| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,351,590 | G→T | 5.6% | L36M (CTG→ATG) ‡ | PP_2066 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,351,590 | 0 | G | T | 5.6% | 260.6 / 3.8 | 82 | L36M (CTG→ATG) ‡ | PP_2066 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/40); new base T (3/2); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
CCGCCGCGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCG > NC_002947/2351442‑2351735 | ccgccgCGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGcagcag > 6:180335/1‑149 (MQ=255) gccgcGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAgg > 8:100661/1‑148 (MQ=255) gccgcGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGc > 8:106220/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGcc < 1:100542/149‑1 (MQ=255) gcgGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGccc > 4:52889/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTGGGCAGCCTGCTGCCGACCga < 7:221356/149‑2 (MQ=255) ctgctgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCgg < 2:32930/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCgg > 8:124214/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCggg > 6:37167/1‑149 (MQ=255) ctgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCTCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTa < 1:180410/149‑1 (MQ=255) gCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg > 1:361917/1‑149 (MQ=255) gCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg < 1:79271/149‑1 (MQ=255) gCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg < 2:171938/149‑1 (MQ=255) ccTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCgg < 4:268380/149‑1 (MQ=255) ccACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑g < 8:162377/149‑1 (MQ=255) cccGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTg < 6:31320/149‑1 (MQ=255) cccGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTg < 2:361917/149‑1 (MQ=255) cccGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTg > 5:307398/1‑149 (MQ=255) cctggTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACTCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTgg < 2:77487/146‑1 (MQ=255) cccACGCGCGTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGc < 3:142055/149‑1 (MQ=255) aCGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCACACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTg > 1:242813/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCtt < 7:240605/146‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCtt > 8:240605/1‑146 (MQ=255) gcgcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCa < 5:180335/149‑1 (MQ=255) gcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATc < 6:161962/149‑1 (MQ=255) cgcgACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCtt < 7:255842/149‑1 (MQ=255) gcgACACCAGCCCTTTAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGTTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt < 1:29117/149‑1 (MQ=255) acCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCAc > 5:263953/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACgg > 2:66233/1‑149 (MQ=255) aGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGt > 2:360792/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGgaggag > 3:22823/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAg > 5:21142/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAg < 6:153718/149‑1 (MQ=255) ttGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAg > 3:48903/1‑148 (MQ=255) gagtgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGt < 7:124214/147‑1 (MQ=255) gagtgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTa < 2:39747/148‑1 (MQ=255) tgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgcgc > 2:100276/1‑149 (MQ=255) gCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGtt < 5:37167/149‑1 (MQ=255) aTAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATAcc < 7:106220/149‑1 (MQ=255) aTAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATAcc > 6:192739/1‑149 (MQ=255) aTAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATAcc < 7:100661/149‑1 (MQ=255) cGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTg > 7:216545/1‑149 (MQ=255) gcacgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCt < 6:62700/149‑1 (MQ=255) acgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCg < 5:192739/149‑1 (MQ=255) acCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCt > 4:236609/1‑149 (MQ=255) cGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCg > 7:142894/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAAtt > 2:1535/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAAt < 5:254367/148‑1 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCCCCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATc > 6:330093/1‑149 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATc > 6:186924/1‑149 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt > 2:138872/1‑90 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt < 1:138872/90‑1 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCg < 4:48903/148‑1 (MQ=255) aTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGtt < 2:28623/149‑1 (MQ=255) aTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGtt < 3:160815/149‑1 (MQ=255) aTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGtt > 1:28623/1‑149 (MQ=255) aTTGTAAAGGTCGCACAGCTCCAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGAGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCATTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTAATACCTTTGCTCGGGCTAGCCAATATCATCgg > 2:128593/1‑147 (MQ=255) aaaGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAg > 8:315277/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgt > 6:32731/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgt < 1:360792/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCAACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGATCGGGCTCGCCAATTTCATCGGGTGACAgtg > 2:189740/1‑149 (MQ=255) ggTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCGATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCa > 1:95795/1‑135 (MQ=255) ggTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCGATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCa < 2:95795/135‑1 (MQ=255) ggTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGt < 7:309940/140‑1 (MQ=255) ggTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTGCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGt > 8:309940/1‑140 (MQ=255) tCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTaa < 1:1535/149‑1 (MQ=255) cGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGAGTTGGGTTCAGACCTTTGCTCGGGCTCGCAAATTTCATCGGTTGACAGTGTaa > 4:298535/1‑148 (MQ=255) cacaGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAg < 2:242813/149‑1 (MQ=255) aGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCTTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCgg < 1:189740/149‑1 (MQ=255) gCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGc < 8:142894/149‑1 (MQ=255) tCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtgt > 4:333642/1‑138 (MQ=255) tCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtgt < 3:333642/138‑1 (MQ=255) tCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGcc > 7:140304/1‑148 (MQ=255) cgctacccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGcc > 2:278450/8‑148 (MQ=255) cgctacccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGcc > 2:283849/8‑148 (MQ=255) gctacccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCg > 4:290336/7‑148 (MQ=255) aaCTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAAt > 4:218241/1‑149 (MQ=255) tcggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGc > 1:64383/1‑149 (MQ=255) tcggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTGGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGcc < 3:52889/149‑1 (MQ=255) cggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTACCAGCGGCCGAATGcc > 2:235353/1‑148 (MQ=255) cggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAAt > 2:281305/1‑145 (MQ=255) cggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAAt < 1:281305/145‑1 (MQ=255) gtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGaa < 6:263953/149‑1 (MQ=255) tgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAAc < 3:290336/147‑1 (MQ=255) cagcagGCTGCCCACCGGGTCGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTGCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTc > 5:111470/1‑149 (MQ=255) gcagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCg > 7:110751/1‑149 (MQ=255) | CCGCCGCGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCC‑GCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCG > NC_002947/2351442‑2351735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |