| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,084,744 | T→A | 5.8% | L57Q (CTG→CAG) ‡ | PP_3595 → | amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,084,744 | 0 | T | A | 5.8% | 204.4 / 2.6 | 69 | L57Q (CTG→CAG) ‡ | PP_3595 | amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/32); new base A (2/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 | |||||||||||
ATGGTGCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCGGGATGC > NC_002947/4084599‑4084888 | agggggCTCGACCCCGACCTGCGGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGGGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGt < 2:265551/144‑1 (MQ=255) tGGTGCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGtg < 1:239347/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGtgct > 8:37457/1‑149 (MQ=255) tGCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGGTGGTAACTGCCATGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGtgctg < 4:331618/149‑1 (MQ=255) gCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGtgctg > 4:267100/1‑148 (MQ=255) cTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGtgctgc < 7:346175/148‑1 (MQ=255) tCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAg > 3:317598/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAg > 7:362326/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCATGCGCTGCAg > 7:292825/1‑149 (MQ=255) cGACACCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCAGCGCTTCATCGACGGCCAGCTGGTAACTCCCAAGCTGCTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTCCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAgc > 4:331809/1‑149 (MQ=255) gACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCATGCGCTGCAgca > 7:360298/1‑148 (MQ=255) ccGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATg < 3:371354/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCt < 8:362326/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTg > 3:119069/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCATGCGCTGCAGCACCAGGCTg < 8:360298/149‑1 (MQ=255) ctgctgGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCATGCGCTGCAGCACCAGGCTGc < 8:292825/149‑1 (MQ=255) gctgGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCg > 8:32636/1‑149 (MQ=255) ctgGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGcc < 2:43372/147‑1 (MQ=255) tgGCGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCGTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGCCTGCCGGc > 8:95154/1‑149 (MQ=255) tATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTa > 3:365060/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTActt < 1:394860/148‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTActtct < 7:32636/149‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTActtct > 8:355434/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTActtctt > 7:58100/1‑149 (MQ=255) 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gCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCgctg > 4:351109/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCgctgct < 8:130261/149‑1 (MQ=255) ctgGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGctgctg < 3:308837/147‑1 (MQ=255) ctgGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTACGCGGTTCGCCGCTGCTGgc > 6:163652/1‑149 (MQ=255) aCTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAAtt < 7:37457/149‑1 (MQ=255) ccAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTc < 4:157386/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCctgct < 2:385063/149‑1 (MQ=255) gtggCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGt < 4:317598/148‑1 (MQ=255) tggCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTAt > 5:118940/1‑149 (MQ=255) ggCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTAt > 5:346825/1‑148 (MQ=255) gCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTa > 2:298296/1‑149 (MQ=255) gCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTa > 5:199649/1‑149 (MQ=255) gCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGAGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTa > 4:151974/1‑149 (MQ=255) gATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACg > 1:254733/1‑149 (MQ=255) gATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACg < 7:355434/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGACTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGgctcg > 2:315387/1‑149 (MQ=255) ccTGGGGGCTGTGGTCGGGGTTCTTCTGGGCCTTTGACGCCTGTTTCGCCTCCTGGTGGTGGATCGGATTGGTGGCGGCTAAGCTTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGgctc < 1:116808/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTATCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCTCTGCTGGCGCAATTGGTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCaa < 7:109022/149‑1 (MQ=255) gtgctgtgctCGGTCTTCTGCTGGCGCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCaaa < 5:163652/149‑1 (MQ=255) gtgctgtgctCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCaaa < 5:44113/149‑1 (MQ=255) tgtgctCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGtt > 5:170449/1‑149 (MQ=255) tgctCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTc < 3:151974/149‑1 (MQ=255) tgctCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTc < 4:119069/149‑1 (MQ=255) tCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCATGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTgg > 7:340837/1‑149 (MQ=255) ggTCTTCTTCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCa < 6:175574/149‑1 (MQ=255) 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5:211053/127‑1 (MQ=255) ccTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCtgt > 3:32903/1‑149 (MQ=255) cTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGTCTGCCGGCTA‑‑CGTGTAGTTCTTCCGGGGTTCGCCGCTGCTGGCGGACTTGTTCCTGCTGTTTTAGGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCtgtg < 3:331809/149‑1 (MQ=255) cTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTgg > 2:141281/1‑132 (MQ=255) cTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCtgtg > 3:256487/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCTGGGCATGGCTGGCGTGTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGGTGGCGCATTTGTTCGTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCTAAGGTTTCTGGCAGGTCGTCGGCCTgtgg < 4:67903/147‑1 (MQ=255) tctcGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGttcttc < 1:298296/147‑1 (MQ=255) tcGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCAGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGATTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCgg > 8:33397/1‑148 (MQ=255) cGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCGGGa < 8:58100/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCGGGa < 6:118940/148‑1 (MQ=255) catGGTGCTGCTGCGCATGGCTGCGGGCTA‑‑CGGGTACTTCTTCGGGGGTTCGCCGTGGCTGCCGAAATTTTTCCGGTGGATTTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCGGGATGc < 1:315387/145‑1 (MQ=255) | ATGGTGCTCGACCCCGACCTGCTGGAGCGCTATGGCCCGCGCTTCATCGACGGCCTGCTGGTAACTGCCAAGCTGGTGGCGATTTCCTTCAGCCTGGGTGCTGTGCTCGGTCTTCTGCTGGCCCTTGCACGCCTGTCTCGCAGCCTGGTGCTGCAGCGCATGGCTGCCGGCTA‑‑CGTGTACTTCTTCCGCGGTTCGCCGCTGCTGGCGCAATTGTTCCTGCTGTATTACGGCCTGGGCTCGCTCAAAGGTTTCTGGCAGGACGTCGGCCTGTGGTGGTTCTTCCGGGATGC > NC_002947/4084599‑4084888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |