| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,166,531 | A→G | 5.9% | L450P (CTG→CCG) ‡ | hrpA ← | ATP‑dependent helicase HrpA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,166,531 | 0 | A | G | 5.9% | 247.1 / 4.5 | 84 | L450P (CTG→CCG) ‡ | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/38); new base G (2/3); total (43/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 | |||||||||||
ATCGGCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGCCTTTA > NC_002947/5166387‑5166677 | aTCGGCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGgcg < 1:373274/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCTGGgcgc > 4:69065/1‑148 (MQ=255) cGGCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGgcg > 1:8644/1‑147 (MQ=255) ggCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGgcgc > 1:7747/1‑147 (MQ=255) ggCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTCGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGgcgc < 2:7747/147‑1 (MQ=255) gCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTCGACTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGgcg > 1:117853/1‑147 (MQ=255) gcgcgcCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCTGGGCGCaatcgat < 3:69065/149‑7 (MQ=255) gcgcgcCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCAGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCTGGGCGCaatcgat < 4:104780/149‑7 (MQ=255) gcCAATTGGCCGCCAGTTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACAt > 2:209091/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCt > 8:35171/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTg < 2:118072/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCTGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGc < 2:253879/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCa < 3:131414/149‑1 (MQ=255) gcggcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAgg < 6:52761/148‑1 (MQ=255) cggcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGAt < 2:260419/149‑1 (MQ=255) ggcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGAt > 1:357668/1‑148 (MQ=255) ggcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGAt > 8:142203/1‑148 (MQ=255) ggcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑ATGCAAAACGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATACGGCGGCTCGATGAACGCCAACGCATCGATTGAGCCCAGGCGCAGGTGAAACAACTGCACGaa > 5:235697/1‑147 (MQ=255) gcCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGTCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAATGAATCGTTTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTTCAGGATCa < 5:151999/149‑1 (MQ=255) ccAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCCCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCAc < 5:39848/149‑1 (MQ=255) aaTTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCAccg < 8:159966/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATAGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCAccgcc > 3:257318/1‑149 (MQ=255) cGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCTGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCa < 2:117853/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAg < 7:35171/149‑1 (MQ=255) tGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGt < 2:357668/149‑1 (MQ=255) gTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAGCGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGt < 3:174325/147‑1 (MQ=255) gTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGt < 1:209091/147‑1 (MQ=255) gTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTg < 7:151490/148‑1 (MQ=255) tcGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTgcg > 3:51051/1‑146 (MQ=255) gcgGTAAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCa < 6:305779/146‑1 (MQ=255) tAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTcc > 8:115700/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCg > 1:18777/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCgg < 4:59197/149‑1 (MQ=255) ccgccgAAAGCAC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCggg > 1:194126/1‑149 (MQ=255) ccgAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCg < 3:204716/149‑1 (MQ=255) cgAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGc < 6:5051/106‑1 (MQ=255) cgAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGc > 5:5051/1‑106 (MQ=255) cgAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCgg < 7:142203/149‑1 (MQ=255) tC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGc > 8:190767/1‑149 (MQ=255) tC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGACATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGACCAGGCGCAGGTGCATCATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCTGAAACTCCGCGTCGGAAAACGc > 8:319401/1‑149 (MQ=255) gCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTg < 1:186758/116‑1 (MQ=255) gCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTg > 2:186758/1‑116 (MQ=255) aCAGGTT‑AAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGc > 1:345200/1‑149 (MQ=255) aGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCt < 7:115700/149‑1 (MQ=255) aGGTGGAAGCCGTCGCTGATTGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGATCTGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCGGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCt < 6:235697/149‑1 (MQ=255) gTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCGGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGt > 1:33744/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAAtctc < 7:181108/123‑1 (MQ=255) gTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAAtctc > 8:181108/1‑123 (MQ=255) gTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGt > 3:335140/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGt > 3:331171/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGtt < 4:51051/149‑1 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tGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCg > 5:141313/1‑149 (MQ=255) aTGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCt < 7:298650/149‑1 (MQ=255) gCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTa < 2:33744/149‑1 (MQ=255) gCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGac > 7:312177/1‑149 (MQ=255) cATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGacgc < 5:173351/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGGAGGTGCAACATCTGCAGCATCACCCCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACCCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGacgcacg > 5:262766/1‑149 (MQ=255) tCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGcc > 8:207351/1‑149 (MQ=255) tCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGcc > 8:321399/1‑149 (MQ=255) tGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCgg > 6:36111/1‑148 (MQ=255) cGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGa > 8:117355/1‑149 (MQ=255) gggAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGAc > 3:158082/1‑149 (MQ=255) aaGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCg < 7:190767/149‑1 (MQ=255) ggCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGc > 7:77400/1‑149 (MQ=255) ggCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGc > 3:364858/1‑149 (MQ=255) cATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCg > 5:122687/1‑149 (MQ=255) aTCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCg > 1:282655/1‑148 (MQ=255) aTCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCg > 8:68962/1‑148 (MQ=255) aTCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCg > 2:393434/1‑148 (MQ=255) aTCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGc < 6:141313/149‑1 (MQ=255) acctGCGCCTGGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTa < 6:360667/108‑1 (MQ=255) acctGCGCCTGGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTa > 5:360667/4‑111 (MQ=255) aTTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGCTTGGTTCGCAGAATCTCCGTGTCGGTAAAGGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACg < 4:257318/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACgg > 2:19227/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGc < 6:19656/148‑1 (MQ=255) cccAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCCCCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGGCGGCTGTAGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGCCGCACGCTAATGCGCGGCTATACCCGGCCGCAACGGccat > 5:297971/1‑146 (MQ=255) cccAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGCCttt < 7:117355/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGCCTTTa > 7:227238/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGGCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATTCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGCCTTTa < 7:319401/149‑1 (MQ=255) | ATCGGCAAGCGCGCCAACTGGCGGCCAATTGGCGTCAGCTGGTTCTCGCGGTTAACCGCCGAAAGCTC‑‑CTGCAACAGGTTGAAGCCGTCGCTGATGGCTTTGCCATCCGGCGGCTCGATGAACGGGAAGGCATCGATTGCGCCCAGGCGCAGGTGCAACATCTGCAGGATCACCGCCGCCAGGTTGGTGCGCAGAATCTCCGGGTCGGTAAACGCTGGCCGGCTGTTGAAGTCCTCTTCGCTGTAGAGACGCACGCAAATGCCCGGCTCGACCCGGCCGCAACGGCCTTTA > NC_002947/5166387‑5166677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |