| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,416,554 | A→T | 5.3% | intergenic (+87/+28) | pdxB → / ← PP_2118 | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,416,554 | 0 | A | T | 5.3% | 237.1 / 2.7 | 76 | intergenic (+87/+28) | pdxB/PP_2118 | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/35); new base T (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
GGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTT > NC_002947/2416413‑2416700 | ggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGcc < 8:151617/148‑1 (MQ=255)ggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGcc > 7:151617/1‑148 (MQ=255) aGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCggg < 6:148502/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCGGGtt < 2:42571/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGACTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCAGGCGCAACCCCCGGGtt > 8:320315/1‑149 (MQ=255) gcagttggcgcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga < 8:214595/149‑1 (MQ=255) gcagttggcgcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCCTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga < 5:397018/149‑1 (MQ=255) gcagttggcgcagttggTCAGTGCCCTGGGGGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga < 7:89940/149‑1 (MQ=255) cgcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGc > 5:183057/1‑149 (MQ=255) cgcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGc < 6:113495/149‑1 (MQ=255) cgcagttggGCAGGGCCCTGGGGGGGGGGTTGGTCTAACCACGCCTTGTCGTGACCTTGCATGTAGGGGTGGTTACCTGTTGGGGGGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGc < 6:19808/149‑1 (MQ=255) cagttggTCAGTGCCCTGGGTGTGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCg < 4:111230/149‑1 (MQ=255) agttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa < 6:348295/149‑1 (MQ=255) agttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa < 8:180785/149‑1 (MQ=255) gTGCCCTGTGTGGGGTGTTTGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCttt < 5:90382/149‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAAc > 8:319205/1‑144 (MQ=255) tGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAAc < 7:319205/144‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTg > 1:66509/1‑149 (MQ=255) cccTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGc < 5:113314/148‑1 (MQ=255) ggtggggtgTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGcc > 7:219024/1‑130 (MQ=255) ggtggggtgTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGcc < 8:219024/130‑1 (MQ=255) gggtgTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTc > 3:371894/1‑149 (MQ=255) gggtgTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTc < 3:151102/149‑1 (MQ=255) gTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACgg < 2:106154/148‑1 (MQ=255) tCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCt > 6:336377/1‑149 (MQ=255) gcTAAGCCCGCCGTGTCTTGCCCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAACCCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCt < 8:183186/148‑1 (MQ=255) tAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCtt > 3:69913/1‑148 (MQ=255) aCGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTcc > 6:389854/1‑149 (MQ=255) aCGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTcc < 4:246532/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGCCACGGCTTTCTTCCAg < 6:183057/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAg < 8:361459/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAgg < 5:96822/149‑1 (MQ=255) cTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAggg > 6:245058/1‑149 (MQ=255) gTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGc < 5:336377/147‑1 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga < 4:75604/91‑1 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga > 3:75604/1‑91 (MQ=255) cTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGcc > 2:38694/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGAGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGcc > 2:185529/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGCGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGcc > 7:178639/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCct > 6:398430/1‑149 (MQ=255) gtaggtGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGa > 3:128588/1‑149 (MQ=255) ggtGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatc < 4:371894/148‑1 (MQ=255) tgtgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcatc < 4:69913/149‑1 (MQ=255) tgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGGAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCt < 5:38967/148‑1 (MQ=255) ttACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTc > 4:127213/1‑149 (MQ=255) ttACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTc > 5:374980/1‑149 (MQ=255) ttACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTc > 4:53022/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCTGGGTTGCa < 5:152818/65‑1 (MQ=255) aCCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCTGGGTTGCa > 6:152818/1‑65 (MQ=255) aCCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCgg > 4:263235/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCg < 1:38694/148‑1 (MQ=255) cTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCttt < 7:339977/108‑1 (MQ=255) cTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCttt > 8:339977/1‑108 (MQ=255) cTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGt > 7:77650/1‑148 (MQ=255) cTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCAGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGt > 1:274696/1‑148 (MQ=255) ttGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATc < 3:263235/149‑1 (MQ=255) gcggcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCAc > 4:185374/1‑149 (MQ=255) gcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAGGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCt < 2:136254/133‑1 (MQ=255) ccAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCt < 4:190199/129‑1 (MQ=255) ccAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCt > 3:190199/1‑129 (MQ=255) cAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTcgc < 4:128588/149‑1 (MQ=255) cACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCt > 5:280382/1‑149 (MQ=255) tggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat < 4:176646/113‑1 (MQ=255) tggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat > 3:176646/1‑113 (MQ=255) gggCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTc > 6:385255/1‑148 (MQ=255) cAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTAGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCGGCTGGATCATCTGCTCGGAGATCGGCACTTCGCGCCCATTGGCGTCgatga > 1:200001/1‑149 (MQ=255) aaTAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCgatgat < 5:398430/149‑1 (MQ=255) aTAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATc > 8:102848/1‑149 (MQ=255) tAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATc > 2:322660/1‑148 (MQ=255) tgcaaCCCGGCGCTTGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCgatg > 3:343741/4‑144 (MQ=255) tgcaaCCCGGCGCTTGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCgatg < 4:343741/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCg > 2:123219/1‑148 (MQ=255) aCCCGGCGCTTGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCg > 8:336326/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCg > 1:303042/1‑149 (MQ=255) gcgcAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATAc > 8:75368/1‑149 (MQ=255) gcAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGTTCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACtt > 5:374388/1‑149 (MQ=255) | GGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCGGCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTT > NC_002947/2416413‑2416700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |