| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,704,244 | T→C | 5.0% | H307R (CAT→CGT) | kdpA ← | potassium‑transporting ATPase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,704,244 | 0 | T | C | 5.0% | 231.9 / 2.1 | 79 | H307R (CAT→CGT) | kdpA | potassium‑transporting ATPase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/37); new base C (2/2); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
GTCGTGCATGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATCGATGCCACCTC > NC_002947/4704096‑4704389 | gTCGTGCATGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGAt < 4:340977/149‑1 (MQ=255) tCGTGCATGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATg > 2:229435/1‑149 (MQ=255) tGCATGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTc > 2:182620/1‑149 (MQ=255) aTGGCGTTGACCGAACCGTTCGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACAGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGACAGTTTCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGATCGGCTGATGCTCGGa > 3:329534/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGAc < 5:279062/149‑1 (MQ=255) gTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACcaca < 4:363318/149‑1 (MQ=255) cGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGAGGACTGTTGCACCTGCGTGCATACCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGCACCACAGCGC‑CGagctg > 4:319075/1‑149 (MQ=255) gTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGtgctgc < 1:182620/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGa > 5:200450/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCGAGGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGAt < 1:272860/149‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCa < 1:171106/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGTGACCGCCCACATCAGCGTACCGGTGGTACGGAAGGGGCTTTCCTTGCCCTCGAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAgg < 8:219698/149‑1 (MQ=255) gtggtgACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAg > 7:74557/1‑149 (MQ=255) gtggtgACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAg > 7:79929/1‑149 (MQ=255) tggtgACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAgg < 1:64362/149‑1 (MQ=255) tgACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGc > 2:311105/1‑148 (MQ=255) gACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCaa < 8:184349/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCaa < 3:39156/148‑1 (MQ=255) ccGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGACGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAg > 5:366801/1‑148 (MQ=255) cacaGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCa < 5:397864/149‑1 (MQ=255) caGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAgg < 1:311105/149‑1 (MQ=255) caGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAgg > 2:301572/1‑149 (MQ=255) cACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGa < 3:336057/149‑1 (MQ=255) aCCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACa > 4:46555/1‑130 (MQ=255) aCCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACa < 3:46555/130‑1 (MQ=255) aCCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAg > 4:315053/1‑149 (MQ=255) cGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGa > 7:13772/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGgcg > 7:244297/1‑149 (MQ=255) tggtACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCgg < 8:13772/149‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGctct > 7:286207/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGAc > 7:55238/1‑149 (MQ=255) gCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCa < 1:229435/149‑1 (MQ=255) cGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAg < 8:55238/149‑1 (MQ=255) cTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTc > 8:99359/1‑149 (MQ=255) tttCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTcc > 4:267544/1‑149 (MQ=255) tttCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGACGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTcc > 4:274855/1‑149 (MQ=255) tCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCt < 8:286207/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCtt < 1:45719/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCtt > 2:197809/1‑148 (MQ=255) ccTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCtt < 3:315053/148‑1 (MQ=255) cTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTc < 2:237033/148‑1 (MQ=255) ttGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCAc > 8:33854/1‑149 (MQ=255) gCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCGG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCAGCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGCCGCAGGTCCtggccgt > 8:289691/1‑143 (MQ=255) gCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCAc < 4:66671/147‑1 (MQ=255) cTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGt < 3:267544/149‑1 (MQ=255) tCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTAGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGt > 2:296153/1‑148 (MQ=255) ccAGAGGGGCGGTCTGTTGCAGCTGCGTGCTTTCGTGGGCCG‑GGTGCGGCTGATGCTCTGACCACAGCGC‑CGGGCTGCCACCGTTCAGGATGACGGGATGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTGTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGa < 4:329534/149‑1 (MQ=255) agGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTa < 3:221937/141‑1 (MQ=255) agGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCg > 2:320081/1‑148 (MQ=255) agGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCg > 4:123209/1‑148 (MQ=255) gggCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAg < 6:200450/149‑1 (MQ=255) gggCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAg < 7:33854/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAgg < 6:220471/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTCACGCAGGTCCTTCACCTAGTGACCGAAGGacaaca > 1:36847/1‑149 (MQ=255) tGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAacac > 3:150439/1‑149 (MQ=255) gTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGGCCGAAGGTGAacac > 3:339187/1‑148 (MQ=255) ttGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCa < 8:79929/149‑1 (MQ=255) tGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCa < 8:74557/148‑1 (MQ=255) cACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATg > 8:294815/1‑149 (MQ=255) 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cTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCa > 5:341224/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTACTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAAt < 3:354574/145‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTACTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAAt > 4:354574/1‑145 (MQ=255) gTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTg > 3:60921/1‑148 (MQ=255) gCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGaa > 6:262557/1‑149 (MQ=255) 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cAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGga < 8:244297/149‑1 (MQ=255) gCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGgatgat < 7:294815/149‑1 (MQ=255) ccG‑GGTTCGGCTGACGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATc < 6:366801/149‑1 (MQ=255) ttCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATCGATGc > 8:37885/1‑149 (MQ=255) ttCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATCGATGc > 2:267131/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATCGATGCCACCTc < 4:150439/147‑1 (MQ=255) | GTCGTGCATGGCGTTGACCGAACCGTTGGAGGCAGCGGTGGTGGTGACCGCCCACAGCACCGAACCGGTGGTACCGAAGCGGCTTTCCTTGCCCTCCAGAGGGGCGGTCTGTTGCACCTGCGTGCTTTCCAGGGCCG‑GGTTCGGCTGATGCTCGGACCACAGCGC‑CGTGCTGCCACCGATCAGGAACAGGGCAAGCATGCAGGCGAGGATGGCGCGGCTCTGACGCAGGTCCTTCACGTAGTGACCGAAGGTGAACACCAATGCCACTGGAATGAGGATGATCGATGCCACCTC > NC_002947/4704096‑4704389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |