| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,266,111 | G→C | 11.4% | intergenic (+28/+31) | PP_2863 → / ← PP_2864 | membrane protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,266,111 | 0 | G | C | 11.4% | 170.9 / 10.9 | 60 | intergenic (+28/+31) | PP_2863/PP_2864 | membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/24); new base C (2/5); total (31/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
TTTCGGCACAAGACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAGGGCGGCGCCATGC > NC_002947/3265964‑3266257 | tttCGGCACAAGACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCggg > 8:195994/1‑148 (MQ=255) ttCGGCACAAGACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGt > 8:291552/1‑148 (MQ=255) gCACAAGACCCGCAAGTGTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGAATTTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTTTCGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGc < 7:268140/149‑1 (MQ=255) aaGACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGTGGGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCcgc > 1:3832/1‑149 (MQ=255) gACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGCTTTACCCGCGaa < 4:362686/149‑1 (MQ=255) cccGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAg < 7:203272/149‑1 (MQ=255) ccGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTTCCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGaagag > 1:159409/1‑146 (MQ=38) ccGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAgg > 3:122163/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTTCCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGaagaggc < 4:131130/149‑6 (MQ=38) gCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGaagaggc < 6:286357/149‑6 (MQ=255) cAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGcc < 7:195994/149‑1 (MQ=255) aaGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCg < 3:175283/149‑1 (MQ=255) tttCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGaa > 2:370531/1‑148 (MQ=255) ttCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGaa > 2:183732/1‑147 (MQ=255) gTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTTCCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACaac < 2:159409/148‑3 (MQ=37) gTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGt < 1:183732/149‑1 (MQ=255) cAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAgg > 2:225002/1‑144 (MQ=255) cAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAgg < 1:225002/144‑1 (MQ=255) cAGGT‑CGTGTGCTGGGCGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGAt < 3:70782/149‑1 (MQ=255) t‑ggtgTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATcaca < 7:291552/149‑1 (MQ=255) gATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCa > 1:115462/1‑148 (MQ=255) aTTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑cc > 7:182194/1‑149 (MQ=255) tgctgctgcACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCTAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGc < 7:7194/148‑1 (MQ=255) ctgctgcACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAAc < 2:3832/149‑1 (MQ=255) gcACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCtt > 4:227292/1‑149 (MQ=255) gcACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGAAGAGGCCggta < 7:352623/111‑3 (MQ=25) gcACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCCTTTCGCGGCTTTACCCGCGAAGAGGCCggta > 8:352623/1‑109 (MQ=25) cACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCtt < 4:335945/148‑1 (MQ=255) cACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTg < 1:370531/149‑1 (MQ=255) cACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTg < 1:15107/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGGAGATCACATGCCCAAGCCCC‑CCGGCAACCGCGTggg > 2:354994/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGCTGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAAc < 6:76131/149‑1 (MQ=255) gtTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAAcc > 7:30516/1‑148 (MQ=255) gtTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAAcc > 1:143624/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAAc > 7:354153/1‑135 (MQ=255) tGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCTGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGGGAAAGGGCCGGAAGAGGTCGAAAACATGACCAACCACC‑CCGGCAACCGCTAGGGGCACCGACGCACTACCAGc > 4:204589/1‑149 (MQ=255) gCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTg > 2:97418/1‑149 (MQ=255) gACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCg < 2:115462/148‑1 (MQ=255) gACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGc > 3:105715/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCACTg < 3:227292/149‑1 (MQ=255) gCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTgg > 5:21960/1‑112 (MQ=255) gCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTgg < 6:21960/112‑1 (MQ=255) gCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCaa > 3:109336/1‑149 (MQ=255) cGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCaa > 6:304647/1‑148 (MQ=255) gTTATCTGCCCCTTGGTTGCTGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCACCCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAac < 1:97418/149‑1 (MQ=255) tCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTg < 8:213014/128‑1 (MQ=255) tCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTg > 7:213014/1‑128 (MQ=255) cTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTca > 7:41106/1‑149 (MQ=255) gCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCGACCGAGGCACTACCCGGTGCAGCGCCCGCTGCCACACCTcacc > 8:325886/1‑148 (MQ=255) gCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTcaca > 3:231311/1‑149 (MQ=255) ccccTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTca < 8:41106/146‑1 (MQ=255) ttGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGtt > 3:188995/1‑149 (MQ=255) ttGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAAACGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTtcat > 3:338698/1‑148 (MQ=255) gATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTtcatca < 4:231311/148‑1 (MQ=255) tgCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGccc > 3:287458/1‑149 (MQ=255) tgCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCACTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGccc > 7:366554/1‑149 (MQ=255) cAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGcccct < 2:143624/149‑2 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAggg > 8:16142/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGCCCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGGTCATCACGCCCCATGGGGTAGggc > 4:293256/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAGGgcggcg < 4:105715/146‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAGGGCGGCGcc < 4:109336/148‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAGGGCGGCGCCATGc < 8:182194/149‑1 (MQ=255) ggTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTtca > 6:335924/1‑117 (MQ=255) ggTAAAGCCCCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTtca < 5:335924/117‑1 (MQ=255) | TTTCGGCACAAGACCCGCAAGGTTTCGTTCCAGGT‑GGTGTGCTGGGGGATTGTGCTGCTGCACCAGGTGTTCTGGGCAGACTGGCTGTTTCTTGACGGGCGTTATCTGCCCCTTGGTTGATGTGCAGTTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCGAAAGGGCCGGAACAGGTCGATCACATGACCAACCCCA‑CCTGCAACCGCTTGGGCAACCGACGCACTACCAGCTGGTGCGACCGCTGCAACACCTCACACAGTTCATCACGCCCCATGGGGTAGGGCGGCGCCATGC > NC_002947/3265964‑3266257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |