| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 48,873 | C→A | 6.0% | D168Y (GAC→TAC) ‡ | czcA‑I ← | cation efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 48,873 | 0 | C | A | 6.0% | 303.8 / 6.9 | 100 | D168Y (GAC→TAC) ‡ | czcA‑I | cation efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/48); new base A (3/3); total (49/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AACGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTGGCAGCTGTTC > NC_002947/48725‑49020 | aaCGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCCATGGTATTGATATCGGCCACACACGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTc > 7:176341/1‑149 (MQ=255) cGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCt < 7:343420/149‑1 (MQ=255) cTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑gg < 1:58416/149‑1 (MQ=255) cTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGATTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGAGCAACCAGTAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTTATCTCTGCCACACACGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑gg < 6:382763/149‑1 (MQ=255) gACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCa > 2:52765/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAc > 5:45746/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCCGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAc > 7:112243/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATTAcg > 2:107521/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAcg > 6:91083/1‑149 (MQ=255) cAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTATCCAGGCGCTTTGCATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTTATGATCAAGTCAT‑GGATCAcgc > 6:123285/1‑149 (MQ=255) cAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATCGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAcgc > 6:190910/1‑149 (MQ=255) acgTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTTCCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCGGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATGAcgcg < 4:34039/147‑1 (MQ=255) aGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCTGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAcgc < 5:322097/148‑1 (MQ=255) aGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCAcgc > 6:322097/1‑148 (MQ=255) aGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACT‑GGATCatcaa < 2:173909/149‑5 (MQ=255) tCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAg > 8:128113/1‑149 (MQ=255) cATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAgg > 2:302899/1‑149 (MQ=255) aTTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAggt > 5:79419/1‑149 (MQ=255) aGTGTCAGGATGTATGTAGGCAGGCGCTTTGGATCCGGCGGAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGAGGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAggtcggt < 3:307689/149‑1 (MQ=255) tgtCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGgtcggtcg > 8:35588/1‑149 (MQ=255) tgtCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGgtcggtcg < 1:302899/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGTTATCCAGGCGCTTTGTATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATTGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACTCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGtcggtcgg < 4:378912/148‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 6:221929/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 2:180252/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg > 3:158696/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 6:79419/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 7:27827/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg > 1:250084/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg > 7:14183/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATCGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 5:190910/149‑1 (MQ=255) aGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGgt < 7:35588/149‑1 (MQ=255) aGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACT‑GGATCatca > 5:242413/1‑130 (MQ=255) aGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACT‑GGATCatca < 6:242413/133‑4 (MQ=255) cTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGgtg > 3:150122/1‑148 (MQ=255) gtaggtagGCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTa < 6:101442/147‑1 (MQ=255) gtagCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCg > 7:150732/1‑148 (MQ=255) tagCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTCGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCg < 1:52765/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTTTGGATCCTGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑Acc < 2:314354/148‑1 (MQ=255) aGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTc > 7:329852/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTc > 4:29752/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGACGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTc < 4:28275/149‑1 (MQ=255) ggCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTcc < 2:298/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTAATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCct > 4:63361/1‑149 (MQ=255) gATCCGGCGCAACCAGGCACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGAcc > 3:361321/1‑149 (MQ=255) 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aGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGc > 5:399321/1‑149 (MQ=255) ttGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCCCACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCGTTGCCCGCGCCATCTGCGGCTTC‑AACAGt > 8:147826/1‑149 (MQ=255) ggCATACCCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGGCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAggc < 7:147826/148‑3 (MQ=255) ggCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGt < 8:176341/147‑1 (MQ=255) ggCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTc < 7:323270/148‑1 (MQ=255) gCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCca < 3:29752/149‑1 (MQ=255) gCATAACCGCAGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCca < 8:150732/149‑1 (MQ=255) cATAACCGCCGATTGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCTCCATCTTCg < 1:41941/134‑1 (MQ=255) cATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCg > 2:41941/1‑134 (MQ=255) cATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCcac < 4:158696/149‑1 (MQ=255) 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ccgccgATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCTATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGaa < 6:41338/149‑1 (MQ=255) ccgccgATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGaa < 8:39386/149‑1 (MQ=255) aTGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGAtctc < 6:399321/149‑1 (MQ=255) aTCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGcc > 3:145394/1‑149 (MQ=255) aTCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGcc > 7:301712/1‑149 (MQ=255) 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ggCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCgg < 6:326157/146‑1 (MQ=255) ccACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGAt < 4:276341/149‑1 (MQ=255) cacaCCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGgtcggtcg < 1:347377/65‑1 (MQ=255) cacaCCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGgtcggtcg > 2:347377/1‑65 (MQ=255) acCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCg > 6:285628/1‑149 (MQ=255) ccGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATCATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGa > 1:219706/1‑149 (MQ=255) ggACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGAccc < 5:285628/149‑1 (MQ=255) ttACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCGTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGGAGATCCCGTACCCAttcg > 8:173085/1‑146 (MQ=37) cGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGc < 6:27609/149‑1 (MQ=255) cGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGc < 8:112243/149‑1 (MQ=255) cAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCct < 4:150122/149‑1 (MQ=255) aGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCctc > 7:139610/1‑149 (MQ=255) aGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCctc > 6:62871/1‑149 (MQ=255) aGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGAGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCctc > 1:285268/1‑149 (MQ=255) gCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATTACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGGACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTGCGGCTTCTCACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCctc < 1:107521/149‑1 (MQ=37) aGGCTTGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTac < 8:14183/147‑1 (MQ=255) ttGATGATCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGAACGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGTAAGATCTAGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTc > 8:373970/1‑149 (MQ=255) tgaagaTCCAGTCCT‑GGATCTCGAGCAGGTCGGGCAGGGAGTACGTGGT‑AGCGTCCTCTTTGACCTCGCGATCTTCGGCTTC‑AACAGTCAACAGGAAGATCTCGCCGAGGCAGGTCGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCt < 8:368695/149‑1 (MQ=255) gtgatCCAGGACT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTgg > 1:244904/2‑149 (MQ=255) gatCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACCCCTTCTgg > 7:137752/1‑147 (MQ=255) tCCAGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTAACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTC‑AACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTGGCAg > 1:80110/1‑149 (MQ=255) aGTCCT‑GGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGT‑ACCGTCCTCttt < 4:300660/52‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |