| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,981,916 | T→C | 6.3% | A12A (GCA→GCG) | flgE ← | flagellar hook protein FlgE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,981,916 | 0 | T | C | 6.3% | 179.7 / 2.3 | 63 | A12A (GCA→GCG) | flgE | flagellar hook protein FlgE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/30); new base C (2/2); total (31/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
TTACCCCGGTGCCGATCACGGTCTTGCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAACCGTTGCTACC > NC_002947/4981768‑4982063 | ttACCCCGGTGCCGATCACGGTCTTGCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTtgct > 3:109905/1‑149 (MQ=255) ccGATCACGGTCTTGCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGcc > 3:2025/1‑149 (MQ=255) tCTTGCCCGCGCTGGTTCCGCGAATGCAGTTGGAGTACTGGGCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCg < 2:371473/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGata‑t > 2:370019/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGat < 1:239910/147‑1 (MQ=255) gCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGa < 3:225854/146‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑tt > 6:259174/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑tt > 4:366900/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑tt > 7:108397/1‑148 (MQ=255) gTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CAt < 5:81398/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CAtgtg > 1:140581/1‑149 (MQ=255) ccGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CAtgt < 6:45991/148‑1 (MQ=255) gcgAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCTGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCTATA‑TTGAAAGA‑CATgtgt > 6:317431/1‑148 (MQ=255) cgAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGGCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTaa < 8:39358/149‑1 (MQ=255) aTGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTTAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTc < 5:269349/149‑1 (MQ=255) gtACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTg < 5:259174/149‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTCGCAATGATGTTGCCGGAAACGTTCAGGGCCTGGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGC‑CATGTGTTACTCCTGTAGTTTTGCt > 7:291006/1‑147 (MQ=255) gTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAgg > 4:317617/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGAGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGATGCCTGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAGAGA‑CATGTGTAACACCTGTCGTTTTGCTCAgg > 2:253687/1‑149 (MQ=255) tCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGc > 2:280728/1‑149 (MQ=255) tCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGc > 2:111759/1‑149 (MQ=255) ggCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCg < 4:2025/149‑1 (MQ=255) gCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGc < 3:385547/85‑1 (MQ=255) gCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGc > 4:385547/1‑85 (MQ=255) cACGCGACGACTTGAAGCCGGTTGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGACGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCAGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGAGCTAGATGCCGAt > 8:155561/1‑149 (MQ=255) aCGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATg > 8:115691/1‑149 (MQ=255) aCGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATg < 3:366900/149‑1 (MQ=255) aCGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCCGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATg > 2:316047/1‑149 (MQ=255) cgacgaCTTGAAGCCGGTGGTGGCAGCGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCtt < 6:219337/149‑1 (MQ=255) cgacgaCCTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCtt > 5:355656/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGaaa < 7:157335/93‑1 (MQ=255) ttGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGaaa > 8:157335/1‑93 (MQ=255) gAAGACGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGTTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAATGA‑CATGTGTAACTCTTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGAtttt < 1:75013/148‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTg < 8:108397/148‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTg < 6:355656/148‑1 (MQ=255) tgCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCGGGTAACGTTCTGGGCCTTGTTTGATGCATTTAGGCGGCTAAGGCCGATATTTTTTAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTg < 1:111759/147‑1 (MQ=255) agtcGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGa < 5:144005/146‑1 (MQ=255) gtggtgGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAgcg > 8:311678/1‑149 (MQ=255) ggtggCAACCTTGGCAATGATGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTCTAACTACTGTCGTTTTGCTCAGGCACTAGATGCCTATGCTTTGGATTTTGGAAAgcgc > 5:298016/1‑148 (MQ=255) gtggCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCaa < 1:370019/149‑1 (MQ=255) aCGTTTGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTTTTTGCTGGATAGACGCCGCTAATGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATTTGTAACTCCTGTCGTTTTTCTCATGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGc < 7:155561/149‑1 (MQ=255) gTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGcc > 2:228116/1‑148 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAg < 2:140581/148‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGc > 5:49729/1‑149 (MQ=255) aaTGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCCGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCg < 1:316047/149‑1 (MQ=255) ttgCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCa > 8:251262/1‑89 (MQ=255) ttgCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCa < 7:251262/89‑1 (MQ=255) ttgCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGt > 5:66922/1‑149 (MQ=255) ttgCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGt > 2:189409/1‑149 (MQ=255) ttgCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCCCTAAGTCCGAAA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCATCTCGTTTTGCTCAGGCCCTACATTCCCATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGCCCACGt > 7:65364/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTAACCGTCAGCGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTCAGCCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTCTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGtt < 4:109905/148‑1 (MQ=255) gCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑GATGTGTAACTCCTGTAGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGtt < 1:253687/148‑1 (MQ=255) ccGGTATAGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCTCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGT‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATTCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGa < 3:90377/149‑1 (MQ=255) ccGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGa < 4:291398/149‑1 (MQ=255) actttCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGACGCCGCTAAGTCCGATA‑TTGATAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTGTTGCTCTGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTc < 6:298016/145‑1 (MQ=255) aCGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTc < 3:317617/148‑1 (MQ=255) gTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGAGCATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCAt > 1:96976/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCAtc > 8:68073/1‑149 (MQ=255) ttCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCAtct > 2:27800/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGaa > 6:19390/1‑149 (MQ=255) gCCTTGTTTGCCGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAAc > 4:82699/1‑149 (MQ=255) ccTTGTTTGCCGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAAcc < 3:82699/149‑1 (MQ=255) gTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAACCGtt < 7:115691/148‑1 (MQ=255) tttGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAACCGTTg < 6:49729/148‑1 (MQ=255) ctgcATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAACCGTTGCTAcc > 6:133840/1‑149 (MQ=255) tgcATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCTAGGTAGCATACCAACCCCGCCAGGTTGATCGTAATATACGAACCGTTgatta > 1:324638/1‑144 (MQ=255) | TTACCCCGGTGCCGATCACGGTCTTGCCCGCGCTGGTGCCGCGAATGGAGTTGGAGTACTGGTCGGCGAACTCGGCACGCGACGACTTGAAGCCGGTGGTGGCAACGTTGGCAATGTTGTTGCCGGTAACGTTCAGGGCCTTGTTTGCTGCATAGAGGCCGCTAAGGCCGATA‑TTGAAAGA‑CATGTGTAACTCCTGTCGTTTTGCTCAGGCCCTAGATGCCGATGCTTTGGATTTTGGAAAGCGCAACA‑CTGCCCAGCCCGGCCAGGTTGAGCGTCATCTCCGAACCGTTGCTACC > NC_002947/4981768‑4982063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |