| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 338,068 | A→C | 8.8% | S167R (AGT→AGG) | PP_0280 ← | amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 338,068 | 0 | A | C | 8.8% | 196.4 / 9.4 | 68 | S167R (AGT→AGG) | PP_0280 | amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/31); new base C (2/4); total (33/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
AAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGCCTGC > NC_002947/337928‑338215 | aaGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGcca < 4:163410/148‑2 (MQ=255)aaGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCtt < 8:60189/149‑1 (MQ=255)aaGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAACATGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGAATTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGcca < 7:196350/148‑2 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGTAAGAGATCACCTGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATATCCACCGGCTGGTAGGTGCGGGCGATGATGTTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGTCCAGGGCACTGGCCTTGa < 4:120309/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGccagta < 1:66569/149‑5 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa < 7:30464/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGACCTTGa < 6:181057/149‑1 (MQ=255) ccTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCATGAg > 6:38854/1‑149 (MQ=255) ttGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCa > 8:65272/1‑149 (MQ=255) cACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCa < 5:312457/149‑1 (MQ=255) aCCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAg > 2:23851/1‑149 (MQ=255) aGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGAt < 5:321055/149‑1 (MQ=255) gCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATc < 5:371865/149‑1 (MQ=255) aTGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGccag < 8:301044/134‑3 (MQ=255) aTGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGccag > 7:301044/1‑132 (MQ=255) aaCGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑c > 6:70754/1‑149 (MQ=255) aCGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑Cg > 8:285437/1‑149 (MQ=255) gaTCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGc > 5:78932/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTa > 2:15742/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGcc > 3:13687/1‑148 (MQ=255) gCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCt < 6:16971/132‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCt > 5:16971/1‑132 (MQ=255) gCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGGACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGa < 1:43253/149‑1 (MQ=255) ggcgAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATgcgc < 1:23851/149‑1 (MQ=255) aagaagATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAgc > 6:328201/1‑149 (MQ=255) gaagaTTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCa < 4:91737/104‑1 (MQ=255) gaagaTTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCa > 3:91737/1‑104 (MQ=255) gaagaTTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAgcgc < 2:175660/149‑1 (MQ=255) aagaTTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGcgcg > 1:229518/1‑149 (MQ=255) tttCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATgcgcgc < 7:293494/139‑1 (MQ=255) tttCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATgcgcgc > 8:293494/1‑139 (MQ=255) tCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCATGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGgca < 5:38854/148‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATc < 5:388373/94‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATc > 6:388373/1‑94 (MQ=255) cACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGgcagca > 1:330810/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCatg < 7:65272/149‑1 (MQ=255) ggtaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAg < 7:285437/149‑1 (MQ=255) gtaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAg > 6:383221/1‑148 (MQ=255) gtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAg > 2:202512/1‑149 (MQ=255) gCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCg > 1:242547/1‑149 (MQ=255) gatgatGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGc > 4:100760/1‑149 (MQ=255) gatgatGGTACGGGCCATGCCAGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGc > 8:224743/1‑149 (MQ=255) ggTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGtt < 7:119846/139‑1 (MQ=255) ggTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGtt > 8:119846/1‑139 (MQ=255) tACGGGCAATGCCGGTCAGTTCCATCATGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGATGTACGCCGGCAGGCAGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGAAGTATGTAGCACAGCGGGTTGCCACGCGa > 8:82394/1‑148 (MQ=255) cGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACAt < 4:13687/149‑1 (MQ=255) gggCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATg > 8:45668/1‑149 (MQ=255) ggCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGc < 1:385682/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACa < 1:200606/126‑1 (MQ=255) ccATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACa > 2:200606/1‑126 (MQ=255) tGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAgc < 7:39983/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGcc > 4:211684/1‑149 (MQ=255) ggTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGccc < 6:78932/149‑1 (MQ=255) ggTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGGACTGGCCAGTGCACGGGCCTTGAGCCTCAGGATCACTT‑CGGTGCGGTAAGCCGGCAGGCCGATGCTCGCAGCGCGTTGCAGCCTGAGGTAGAACAGCGTTTTGCCCCGCGACATGCCCAGCGccc < 7:82394/149‑1 (MQ=255) tCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGt > 7:114553/1‑149 (MQ=255) tCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGt < 5:70754/149‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGc > 3:26906/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGGCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCg > 2:257512/1‑149 (MQ=255) gggTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAAtc < 2:330810/149‑1 (MQ=255) gggTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCGGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAAtc < 5:328201/149‑1 (MQ=255) ggTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAAtc > 7:150544/1‑148 (MQ=255) tCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCa > 1:51562/1‑149 (MQ=255) cACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCAc < 3:100760/149‑1 (MQ=255) gTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCttt < 2:229518/149‑1 (MQ=255) tcaaggCCAGTGCCCTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCtt > 2:6164/5‑147 (MQ=255) tACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCtt > 1:375899/1‑147 (MQ=255) tACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTa < 2:242547/149‑1 (MQ=255) cACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGCCTGc < 5:343923/149‑1 (MQ=255) | AAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTT‑CGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGCCTGC > NC_002947/337928‑338215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |