| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,134,278 | G→T | 6.7% | intergenic (‑44/+25) | PP_1892 ← / ← fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,134,278 | 0 | G | T | 6.7% | 233.6 / 5.4 | 75 | intergenic (‑44/+25) | PP_1892/fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base T (2/3); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
TGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCACGC > NC_002947/2134134‑2134424 | tGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcgccgc < 6:21053/149‑1 (MQ=255) cTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCATCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccc < 8:299070/149‑1 (MQ=255) tttCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGccccc > 1:200911/1‑149 (MQ=255) tcttctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccccc < 2:305021/148‑1 (MQ=255) cttctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATTGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccccc < 1:90955/148‑1 (MQ=255) tgggtccTGCTGTGGTTCACCCAGCGCCACCAGTATGGTGCGCAGGTGCTGGATCAGTTGCTGGTGATTTTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAT‑TGGGTGCTCGGTTTGGGGGAATGGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTtc < 8:193594/143‑1 (MQ=255) gCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTtctc < 1:298640/148‑1 (MQ=255) gCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCACGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTcg < 6:19306/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTcgc > 6:234171/1‑148 (MQ=255) aCCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTcgc > 5:111159/1‑148 (MQ=255) ccTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGCCCCCC‑GTTtcagccat < 2:200911/149‑7 (MQ=255) ctgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGGCCTCGGTATGGATAAAACGGGGGGCGAATTAAACCCCCCCCCCC‑TTTTATcgca > 4:587/1‑146 (MQ=255) ctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAgg < 7:32273/148‑1 (MQ=255) tctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGt > 5:285446/1‑149 (MQ=255) tctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGt > 6:110426/1‑149 (MQ=255) tCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGAAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAgcgc > 5:227557/1‑149 (MQ=255) cccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCAcc > 6:231378/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCa < 5:204565/141‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCa > 6:204565/1‑141 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCt > 5:36825/1‑149 (MQ=255) tcaccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑GGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCg < 7:173957/148‑1 (MQ=255) ccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGTGGGGCTGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGAGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTa > 4:295893/1‑149 (MQ=255) ccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTa > 3:32554/1‑149 (MQ=255) aGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACg > 3:328061/1‑149 (MQ=255) gAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACgg > 3:279629/1‑149 (MQ=255) aaTGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGc > 4:249580/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGa < 5:139609/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCaa < 1:211450/148‑1 (MQ=255) tGCTGGAGCAGTTGCATGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGcc < 6:261681/149‑1 (MQ=255) ggAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGt < 3:146047/149‑1 (MQ=255) aGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAg < 5:313750/104‑1 (MQ=255) aGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAg > 6:313750/1‑104 (MQ=255) gCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCg > 7:324547/1‑148 (MQ=255) cAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGaa < 8:324547/149‑1 (MQ=255) aGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAg < 1:298615/149‑1 (MQ=255) aGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAg < 1:330850/149‑1 (MQ=255) cAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatc < 2:128975/149‑1 (MQ=255) aGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGTAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatc > 2:358100/1‑148 (MQ=255) gATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatcgacat > 7:169498/1‑149 (MQ=255) tatTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGATGCcttcgacaagg < 6:285446/149‑4 (MQ=255) atTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑g > 5:151981/1‑76 (MQ=255) atTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑g < 6:151981/76‑1 (MQ=255) atTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatcgacatcga > 6:90673/1‑149 (MQ=255) atTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACCGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcctcgacatcga > 6:271511/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGAt < 5:110426/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCAc > 6:203702/1‑149 (MQ=255) gcgcggCCAGGGAC‑TCGGCCCTCCGCATGCCGGAAACGGGCGGCCGCGTATCCGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGcc < 4:279629/145‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCg < 6:111159/149‑1 (MQ=255) ggCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGTAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAg < 1:87214/148‑1 (MQ=255) ccATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCt > 6:395160/1‑149 (MQ=255) cATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCt > 1:107297/1‑149 (MQ=255) cATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 3:86248/1‑149 (MQ=255) cATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTAAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATAGACATCGATCACCTTGCGCCGATCCTg > 4:52703/1‑149 (MQ=255) gAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGATACGGGGGGCGGAGTATACGGCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCg < 6:227557/149‑1 (MQ=255) gggTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCt > 6:240997/1‑149 (MQ=255) ggTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTc < 6:36825/149‑1 (MQ=255) ggTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTc < 5:203702/149‑1 (MQ=255) gTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCg < 3:249580/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGt > 8:84123/1‑149 (MQ=255) tCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTg > 8:220009/1‑147 (MQ=255) tATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCg < 2:107297/149‑1 (MQ=255) tGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCt < 5:231378/149‑1 (MQ=255) gCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTgg < 8:169498/149‑1 (MQ=255) tGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGc > 5:287332/1‑148 (MQ=255) tGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGc > 5:199598/1‑148 (MQ=255) aaCGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtc > 8:250633/1‑149 (MQ=255) ggggggCGGCGTATACTCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtc > 4:229508/1‑149 (MQ=255) gggggCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtcg > 2:271447/1‑149 (MQ=255) ggCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGt < 7:84123/149‑1 (MQ=255) aGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtcg < 7:36136/141‑1 (MQ=255) aGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtcg > 8:36136/1‑141 (MQ=255) aGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgcag > 5:15920/1‑149 (MQ=255) taCTCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCACg < 3:229508/149‑1 (MQ=255) taCGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCAc < 4:328061/148‑1 (MQ=255) taCGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCACg > 3:156429/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCACgc > 6:192574/1‑149 (MQ=255) | TGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAA‑TGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCC‑GTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAGCACGC > NC_002947/2134134‑2134424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |