| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,980,284 | T→C | 7.8% | D116G (GAT→GGT) | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,980,284 | 0 | T | C | 7.8% | 215.6 / 7.3 | 78 | D116G (GAT→GGT) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/30); new base C (3/3); total (45/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
CGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGACCG > NC_002947/3980141‑3980431 | cgcgGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc > 8:242092/1‑149 (MQ=255)cgcgGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCGCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc > 7:301136/1‑149 (MQ=255)cgcgGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTGGAACCGGTTGAGGCCGCTGGCCGTGCCGCCCTGGCGCAGGGAATGCCTAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGGCAGCTCCGCGTCCGGGCGGTCATCGccc < 6:69801/149‑1 (MQ=255) gcgGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc < 5:151990/148‑1 (MQ=255) ctggccAGCCAATGGCTGGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCg > 8:95020/5‑149 (MQ=255) ggCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCTCCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGc < 6:330991/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCCATTGGCC‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCa < 2:366073/149‑1 (MQ=255) ccAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAc > 5:233692/1‑148 (MQ=255) cAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAc > 5:243574/1‑147 (MQ=255) cATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAAt > 3:357418/1‑149 (MQ=255) ggct‑ggcCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCCCCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGATGACCGCCCgga > 8:368728/1‑136 (MQ=255) ggct‑ggcCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGATGACCGCCCgga < 7:368728/137‑2 (MQ=255) ccAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACg > 7:218454/1‑149 (MQ=255) cAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGc > 3:16118/1‑149 (MQ=255) aGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTATTGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAcc > 2:332989/1‑132 (MQ=255) ggCAGTTAAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCa > 4:90609/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCAc < 6:233692/149‑1 (MQ=255) aGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACgg < 7:217305/149‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCACAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCt < 6:390728/149‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCCGCt > 3:46825/1‑149 (MQ=255) ttGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTc < 2:269444/149‑1 (MQ=255) ttGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTc < 3:202406/149‑1 (MQ=255) ttGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTc > 3:43006/1‑149 (MQ=255) gATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCg < 3:60581/148‑1 (MQ=255) aTGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGAc < 1:106083/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCa < 8:218454/148‑1 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAgtt < 3:90609/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAgttgt < 5:227641/148‑1 (MQ=255) ttGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGAc > 4:112676/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGAc > 2:102050/1‑149 (MQ=255) gccgccCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGAc < 8:301136/147‑1 (MQ=255) gccgccCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACg < 7:95020/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAg < 8:287646/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAgcgc < 6:243574/149‑1 (MQ=255) aGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTa < 7:242092/149‑1 (MQ=255) ggTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAg < 4:43006/149‑1 (MQ=255) gTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGc > 5:87131/1‑149 (MQ=255) aTGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCaa > 3:127399/1‑149 (MQ=255) ccAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGc > 7:219605/1‑149 (MQ=255) aaaGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGc < 1:374832/141‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGc > 2:374832/1‑141 (MQ=255) cgcgGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCGGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATg > 2:332824/1‑149 (MQ=255) cgcgGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt > 7:30913/1‑148 (MQ=255) gcgGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGa > 3:5816/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCtt < 2:177827/149‑1 (MQ=255) cccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgt < 4:357418/148‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCTGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg > 2:296617/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg > 5:59302/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg > 6:353381/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg > 7:254683/1‑149 (MQ=255) aGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtggcg > 1:270290/1‑149 (MQ=255) aGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGAGAGGTCAACGCCCGGAACC‑AGAATCAGCTGCACGCAACGGACGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACATtggcgtggcg > 7:59031/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCgcag < 6:237097/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCAcc < 8:30913/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCAcc > 4:274965/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCAcc > 3:58884/1‑149 (MQ=255) aGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTg > 6:82388/1‑149 (MQ=255) aGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTg > 7:236188/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTgg < 4:16118/149‑1 (MQ=255) ctctGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGt > 3:111377/1‑149 (MQ=255) cTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGt > 7:282758/1‑149 (MQ=255) tccgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACCGAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGCCCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCACCGCCCCCGTGCAGCGCCACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCCCCTGGt > 1:235288/1‑149 (MQ=255) tccgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTAGGCGTGGCGCAGCACCTGCTc > 8:225527/1‑149 (MQ=255) tccgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGAGCAGCGACACCAGGATGCCCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTc > 8:365462/1‑149 (MQ=255) cgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTc < 4:127399/147‑1 (MQ=255) cgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGa > 2:354747/1‑149 (MQ=255) ggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACa > 2:5599/1‑149 (MQ=255) ccgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATAc < 4:111377/149‑1 (MQ=255) cgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATa > 7:352462/1‑147 (MQ=255) cgggCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACa < 8:236188/149‑1 (MQ=255) cgggCGATGACCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt > 1:277962/1‑114 (MQ=255) cgggCGATGACCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt < 2:272494/114‑1 (MQ=255) cgggCGATGACCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt > 1:272494/1‑114 (MQ=255) cgggCGATGACCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt < 2:277962/114‑1 (MQ=255) cGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTc < 8:219605/149‑1 (MQ=255) tCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGAc > 7:158236/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGAcc > 1:326128/1‑148 (MQ=255) aTCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGACCg > 7:225007/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGAcc > 7:13480/1‑147 (MQ=255) | CGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACC‑AGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTCGACCG > NC_002947/3980141‑3980431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |