Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,785,051 | C→T | 8.5% | R82R (CGC→CGT) | PP_3348 → | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,785,051 | 0 | C | T | 8.5% | 197.8 / 6.2 | 71 | R82R (CGC→CGT) | PP_3348 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/34); new base T (4/2); total (34/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.64e-01 |
TTCCTGGCCGCCGTCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCATGTCTGTCAGC > NC_002947/3784905‑3785198 | ttCCTGGCCGCCGTCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCAc > 2:52032/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCGTCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGcc > 4:10939/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCGTCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGcc > 7:370532/1‑148 (MQ=255) cgTGATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGGCATGGTCTGGATGCCGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACGGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCATCCAGCGCGCGGCGGAgcgcg > 6:329414/1‑148 (MQ=255) tCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCTCCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTgg < 1:33347/149‑1 (MQ=255) tCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTgg < 5:10443/149‑1 (MQ=255) tCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTgg < 6:287655/149‑1 (MQ=255) tCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTgg < 5:224477/149‑1 (MQ=255) tCACGCAGTGCGGGCTCGGCTGCGAGCGTTTCGACCCGCAAACGGTCATGGTCGGGATGACGTAATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCggg < 8:6696/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTGCTGGTTGGGCGGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGa < 3:289893/149‑1 (MQ=255) tgctgtgctgGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGTTCGGCCGTGCGCTggttg < 3:144907/149‑4 (MQ=255) tgctgtgctgGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAg < 4:348493/149‑1 (MQ=255) ctgtgctgGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGTTCGGCCGTGCGCTggttggc < 3:256533/149‑6 (MQ=255) ctgtgctgGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGt < 8:370532/148‑1 (MQ=255) tgctgGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCg < 5:135103/149‑1 (MQ=255) ttGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTg < 1:236043/149‑1 (MQ=255) gggCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTgg < 3:10939/148‑1 (MQ=255) gTTTCGAGCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGGGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGGCTATCTGCGTGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATg < 2:67166/149‑1 (MQ=255) gTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATg < 6:376938/149‑1 (MQ=255) gTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATg > 4:41302/1‑149 (MQ=255) tttCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGc > 5:139885/1‑149 (MQ=255) cGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTcggcg < 7:366038/149‑1 (MQ=255) cAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCggcggc > 8:307891/1‑149 (MQ=255) tCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctgg < 7:213962/149‑1 (MQ=255) tCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctgg < 5:333349/149‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctgggg > 1:248223/1‑149 (MQ=255) aTGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctggg < 1:170302/148‑1 (MQ=255) tGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctggggc > 3:204543/1‑149 (MQ=255) gTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTg < 2:248223/149‑1 (MQ=255) gTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCAAGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGCAGCTCTCGCGGGCTATCTGCGGCTGGGGCGCCTTTg > 5:129204/1‑149 (MQ=255) ttATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCttt < 5:384148/147‑1 (MQ=255) ttATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCttt > 6:384148/1‑147 (MQ=255) ttATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGc < 3:41302/149‑1 (MQ=255) tATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGTTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGcc > 4:148735/1‑149 (MQ=255) aTTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCg > 2:78989/1‑149 (MQ=255) ttGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCg < 6:139885/148‑1 (MQ=255) tGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGt > 8:62053/1‑148 (MQ=255) gggCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctggggctggg < 2:93610/134‑1 (MQ=255) gggCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATctggggctggg > 1:93610/1‑134 (MQ=255) ggCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTaa < 2:312230/148‑1 (MQ=255) gggtCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGcc < 1:203541/147‑1 (MQ=255) gACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCg > 5:284405/1‑146 (MQ=255) ccGGAGTGCGTACCGCCATGTTCTTAGCCTTTCTGGGAGCACCTGTTAACCAGTGCTCTGCCGAAGGCTGGGAGTGGGGTTACTGGGTGTGGCTGATGCTGTCTGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCTCCTTTGCCGTAATGCCCGCAga < 4:204543/148‑1 (MQ=255) cgtgcgtACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGacgacg < 7:62053/149‑1 (MQ=255) tACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGAGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTgg > 8:238864/1‑149 (MQ=255) cGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGc < 3:120307/149‑1 (MQ=255) gCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTAGCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCa < 7:307891/149‑1 (MQ=255) cATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCCCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGa > 1:219462/1‑149 (MQ=255) tGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACg > 5:115186/1‑149 (MQ=255) cttcGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGa > 4:271959/1‑149 (MQ=255) cttcGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGa > 2:261612/1‑149 (MQ=255) cGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATc < 6:284405/148‑1 (MQ=255) ccTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGGGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATg < 5:329414/149‑1 (MQ=255) tATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCt > 3:131002/1‑149 (MQ=255) tgccGAACACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGtt > 6:293348/4‑149 (MQ=255) gCGAGCACCCGCCAACCAGCGGACGGCCGAACGCTGGGTGGGGCGTTACTGGGGCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTg < 3:295303/149‑1 (MQ=255) gCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGCCGCGCTGGGGCAGACGCTGCTCATGCTGTTTg > 8:163669/1‑149 (MQ=255) gCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTg > 5:105713/1‑149 (MQ=255) gAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGcc < 6:115186/149‑1 (MQ=255) gCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGt > 2:177072/1‑149 (MQ=255) ccGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCgg > 2:2371/1‑148 (MQ=255) ccGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACACTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCgg > 4:303206/1‑148 (MQ=255) cGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCa > 1:3548/1‑149 (MQ=255) gCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAt < 3:271959/149‑1 (MQ=255) gCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAt < 1:261612/149‑1 (MQ=255) ctcccAGCGTTCGGCCGTGCGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgt > 8:334270/4‑149 (MQ=255) tcccAGCGTTCGGCCGTGCGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgtc > 2:60899/3‑149 (MQ=255) tcccAGCGTTCGGCCGTGCGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgtc > 5:27543/3‑149 (MQ=255) aCCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgtct < 3:148735/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTTCGGCCGTGCGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgtctg > 4:341375/1‑149 (MQ=255) cAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCAtgtctgt > 5:118758/1‑149 (MQ=255) gcACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCATGTCTGTCAgc < 2:219462/149‑1 (MQ=255) | TTCCTGGCCGCCGTCATGCTGTGCTGGTTGGGCTGGGAGCGTTTCGACCCGCAAAGGGTCATGGTCTGGATGACGTTATTGGGCGTGTCGACCGGCGTGCGTACCGCCATGTTCTTCGCCTATCTGCGAGCACCCGCCAACCAGCGCACGGCCGAACGCTGGGAGTGGCGTTACTGGGTCACGCTGATGCTGTCGGCGGCTATCTGGGGCTGGGGCGCCTTTGCCGTAATGCCCGCAGACGACGCGCTGGGGCAGACGCTGATCATGCTGTTTGCCGTCGGCATGTCTGTCAGC > NC_002947/3784905‑3785198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |