Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,185,122 | C→T | 5.2% | L446L (CTG→CTA) | aceK ← | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,185,122 | 0 | C | T | 5.2% | 239.4 / 2.1 | 78 | L446L (CTG→CTA) | aceK | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/38); new base T (2/2); total (38/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
CGGAATGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGCCACCTCCA > NC_002947/5184978‑5185270 | cGGAATGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGc < 1:189704/149‑1 (MQ=255) ggAATGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCTAGGcc > 4:267689/1‑149 (MQ=255) ggAATGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCTAGGcc > 4:262383/1‑149 (MQ=255) aTGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTa < 7:229598/149‑1 (MQ=255) aTGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTa < 4:179992/149‑1 (MQ=255) tgtgGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAg < 3:309701/149‑1 (MQ=255) aTTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAgcg < 7:349983/149‑1 (MQ=255) aTTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAgcg > 4:324009/1‑149 (MQ=255) ttCACCTCGGACAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCCTAGAACACGACCCGGCCATCACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAgcgc < 8:172245/149‑1 (MQ=255) aCCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCCCCGCCAACTGCTTGATGGCAAGGCCTTAGTCCTCCAGCGCCTc > 2:89453/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTc > 5:294972/1‑148 (MQ=255) cTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCa < 3:174269/149‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAg > 3:254669/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCAAGCAc > 8:331443/1‑148 (MQ=255) aGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCTAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTg < 3:267689/149‑1 (MQ=255) aGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCTAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTg < 3:262383/149‑1 (MQ=255) ggAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCAAACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCAGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTgg > 4:258976/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGc > 4:240893/1‑149 (MQ=255) tattCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTGTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCg < 5:231407/145‑1 (MQ=255) tttCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGCTGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTg < 1:167931/149‑1 (MQ=255) tCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTg > 5:263750/1‑149 (MQ=255) cATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTg > 6:60763/1‑148 (MQ=255) aTAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGc < 1:334623/148‑1 (MQ=255) aTAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCCGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGc < 3:180873/148‑1 (MQ=255) aGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGcc < 1:235728/143‑1 (MQ=255) aGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGcc > 2:235728/1‑143 (MQ=255) aGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTc > 1:46359/1‑148 (MQ=255) gTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCa < 6:294972/149‑1 (MQ=255) tCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAg > 6:231796/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCaa > 5:100020/1‑149 (MQ=255) cccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCCCCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAAc > 8:197859/1‑149 (MQ=255) ccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCg < 7:291445/88‑1 (MQ=255) ccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCg > 8:291445/1‑88 (MQ=255) ccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTc > 4:106266/1‑132 (MQ=255) ccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTc < 3:106266/132‑1 (MQ=255) ccGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACg < 3:324009/149‑1 (MQ=255) gCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCg > 6:61245/1‑149 (MQ=255) cATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTc < 3:258976/149‑1 (MQ=255) aTGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCa < 1:89453/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATg < 5:60763/148‑1 (MQ=255) ggTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGcgcc < 6:99578/149‑1 (MQ=255) gTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAgg < 4:289231/129‑1 (MQ=255) gTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAgg > 3:289231/1‑129 (MQ=255) acacCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCt < 5:231796/148‑1 (MQ=255) cAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTc > 6:365531/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTc > 3:186288/1‑149 (MQ=255) aaaGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCCCCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCACCGGCGTCATGCGCCGCTCGGTc > 7:135769/1‑148 (MQ=255) ttcttcAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCGGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCaa > 6:25650/1‑147 (MQ=255) cAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGc > 5:211956/1‑149 (MQ=255) aGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGc < 2:46359/148‑1 (MQ=255) aGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGc < 3:240893/148‑1 (MQ=255) aGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGc < 6:340554/148‑1 (MQ=255) cAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGa > 6:379642/1‑149 (MQ=255) cAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGa > 2:128403/1‑149 (MQ=255) aaCATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGAt < 4:254669/149‑1 (MQ=255) aaCATGTCGCCGGCGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGAt < 7:349034/149‑1 (MQ=255) cATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCa < 4:186288/149‑1 (MQ=255) tGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGc > 3:354942/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCAc > 6:98558/1‑149 (MQ=255) gAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCgt < 1:272730/144‑1 (MQ=255) gAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCgt > 2:272730/1‑144 (MQ=255) gAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGc > 1:50832/1‑149 (MQ=255) aGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGccc > 2:385209/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTcc < 4:343913/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAg > 6:332923/1‑149 (MQ=255) cgccgccgcCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAgcg > 7:302409/1‑149 (MQ=255) ccgccAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCAcc < 7:331443/149‑1 (MQ=255) aaCTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGa > 6:187957/1‑149 (MQ=255) cTGCTTGATGGCCAGGGCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCa < 6:136672/140‑1 (MQ=255) cTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGACCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGCCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACCGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCa > 5:136672/1‑140 (MQ=255) cTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGgc < 5:98558/148‑1 (MQ=255) cTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGgc < 5:379642/148‑1 (MQ=255) gATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCAcc > 1:340268/1‑115 (MQ=255) gATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCAcc < 2:340268/115‑1 (MQ=255) gATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGgcgc < 2:50832/147‑1 (MQ=255) gATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGcc < 6:263750/148‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGCCACCt > 6:116158/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCTGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCATCGCCACCGTCGACGGCGCCACCTc < 5:25650/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGCCACCTc > 3:111029/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCTTGTACAGGTTCAACGGCGACATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGCCACCTCCa < 1:128403/149‑1 (MQ=255) | CGGAATGTGGCGGAAATTCACCTCGGTCAGGAAGCTGATTTCGTCATAGTCGTAGAACACGACCCGGCCATGACGGGTCACACCAAAGTTCTTCAGCAACATGTCGCCGGGGAAGATGTTCGCCGCCGCCAACTGCTTGATGGCCAGGCCGTAGTCCTCCAGCGCCTCCAGCACCTGGCCTTCGGTGGCCTGCTCCAGGTACAGGTTCAACGGCGTCATGCGCCGCTCGGTCCAACAGTGGCGGATCAGCACCGTGTCGCCCTCCAGCGCCACCGTCGACGGCGCCACCTCCA > NC_002947/5184978‑5185270 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |