGGTCa < 2:25463/149‑1 (MQ=255) gCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAg < 8:325444/149‑1 (MQ=255) gCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAg < 2:260124/149‑1 (MQ=255) tcatTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAggtg < 5:278598/149‑1 (MQ=255) ttCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTc > 5:208228/1‑149 (MQ=255) ttCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTc > 3:296662/1‑149 (MQ=255) ttCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTc < 8:111512/149‑1 (MQ=255) cGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGc > 7:69189/1‑149 (MQ=255) cacaCGTCTGCTCGGCGCCCAGCCAGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGcc > 6:252104/1‑148 (MQ=255) acacGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTa > 2:38591/1‑149 (MQ=255) acGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACg > 2:85961/1‑149 (MQ=255) tCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCg < 6:208228/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCgaaga < 3:14555/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCgaa < 4:215836/147‑1 (MQ=255) tCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCgaagaa > 4:20599/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAAcc < 3:92644/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGAccgccg > 4:202132/1‑148 (MQ=255) cTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAg < 1:38591/148‑1 (MQ=255) gCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGTTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGt < 3:100338/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGt > 2:127163/1‑149 (MQ=255) cGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTc > 5:10487/1‑148 (MQ=255) gaagaaATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAg < 1:14/105‑1 (MQ=255) gaagaaATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAg > 2:14/1‑105 (MQ=255) aaTCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCgg < 5:360482/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCgg < 2:317669/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCgg < 2:77810/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGt < 8:323892/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGtc > 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gcgcCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCt > 4:164342/1‑149 (MQ=255) gcCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTtg > 7:69649/1‑149 (MQ=255) ccAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGAcgcg < 3:128803/133‑1 (MQ=255) ccAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGAcgcg > 4:128803/1‑133 (MQ=255) ccAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTtgc < 8:69189/149‑1 (MQ=255) cAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTga < 3:139611/136‑2 (MQ=255) cAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTga > 4:139611/1‑135 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCAt > 6:340222/1‑137 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCAt < 5:340222/137‑1 (MQ=255) ccacgtCCAGCAGCGGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTtgctg > 5:93578/6‑148 (MQ=255) aaCCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTtgctg > 4:193366/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACt > 7:325778/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGCCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCAGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCCGTGCATGGCCGCTTCCTGCAACt > 3:348281/1‑149 (MQ=255) gtCCAGCAGCGGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACt > 6:239522/2‑149 (MQ=255) ccAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAAcc > 8:176800/1‑100 (MQ=255) ccAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAAcc < 7:176800/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCCTGGCCGCTAGCTGCAccggccgg > 6:269775/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTgccggc > 2:184271/1‑149 (MQ=255) cGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTgccggcc < 3:202132/149‑1 (MQ=255) gctgctGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTgccggcc > 7:370032/1‑148 (MQ=255) | GTCGCTGCCGGCGCCTTCCGCGGTGGCCGAGGCATTGGGCCTGGCAGGGGAGGCAGAAGTGATCCGCATCATTCGCACACGTCTGCTCGGCGCCCAGCCGGTGCTGGCCGAAGAAATCTGGCTGCCGCGCCAAACCTTCCAGCCGCTGCTGGACGTGGATCTGAACAGCGAGGGCCCGCTGCTGTACCCGATCTACGAAGCGCTGTGCGGTCAGGTGGTCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCC > NC_002947/1892082‑1892373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |