Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,298,632 | A→C | 5.7% | R490R (CGT→CGG) | recD ← | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,298,632 | 0 | A | C | 5.7% | 267.1 / 7.2 | 88 | R490R (CGT→CGG) | recD | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/46); new base C (3/2); total (40/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.05e-01 |
GCGCCACCCGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGGCGGCGCGGCCAGCAG > NC_002947/5298484‑5298778 | gcgcCACCCGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTaa > 3:253405/1‑149 (MQ=255) gcCACCCGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACg < 6:191540/149‑1 (MQ=255) cACCCGCGCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGc < 6:213644/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGcc > 3:193425/1‑147 (MQ=255) cGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAg < 1:225924/149‑1 (MQ=255) cTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGTTACCGGccggcac < 2:312467/149‑6 (MQ=255) ttGAGGCCTTCTACAGCCCAGGCGGCCCGGCGCACCGCTAACAGCAAGTGGAAATCGTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCGTTTGCTCCCAGGCGGGGTAGTCATACGCGGTATCATGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTgcg < 3:343206/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGt < 6:370589/149‑1 (MQ=255) cTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCTCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAg > 8:306848/1‑149 (MQ=255) cacCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGACCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCgg > 6:9255/1‑149 (MQ=255) acCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGt < 6:356640/149‑1 (MQ=255) ccccAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTa < 5:6223/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCACCACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGGATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAg > 7:272970/1‑149 (MQ=255) cccAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAg > 6:287341/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGc > 6:255053/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGc‑c < 2:324763/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAGATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGCTACCTGCgcaccctt < 6:60838/149‑8 (MQ=255) ggCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑Ctt < 4:215571/149‑1 (MQ=255) gcCCCGTCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCg < 4:10653/149‑1 (MQ=255) gcCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCg < 8:53418/149‑1 (MQ=255) gcCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCg > 8:237707/1‑149 (MQ=255) gcCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCg < 5:9255/149‑1 (MQ=255) ccccGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCgg > 2:289671/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAAATGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGt > 2:100768/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTc < 3:370804/149‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACg < 7:282587/110‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACg > 8:282587/1‑110 (MQ=255) cgcACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATc < 4:193425/149‑1 (MQ=255) ccGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCAt > 4:381498/1‑144 (MQ=255) ccGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCAt < 3:381498/144‑1 (MQ=255) ccGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTa > 3:356751/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTa > 1:239984/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCCTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTa > 5:48615/1‑149 (MQ=255) cgcgCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTAc > 2:10227/1‑149 (MQ=255) 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aaCTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAg < 3:24274/149‑1 (MQ=255) aaCTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAg < 5:326173/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAgg < 4:356751/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAgg < 1:10227/149‑1 (MQ=255) ggAAATCATCAAAACTGCGCAACACATTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCg > 3:162231/1‑149 (MQ=255) 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cTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGt < 7:237707/148‑1 (MQ=255) tCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTaa > 8:309361/1‑149 (MQ=255) tCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTaa > 5:243685/1‑149 (MQ=255) tCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTaa > 2:319441/1‑149 (MQ=255) aaaaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTaa < 4:82349/76‑1 (MQ=255) aaaaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTaa < 7:309361/147‑1 (MQ=255) aaaaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACa < 6:288874/149‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTg < 1:13823/110‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCACAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTg > 2:13823/1‑110 (MQ=255) aaCTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAgg > 5:189643/1‑149 (MQ=255) tGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCgg > 2:248727/1‑149 (MQ=255) acacGTTGCCCGCCCATTGCTGCGAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAAc < 4:43301/149‑1 (MQ=255) 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gCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCGCCGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGt < 1:289671/148‑1 (MQ=255) gCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTg < 8:278543/148‑1 (MQ=255) cTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGc < 1:248727/148‑1 (MQ=255) cTCACAGGCGGGGGCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTAGAGTAACAGGTGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGc < 4:185148/148‑1 (MQ=255) ggCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAg > 3:28128/1‑99 (MQ=255) ggCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAg < 4:28128/99‑1 (MQ=255) 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ccttggccgtTACCGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGt < 2:81688/88‑1 (MQ=255) ccttggccgtTACCGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcg > 3:328180/5‑149 (MQ=255) ttggccgtTACCGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcgcg > 8:8096/3‑149 (MQ=255) ggccggTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCGATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcgcggc < 6:189643/149‑1 (MQ=255) gccggTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcgcggc > 2:123948/1‑148 (MQ=255) gTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGGCGGCGCGGCcag > 2:355703/1‑147 (MQ=255) tAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGCACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGGCGGCGCGGCcagcag > 3:31891/1‑149 (MQ=255) aCGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcgc < 3:157909/138‑1 (MQ=255) aCGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGgcggcgc > 4:157909/1‑138 (MQ=255) | GCGCCACCCGCTCGTTGAGGCCTTCGACACCCCAGGCGCCCCGGCGCACCGCGCACAGCAACTGGAAATCCTCAAAACTGCGCAACACCTTGCCCGCCCATTGCTCCCAGGCGGGGTCGTCAAAGGCGGTATCAAGTGCCGGCCGGTAACGGCCAAGGGTGCGCAGGTAGCTGCGGTAGC‑CTTGCGGTCCATCGGTACCG‑CGGTTCAGGCCGTCGAGTAACAGGCGGTCGAACGCACGATCCTGTTCGTGCTTGAGCGAAAGGCTGTGCACGTCGGCAGGCGGCGCGGCCAGCAG > NC_002947/5298484‑5298778 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |