| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,664,248 | G→A | 8.1% | G134D (GGC→GAC) | nuoH → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,664,248 | 0 | G | A | 8.1% | 212.2 / 5.7 | 74 | G134D (GGC→GAC) | nuoH | NADH‑quinone oxidoreductase subunit H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/38); new base A (2/4); total (32/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.75e-01 | |||||||||||
CTGGCACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGTTGAGTAC > NC_002947/4664100‑4664393 | cTGGCACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGACATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCgg > 6:236663/1‑149 (MQ=255) ggCACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCt > 7:203684/1‑149 (MQ=255) gCACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTg < 2:239352/149‑1 (MQ=255) gCACCGGGAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTg < 8:162299/149‑1 (MQ=255) cACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTgg < 5:53465/149‑1 (MQ=255) ggTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGgtcgt < 5:84111/149‑1 (MQ=255) ggTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGgtcgt < 3:379564/149‑1 (MQ=255) ggTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTGCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGgtcgt < 2:305639/149‑1 (MQ=255) gTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGgtcgtc < 5:329384/149‑1 (MQ=255) gCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGaacaa < 3:270187/149‑1 (MQ=255) gCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGaac > 8:19896/1‑147 (MQ=255) gCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGaac < 7:19896/147‑1 (MQ=255) ccATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGaacaac < 7:103799/149‑1 (MQ=255) ccATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGACGACCAGCCGGCGaacagc < 1:71781/149‑3 (MQ=255) cATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTTGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGACGACCAGCCGGCGAacagca < 3:82218/149‑1 (MQ=255) aTGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAAcaacaa < 7:31307/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTAc > 3:221951/1‑149 (MQ=255) gATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTgg > 6:381025/1‑149 (MQ=255) gATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGACCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTgg > 7:209200/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑CTACGCCCGCTGCTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTggg > 2:72122/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACATGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTAGACATGGACGGCCTGTCGTTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTggg > 7:307523/1‑149 (MQ=255) gCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCa < 2:235628/148‑1 (MQ=255) ccTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGc > 5:11894/1‑149 (MQ=255) ggTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTg > 6:74006/1‑149 (MQ=255) aTCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTc < 1:199400/149‑1 (MQ=255) tCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGACGACCAGCCGGCGaaca < 7:279237/114‑1 (MQ=255) tCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGACGACCAGCCGGCGaaca > 8:279237/1‑114 (MQ=255) aCCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAGGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGa < 5:225108/148‑1 (MQ=255) ccccGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGAcc > 5:54163/1‑149 (MQ=255) ccccGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTGCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTCCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTGCCGTGCTTCGGCACAgc > 6:212784/1‑146 (MQ=255) cccGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCg > 3:92812/1‑149 (MQ=255) cccGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCg > 5:166392/1‑149 (MQ=255) gggCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCCTGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGGCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTAc < 1:187181/148‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGaa < 6:54163/149‑1 (MQ=255) cGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTcc > 7:194529/1‑149 (MQ=255) ccTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTgg < 1:3181/149‑1 (MQ=255) cTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTgg < 8:194529/148‑1 (MQ=255) tGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGATAGTTCCCCGGCTGGTCGTCGAACAACAATTTCGCCCTGCTGGGCATGTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTAACAACTTTTCCTggg > 1:107833/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGgc > 1:142307/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGgcg < 8:203684/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGgcgc < 7:303226/148‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCt < 8:90682/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACTCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCt > 5:261755/1‑148 (MQ=255) gCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCt > 3:293306/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGa < 6:166392/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGa > 8:56156/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGAt > 3:291555/1‑149 (MQ=255) ctgTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTATCGCGGTGCT‑GTTCGCCGACTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATgg > 1:257260/1‑149 (MQ=255) ctgTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATgg < 5:236663/148‑1 (MQ=255) tgTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGc > 7:187035/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCgtggt > 7:72358/1‑149 (MQ=255) cttcGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCgtggtg < 6:261755/148‑1 (MQ=255) ttcGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCATGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCgtggtggt > 6:101808/1‑149 (MQ=255) cGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGACTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCgtggtggt < 2:257260/147‑1 (MQ=255) gCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGcc < 6:154551/124‑1 (MQ=255) gCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGcc > 5:154551/1‑124 (MQ=255) gCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGc < 6:11894/148‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGt < 5:74006/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGt < 6:355307/149‑1 (MQ=255) ggccggccTGTCGGGCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTgg < 4:221951/149‑1 (MQ=255) ccggccTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGgt < 8:209200/149‑1 (MQ=255) cggccTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGgtt > 3:367236/1‑149 (MQ=255) cTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTACGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGATCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGgttcgt > 1:98484/1‑148 (MQ=255) tGTAGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACTAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAg < 4:139106/137‑1 (MQ=255) gTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGgttcgttc > 2:163951/1‑148 (MQ=255) tCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTTCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCa < 5:101808/148‑1 (MQ=255) tCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGgttcgttc < 2:107833/147‑1 (MQ=255) cgcgGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATgcgc < 2:142307/148‑1 (MQ=255) cgcgGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATgcgc < 1:72122/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGtt < 6:42871/147‑1 (MQ=255) ttCGCCGGCTGGTCGGCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGtt < 4:293306/147‑1 (MQ=255) gCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGTTGAGTa > 5:69472/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGTTGAGTAc > 4:133655/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGc > 8:147077/1‑100 (MQ=255) cGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGc < 7:147077/100‑1 (MQ=255) | CTGGCACCGGTAGTGGCCATGAGCGCCCTGCTGATCGCCTTCGTGGTCATCCCGATCACCCCGACCTGGGGCGTTGCCGACCTGAACATCGGCCTGCTGTTCTTCTTCGCCATGGCCGGCCTGTCGGTCTA‑CGCGGTGCT‑GTTCGCCGGCTGGTCGTCGAACAACAAGTACGCCCTGCTGGGCAGCTTGCGTGCTTCGGCACAGACCGTGTCGTACGAAGTGTTCCTGGGCCTGGCGCTGATGGGCGTGGTGGTGCAGGTGGGTTCGTTCAACATGCGCGACATCGTTGAGTAC > NC_002947/4664100‑4664393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |