Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,928,017 | A→G | 7.0% | S719P (TCC→CCC) | cheA ← | chemotaxis histidine kinase CheA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,928,017 | 0 | A | G | 7.0% | 198.9 / 4.8 | 71 | S719P (TCC→CCC) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/36); new base G (3/2); total (33/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
CCTTGACTGCCATAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTCGTGCAC > NC_002947/4927869‑4928161 | ccTTCACTGCCATAAACACTCCATTCGGCGGCCCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGa < 5:264031/149‑1 (MQ=255) cTTGACTGCCATAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGCGCGCGCCACCGAAATCAAATACCCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATCCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGa > 7:125178/1‑148 (MQ=255) tGACTGCCATAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACAt > 8:94018/1‑149 (MQ=255) cATAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCg‑gg < 8:55941/149‑1 (MQ=255) aTAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCg‑ggg < 2:300530/149‑1 (MQ=255) tAAACACTCCATTAGTCGGAGCAACCAGCCAGGGCGCGCCACCGAACTCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGt < 1:264599/149‑1 (MQ=255) tAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGGCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGGCATGTCCg‑gggc < 5:63616/149‑2 (MQ=255) aaaCACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGCTTCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGt < 1:117935/149‑1 (MQ=255) tCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTg > 2:384596/1‑148 (MQ=255) cATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTgcag < 5:306940/149‑1 (MQ=255) cATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTgca < 4:40330/148‑1 (MQ=255) aTTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTgcag > 5:33014/1‑148 (MQ=255) ttAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGAACATGCCCG‑GGGTGCCTTgcagca > 7:167011/1‑149 (MQ=255) ggcggcGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGGCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATc < 7:253594/148‑1 (MQ=255) gcggcgCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCtt > 7:82730/1‑149 (MQ=255) gcggcgCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCtt > 1:255591/1‑149 (MQ=255) cggcgCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTg < 7:94018/149‑1 (MQ=255) gcAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGcc > 8:156291/1‑147 (MQ=255) cccGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCgg > 7:148355/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGc < 1:384596/149‑1 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGGCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGc < 8:82730/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTtg < 7:203388/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCGCGGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTtg < 1:246165/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGAACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTtgat < 8:167011/149‑1 (MQ=255) gcgcCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCa > 6:260203/1‑149 (MQ=255) cACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCActtc > 5:319234/1‑149 (MQ=255) aCCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCActtct < 5:260203/149‑1 (MQ=255) cGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACttcttc > 1:179954/1‑149 (MQ=255) aTCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTgg < 8:148355/149‑1 (MQ=255) tCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGc < 8:319163/149‑1 (MQ=255) tCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGc < 8:269953/149‑1 (MQ=255) aaaTACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGccc > 6:281087/1‑149 (MQ=255) aaaTACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGcc > 2:255609/1‑148 (MQ=255) aaaTACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGcc > 8:182763/1‑148 (MQ=255) tACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCccacc < 1:249500/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCccacca < 7:182763/148‑1 (MQ=255) cgccgcGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCccacca < 6:140345/148‑1 (MQ=255) gccgcGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGt < 1:316122/149‑1 (MQ=255) gccgcGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGt > 3:339558/1‑149 (MQ=255) gcgcgGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTgg > 1:201262/1‑149 (MQ=255) cgTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTcgacg < 2:178627/149‑1 (MQ=255) cGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACaaa < 6:319234/149‑1 (MQ=255) gAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCg < 5:199194/148‑1 (MQ=255) aGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGAt < 6:33014/149‑1 (MQ=255) cGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTggg > 8:178065/1‑149 (MQ=255) gggACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTggg < 1:327393/148‑1 (MQ=255) gggACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTgg < 7:156291/147‑1 (MQ=255) cGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGccg < 2:255591/149‑1 (MQ=255) gTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGccga > 1:44701/1‑149 (MQ=255) gagaATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTgg < 3:378229/139‑1 (MQ=255) gagaATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTgg > 4:378229/1‑139 (MQ=255) gagaATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGccgaccg > 6:189176/1‑149 (MQ=255) aaTCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACa < 5:281087/149‑1 (MQ=255) tCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTgg < 4:183557/134‑1 (MQ=255) tCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTgg > 3:183557/1‑134 (MQ=255) aaCGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGAGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAAt > 8:344503/1‑149 (MQ=255) actcgATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGacagacagcag > 8:167236/4‑145 (MQ=255) aCGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAAt > 2:87507/1‑148 (MQ=255) aCGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATc < 2:179954/149‑1 (MQ=255) cgcgATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATca < 7:178065/149‑1 (MQ=255) cgcgATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATca > 2:79930/1‑149 (MQ=255) caTGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCAGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATcacca > 4:131574/2‑149 (MQ=255) gCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGt > 2:222063/1‑149 (MQ=255) cGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTg < 2:201262/149‑1 (MQ=255) gCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCg < 3:131574/148‑1 (MQ=255) ccGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGtg < 2:44701/149‑1 (MQ=255) gTAATGGTGGCCCCGGGCATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGtgctg > 3:115177/1‑149 (MQ=255) gTAATGGTGGCCCCGGGCATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGtgctg < 4:115177/149‑1 (MQ=255) caaggcaccccGGGCATGTCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGctc > 6:382317/8‑149 (MQ=255) gtggCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTc > 5:6463/1‑149 (MQ=255) accccGGGCATGTCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTCGTg > 4:97424/2‑149 (MQ=255) ccGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTCGTGCAc > 5:52606/1‑149 (MQ=255) ccGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTCGTGCAc > 8:239885/1‑149 (MQ=255) | CCTTGACTGCCATAAACACTCCATTAGGCGGCGCAACCCGCCAGGGCGCGCCACCGAAATCAAATACGCCGCGCGGCGTAACGCTTGAGCATGC‑TCGGGACGTCGAGAATCAACGCGATGCGACCGTCGCCGGTAATGGTGGCCCCGGACATGCCCG‑GGGTGCCTTGCAGCATCTTGCCCAGCGGCTTGATGACCACTTCTTCCTGGCCCACCAGTTGGTCGACGACAAAACCGATGCGCTGGGTGCCGACCGACAGAATCACCACGTGGCCCTCGTGCTGCTCTTCGTGCAC > NC_002947/4927869‑4928161 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |