Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,320,489 | G→C | 5.6% | A251G (GCC→GGC) | PP_2041 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,320,489 | 0 | G | C | 5.6% | 233.8 / 4.0 | 71 | A251G (GCC→GGC) | PP_2041 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/38); new base C (2/2); total (31/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 |
TTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCG > NC_002947/2320341‑2320637 | tttCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTgg > 6:83110/1‑149 (MQ=255) cAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAg < 5:366695/148‑1 (MQ=255) aGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑gc > 3:228747/1‑149 (MQ=255) gcgcTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑gcg > 6:316525/1‑149 (MQ=255) cgctcgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATAAGCCGCGCGCTGGCAG‑gcgc > 6:331999/1‑149 (MQ=255) gctcgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑Gcgcg > 4:215405/1‑149 (MQ=255) ctcgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCgg < 5:137682/149‑1 (MQ=255) cgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGcc < 7:160208/149‑1 (MQ=255) gctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGcc < 5:316525/148‑1 (MQ=255) ctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGc > 7:92665/1‑146 (MQ=255) cgcACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGctgata < 4:123724/148‑6 (MQ=255) gcACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATcc > 6:352570/1‑149 (MQ=255) gcACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATcc < 8:29521/149‑1 (MQ=255) cACCGCATCCACCAGCCGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCca < 6:258459/149‑1 (MQ=255) cACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCca < 8:344232/149‑1 (MQ=255) aCCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGAGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcag > 4:330128/1‑149 (MQ=255) cGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcagca < 1:115598/149‑1 (MQ=255) caccaGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAgcggcg < 7:270475/149‑1 (MQ=255) caccaGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAgcggc < 2:362405/148‑1 (MQ=255) cacacccgTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGcggcgg < 5:397723/142‑1 (MQ=255) cagTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGt > 3:282519/1‑149 (MQ=255) cagTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGt > 3:279103/1‑149 (MQ=255) gcgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGa < 3:148158/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAT‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGAt < 2:252217/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGAtggtg > 6:13152/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgccg > 3:115540/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgccg > 1:280941/1‑149 (MQ=255) gcgcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgcca < 7:268561/149‑1 (MQ=255) cgcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGGTGGTGGCCgccag < 4:228747/149‑1 (MQ=255) gcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccagg > 2:209507/1‑149 (MQ=255) cATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccaggc > 2:338993/1‑149 (MQ=255) cggcggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACgg < 4:279103/149‑1 (MQ=255) cggcggcgAACGACAGCGGCTTGGGCTGCGAGGGGCCCAAGGCGATGGTGCGGGCGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACgg < 4:115540/149‑1 (MQ=255) gcggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCTCCAGGCCAGCACGGAc < 2:256382/149‑1 (MQ=255) gcggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGAc < 2:250899/149‑1 (MQ=255) cggcgAACGACAGCTGATTGTGCTGCGTGTGGGCCAAGGGTATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCTGCCAGATCCAGCTGCTGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGAct < 5:69888/149‑2 (MQ=255) gACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGt < 8:92665/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGt > 6:107807/1‑148 (MQ=255) ttGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCggg > 3:102569/1‑149 (MQ=255) tgctgaGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGc < 1:264668/149‑1 (MQ=255) tgcGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGa > 1:241648/1‑149 (MQ=255) cGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGa < 4:282519/147‑1 (MQ=255) cGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGAct > 4:287852/1‑149 (MQ=255) gTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActgct < 4:102569/149‑1 (MQ=255) gTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActgct < 5:83110/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTc < 5:13152/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTc > 4:7280/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCg > 3:164511/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGt < 1:338993/149‑1 (MQ=255) aaGGCGATGGTGCGGGGGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGGGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTa < 2:266466/149‑1 (MQ=255) aGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAg > 5:235033/1‑149 (MQ=255) cGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTg < 3:7280/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTc > 3:290662/1‑148 (MQ=255) gCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCa < 7:267810/149‑1 (MQ=255) gggTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgt > 4:364734/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgtg > 5:81892/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTcac < 5:352570/149‑1 (MQ=255) gcgGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCg < 3:287852/149‑1 (MQ=255) gTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCa < 4:390617/135‑1 (MQ=255) gTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCa > 3:390617/1‑135 (MQ=255) ccACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTc > 2:113171/1‑148 (MQ=255) cACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCa < 6:318745/149‑1 (MQ=255) aCTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCAt > 1:362374/1‑149 (MQ=255) tATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATgg < 3:215405/149‑1 (MQ=255) tggCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGCCTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAg > 3:91951/3‑149 (MQ=255) tggCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAg > 4:10888/3‑149 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTg > 7:260510/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGc > 2:316595/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGc < 3:330128/149‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCt < 2:280941/149‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCt < 3:364734/149‑1 (MQ=255) cTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGAt < 1:316595/149‑1 (MQ=255) gCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACATCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATgcg > 1:160632/1‑149 (MQ=255) | TTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCG > NC_002947/2320341‑2320637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |