| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,080,056 | C→G | 6.0% | R242R (CGC→CGG) ‡ | earP → | EF‑P arginine 32 rhamnosyl‑transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,080,056 | 0 | C | G | 6.0% | 211.3 / 3.2 | 66 | R242R (CGC→CGG) ‡ | earP | EF‑P arginine 32 rhamnosyl‑transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base G (2/2); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
TGAAAACCCACAGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGCACATCTAT > NC_002947/2079909‑2080203 | tGAAAACCCACAGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCAAGGCTGACAAGCCTTGACACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGAGAGGGGCCGCTGCCCGTGGGTGATGTGCGCCCCcgcg > 2:257788/1‑149 (MQ=255) aCCCACAGCTGGGCAACTGACTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTgcg > 4:221250/1‑149 (MQ=255) ccACAGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCt > 5:257299/1‑149 (MQ=255) acaGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGa < 5:312539/149‑1 (MQ=255) acaGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGa < 5:88789/149‑1 (MQ=255) caGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGAc < 3:31546/149‑1 (MQ=255) caGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGAc < 6:257299/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGAcc < 4:85853/149‑1 (MQ=255) gCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGtgctgc > 8:243523/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGcc > 4:3173/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGcc > 8:237282/1‑149 (MQ=255) tGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCg < 6:26225/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTc < 6:248237/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGGGGTGGGGCGCGGGGCCGCGGCCCGGGGGGGATGGGCGCACCCGCGGTGCGGTGACGGTGCGGGTGCTGCGTTTCgacg > 5:342528/1‑146 (MQ=255) gCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑Gc < 8:225205/147‑1 (MQ=255) gCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑Gc < 3:221250/147‑1 (MQ=255) cACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAgg > 3:75279/1‑149 (MQ=255) cGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCGCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGgac < 4:14186/149‑1 (MQ=255) ggCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGgac > 3:302474/1‑148 (MQ=255) cAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGa > 6:91972/1‑149 (MQ=255) ttGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGc > 5:26582/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCt < 7:122085/148‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCt < 7:243523/148‑1 (MQ=255) cACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGtt < 6:375057/149‑1 (MQ=255) cACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGt > 5:375057/1‑148 (MQ=255) cTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATg < 4:302474/149‑1 (MQ=255) gTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATg > 6:34986/1‑147 (MQ=255) gTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGTGCt < 3:186345/148‑1 (MQ=255) tCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGAACGGCTGTTATGGAGCtgt > 4:286046/1‑149 (MQ=255) cGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGa < 3:292133/127‑1 (MQ=255) cGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGa > 4:292133/1‑127 (MQ=255) gCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGAtt > 7:343939/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGAttt < 5:91972/149‑1 (MQ=255) aaGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGAttt > 8:202910/1‑148 (MQ=255) gggCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGAGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCaa > 5:305555/1‑149 (MQ=255) gcgTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGcc < 7:237282/149‑1 (MQ=255) gcgTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGcc < 3:3173/149‑1 (MQ=255) gcgTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGcc > 5:257691/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCcgt < 7:202910/149‑1 (MQ=255) tcgCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATg < 6:342753/141‑1 (MQ=255) tcgCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATg > 5:342753/1‑141 (MQ=255) tcgCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCcgtgcgt > 3:159651/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCg > 3:184071/1‑146 (MQ=255) cTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGa < 6:26582/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGa > 2:66162/1‑124 (MQ=255) tCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGa < 1:66162/124‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGAc > 2:134906/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGAc > 1:370939/1‑149 (MQ=255) aGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACtcgttc > 2:117050/1‑149 (MQ=255) ttGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCcgtgcgtg < 3:283451/130‑1 (MQ=255) ttGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCcgtgcgtg > 4:283451/1‑130 (MQ=255) ggggCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCtgt > 6:187478/1‑103 (MQ=255) ggggCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCtgt < 5:187478/103‑1 (MQ=255) gCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCAGTGGCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTg > 1:117840/1‑149 (MQ=255) gCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGATGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCgg < 4:336686/149‑1 (MQ=255) cTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCggg < 6:257691/149‑1 (MQ=255) aCGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAg < 4:382413/149‑1 (MQ=255) cGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGc < 1:117050/149‑1 (MQ=255) tttgCGCAACGGCTGTGGGCGGAGCGTGCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCTGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGTAGTGTGGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCtgt < 6:305555/147‑1 (MQ=255) tgtgCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCtgt < 6:342528/149‑1 (MQ=255) tcagcgcACCGCGGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGa < 6:280290/105‑1 (MQ=255) tcagcgcACCGCGGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGa > 5:280290/4‑108 (MQ=255) gtgCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCtgtg > 6:131865/1‑149 (MQ=255) cagcgcACCGCGGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTggg > 2:8046/3‑130 (MQ=255) cagcgcACCGCGGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTggg < 1:8046/128‑1 (MQ=255) gcgcACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGGGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGc < 8:343939/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGCACAt > 1:373135/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGCACATCTAt > 4:47550/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGCACATCTAt < 2:117840/149‑1 (MQ=255) | TGAAAACCCACAGCTGGGCAACTGGCTTGATGCCCTGGCCACGGCTGACCAGCCTTGCCACCTGTTGGTCCCGCAAGGGCGCGTCGTCGCGGGGCTCAGCCAGTGGTTGGGCGAGGGGCCGCTGCACGTGGGTGATGTGCGCACCCGCGGTGCGCTGACCGTTCAGGTGCTGCCTTTCGTCA‑‑GCCAGGACGACTTCGACCGGCTGTTATGGAGCTGTGATTTCAATGCCGTGCGTGGCGAAGACTCGTTCGTGCGTGCGCAGTGGGCGGGGCAGCCGATGCTGTGGCACATCTAT > NC_002947/2079909‑2080203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |