| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,475,226 | T→G | 5.7% | D496A (GAC→GCC) | PP_3087 ← | excinuclease ABC subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,475,226 | 0 | T | G | 5.7% | 253.6 / 4.5 | 83 | D496A (GAC→GCC) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/43); new base G (3/2); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
CCCACCAGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACA > NC_002947/3475082‑3475372 | cccACCAGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGTATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTcgcg < 6:104791/149‑1 (MQ=255) agcagGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑gggg > 8:53433/1‑149 (MQ=255) ggagGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑ggggg < 2:2016/147‑1 (MQ=255) gcagGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑ggggg > 7:94498/1‑149 (MQ=255) cagGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGGTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑gggggg > 6:5292/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTg > 5:393693/1‑148 (MQ=255) cAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTa > 7:109727/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTa > 7:266907/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCATGTGGCCTGTa < 3:62794/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGACGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTAc > 5:114085/1‑149 (MQ=255) ggCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCt < 8:258167/144‑1 (MQ=255) ggCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCt > 7:258167/1‑144 (MQ=255) ggCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTAcc > 8:4622/1‑149 (MQ=255) tGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg > 5:37244/1‑149 (MQ=255) tGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg > 2:313392/1‑149 (MQ=255) tGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCAGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg > 6:210634/1‑149 (MQ=255) gATTTGCCCGAGCCGGAACTACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGGTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGGCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg < 3:45848/147‑1 (MQ=255) gATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAACTGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg < 1:6930/147‑1 (MQ=255) gATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCggg < 5:163804/147‑1 (MQ=255) tgtGCCCGAGCCGGAAATACCGGTTACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑CAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCAt < 5:314837/147‑1 (MQ=255) ccGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCTAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGaa < 1:309930/149‑1 (MQ=255) ccGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAAc < 5:82003/149‑1 (MQ=255) aGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACagg < 4:73283/149‑1 (MQ=255) 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cGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTg > 1:377328/1‑149 (MQ=255) ggTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACag > 7:144818/1‑135 (MQ=255) ggTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACag < 8:144818/135‑1 (MQ=255) gTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTGGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCa < 6:37244/149‑1 (MQ=255) tAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCgg > 5:12680/1‑121 (MQ=255) tAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCgg < 6:12680/121‑1 (MQ=255) tAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGGGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCAt < 6:141163/149‑1 (MQ=255) aCGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGGTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGa < 5:5292/149‑1 (MQ=255) ggcggTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACt > 7:204705/1‑149 (MQ=255) cggTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGt < 2:91960/149‑1 (MQ=255) gTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTg > 7:90620/1‑149 (MQ=255) agcCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCg < 1:230221/149‑1 (MQ=255) ccAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGc > 5:23348/1‑148 (MQ=255) cAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGc > 7:6287/1‑147 (MQ=255) aaCGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAg < 8:94498/149‑1 (MQ=255) aaCGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAg > 3:124665/1‑149 (MQ=255) aaCGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGCGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAg < 7:53433/149‑1 (MQ=255) cGGAAATGCGGCGCTGAGGTTATCGATGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGC < 7:4622‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCcggcgg < 2:237836/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGccc > 3:218679/1‑149 (MQ=255) ggTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTg < 2:377328/149‑1 (MQ=255) aTCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTa > 2:351000/1‑147 (MQ=255) tCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTagag < 1:313392/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTaga < 8:109727/148‑1 (MQ=255) gAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAgg < 8:266907/148‑1 (MQ=255) gAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGa < 6:114085/149‑1 (MQ=255) 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gCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGaacacggcggcgccatcctctacagcgggccgcccgccggcctgg > 1:193230‑M1/1‑104 (MQ=255) cTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGaacacggcggcgccatcctctacagcgggccgcccgccggcctggc < 2:193230‑M1/149‑47 (MQ=255) ccccgCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTg > 1:162089/5‑83 (MQ=38) ccccgCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTg < 2:162089/79‑1 (MQ=38) ccccgCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCggg > 6:216246/5‑149 (MQ=255) aGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGc < 4:218679/148‑1 (MQ=255) aGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGccc < 6:393693/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCAGTAGAGGATGGTGCCGCCGTCTTCGCCGGCAGCGGGccc > 7:137686/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACATGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGccc > 2:78138/1‑148 (MQ=255) ccAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 4:99873/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 6:268289/1‑149 (MQ=255) cAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCGTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 8:6197/1‑148 (MQ=255) cAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTAc < 5:210634/149‑1 (MQ=255) aGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACa > 4:337534/1‑149 (MQ=255) | CCCACCAGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTC‑AAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACA > NC_002947/3475082‑3475372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |