Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,628,386 | A→C | 7.5% | A16A (GCA→GCC) | clpP → | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,628,386 | 0 | A | C | 7.5% | 220.7 / 7.2 | 76 | A16A (GCA→GCC) | clpP | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/34); new base C (2/4); total (38/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.70e-01 |
GTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCT > NC_002947/2628244‑2628532 | gTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAggcggc < 1:143248/149‑1 (MQ=255) tAACGGTTTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACATGCCAGCCTTCGAGCTGTCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAggcggc < 1:131581/148‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCt < 8:170320/148‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCt < 1:394877/148‑1 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 7:149777/149‑3 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 7:119327/149‑3 (MQ=255) tcttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCCTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTcc < 4:106801/149‑1 (MQ=255) tcttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTcc < 2:108644/149‑1 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGt > 5:168640/1‑149 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGt > 5:19615/1‑149 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGt > 3:138008/1‑149 (MQ=255) cGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGt > 7:127391/1‑148 (MQ=255) tAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTAt > 6:358209/1‑149 (MQ=255) aGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTccc > 5:358891/1‑139 (MQ=255) aGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTccc < 6:358891/139‑1 (MQ=255) ggAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc < 5:355900/148‑1 (MQ=255) ggAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc > 4:284313/1‑148 (MQ=255) gAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGa < 5:358209/149‑1 (MQ=255) aaaCCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAg > 2:99260/1‑149 (MQ=255) aCCTACAGAAGCAATCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTTGGAGTGAGCTCATGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCa < 7:357460/149‑1 (MQ=255) cTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGt > 3:205597/1‑149 (MQ=255) agccagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTACCGAGGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCg > 6:363637/1‑149 (MQ=255) gccagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGt > 6:312202/1‑149 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTgg < 8:35099/149‑1 (MQ=255) cTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGaa > 3:338552/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAAc > 2:325094/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGAAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGa > 2:351947/1‑148 (MQ=255) gtgCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCAGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACa > 1:73415/1‑148 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGa < 6:8435/96‑1 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGa > 5:8435/1‑96 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCgcgc > 3:50349/1‑149 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCgcgc > 7:50451/1‑149 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCgcgc > 6:273254/1‑149 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGtt > 6:282745/1‑149 (MQ=255) tGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTg < 3:284313/149‑1 (MQ=255) aCTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTg > 1:84210/1‑147 (MQ=255) aCTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGaa < 4:102726/149‑1 (MQ=255) cTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAg < 5:303506/149‑1 (MQ=255) tttGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCGGCGGCCGGGTCCCGATGGGTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGCCATCTACTCGCGGCTGTTGAAggcg > 8:127317/1‑147 (MQ=255) tttGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑Ag < 1:95240/149‑1 (MQ=255) ggAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCgtg < 5:282745/149‑1 (MQ=255) ggAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCgtg < 8:127391/149‑1 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATc < 7:362017/122‑1 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATc < 7:367224/122‑1 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATc > 8:362017/1‑122 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATc > 8:367224/1‑122 (MQ=255) cgcAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTc > 2:229491/1‑149 (MQ=255) cgcAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTc < 6:19615/149‑1 (MQ=255) ggACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTgg < 8:50451/149‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCg < 2:265405/88‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCg > 1:265405/1‑88 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg > 8:111466/1‑149 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg < 1:355066/149‑1 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGTCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTTTCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGCAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCg < 1:205789/148‑1 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg > 2:338669/1‑148 (MQ=255) cGCAAGTCGTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCATGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCAG‑CCCGTGGAGAACGCGCTTACGACATCTACACGCGCCTCTAGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCg > 2:205789/1‑147 (MQ=255) gCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg > 2:312852/1‑147 (MQ=255) aaTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTaga < 5:273254/149‑1 (MQ=255) aaTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATAGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTa > 7:128479/1‑147 (MQ=255) aTTCTTATATTGAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACTCTATTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGT‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag < 1:71345/149‑1 (MQ=255) aTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag < 4:138008/149‑1 (MQ=255) aTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCACGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag < 4:205597/149‑1 (MQ=255) atatTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTa < 1:338669/148‑1 (MQ=255) ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACAt < 2:84210/148‑1 (MQ=255) agcagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGc > 8:220586/1‑148 (MQ=255) gcagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGcc > 6:119823/1‑148 (MQ=255) ctGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcggc > 5:341508/1‑147 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATgg > 2:232515/1‑135 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATgg < 1:232515/135‑1 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGtt > 3:102896/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGtt < 5:119823/149‑1 (MQ=255) aTCCACGCCGCAGGCGGGCTGGTCCCGATTGTTATCGATCATTCCGCCCCGCAATGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTg < 1:325094/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcg > 6:1053/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcgc < 4:102896/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcgc < 6:168640/148‑1 (MQ=255) gCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAActgct > 3:317569/1‑149 (MQ=255) | GTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCG‑CCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGG‑AGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCT > NC_002947/2628244‑2628532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |