Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,395,344 | A→G | 5.7% | E762E (GAA→GAG) | hsdR → | type I restriction modification system endonuclease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,395,344 | 0 | A | G | 5.7% | 258.7 / 3.8 | 87 | E762E (GAA→GAG) | hsdR | type I restriction modification system endonuclease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/40); new base G (2/3); total (44/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAAT > NC_002947/5395196‑5395489 | aGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGaa < 2:251047/149‑1 (MQ=255) gCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAAc < 8:234406/149‑1 (MQ=255) tAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTgg > 5:60032/1‑149 (MQ=255) actactTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGt > 1:372412/1‑148 (MQ=255) actTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTa > 4:297281/1‑147 (MQ=255) ctTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTaaa < 4:303547/148‑1 (MQ=255) cGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGTTCGATGGGTGCACCGAGCTGGTTAAAggg < 4:132305/148‑3 (MQ=38) ccAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGCGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGTTCGATGGGTGCACCGAGCTGGTTAAAgggatc < 1:95366/149‑6 (MQ=37) cAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGTTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTg > 8:167344/1‑149 (MQ=255) aaTACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGTACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTggc < 1:49625/149‑1 (MQ=255) tACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTggcgg < 1:14608/149‑1 (MQ=255) ctacGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACTCCGTCAACGGCTTTGAGCACATCGAGGAAATC‑‑TAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTTCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGTCa < 2:241219/146‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTggcggc < 6:29851/148‑1 (MQ=255) tCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCa > 7:53363/1‑148 (MQ=255) tGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGTTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTg < 7:167344/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTgg < 7:327895/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTgg < 1:293605/148‑1 (MQ=255) cgcgcCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTa > 6:15291/1‑148 (MQ=255) aGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACaaa < 3:68933/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATc > 5:134903/1‑149 (MQ=255) tGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATc > 1:288496/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCa < 8:53363/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCAt < 2:203954/149‑1 (MQ=255) ctgGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGATGTCCGCATAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAAc < 1:329032/147‑1 (MQ=255) ctgGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTgg < 6:24938/148‑1 (MQ=255) ctgGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTg < 2:288496/147‑1 (MQ=255) ctgGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGa < 5:259073/149‑1 (MQ=255) ctgGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCATTAACCAGCTCAGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTgg < 4:229414/148‑1 (MQ=255) ctgATAAATACGCCGACACCGGCATTTAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCAACCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTTGCGGCAAAGGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGa < 1:47486/147‑1 (MQ=255) gATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAg < 7:180520/148‑1 (MQ=255) tACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTTACCAGCTCGGTGAACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCt > 4:252493/1‑149 (MQ=255) tACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCt > 5:223066/1‑149 (MQ=255) tACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCt < 5:15291/149‑1 (MQ=255) tACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCt > 5:13750/1‑149 (MQ=255) gCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTa > 8:337995/1‑149 (MQ=255) gCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTa > 1:94281/1‑149 (MQ=255) gCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTa > 4:267158/1‑149 (MQ=255) ccGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACACATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTAc > 6:314824/1‑149 (MQ=255) acCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAg > 5:67874/1‑149 (MQ=255) cGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGAcgcg > 5:14610/1‑136 (MQ=255) cGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGAcgcg < 6:14610/136‑1 (MQ=255) cGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGt > 4:18403/1‑148 (MQ=255) gCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGctc < 7:109907/149‑1 (MQ=255) cacaTCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGctc > 6:319334/1‑148 (MQ=255) aTCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTAcc > 7:203306/1‑149 (MQ=255) aCATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtggg > 7:137295/1‑149 (MQ=255) aTC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtg < 2:372412/149‑1 (MQ=255) aTC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGAtgggtg > 3:161967/1‑149 (MQ=255) aTC‑‑AAAATCCTCCAGCACGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATAGAACTGGTTAAAGCATTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAACACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCTCTCTACCCGTtggctg > 1:91089/1‑149 (MQ=255) c‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtggg > 5:157744/1‑149 (MQ=255) aaTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCaa < 5:319334/149‑1 (MQ=255) aTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAc < 3:245497/149‑1 (MQ=255) cctccAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAcgg > 5:292867/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACCACAAGGCTATCCATGAACTGGAAGCCGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAcggcg > 4:330223/1‑147 (MQ=255) aGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAg < 3:18403/149‑1 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtggg > 4:31398/1‑137 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtggg < 3:31398/137‑1 (MQ=255) cTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCa > 4:4346/1‑109 (MQ=255) cTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCa < 3:4346/109‑1 (MQ=255) gATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAGAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTg > 2:340818/1‑149 (MQ=255) gATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTg > 8:292834/1‑149 (MQ=255) gATCCCTTTAACCAGATCGGTGCACCCAACGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAAAAAAGATATCCATGAACTGCAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAAACCGCTCTACCCGTTGGGTGGCCAACGCCGGAGCATTg > 2:388807/1‑149 (MQ=255) ccTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTGCCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCa > 1:351289/1‑149 (MQ=255) ccTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCa > 2:359659/1‑149 (MQ=255) cTTTAACCAGTTCGATGGGTGCACCGAGCTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCAc > 4:160836/1‑149 (MQ=38) cTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCAc < 6:67874/149‑1 (MQ=255) tttAACCAGTTCGATGGGTGCACCGAGCTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCAcc > 8:197669/1‑149 (MQ=38) tttAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCAcc > 5:68243/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCt > 8:186272/1‑147 (MQ=255) aCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGTTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTaa < 3:297281/148‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTaa < 2:94281/148‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAag > 5:26703/1‑149 (MQ=255) aCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAag > 3:59862/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAagca < 7:337995/149‑1 (MQ=255) cTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGTAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGcc < 6:60032/149‑1 (MQ=255) aCCCTTCTAATTTGTTAATGCTTTTGGCGGCAAA‑GCTTGCTACAACAAAGCTATCCATGAAGTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATGCGCTGTACGCGTTGGGTGGGCATCGGCGTAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAAGTCGAt < 2:91089/149‑1 (MQ=255) aCCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCCACTCCAt > 6:43348/1‑149 (MQ=255) aCCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCAt > 1:346825/1‑149 (MQ=255) aCCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCAt > 1:134410/1‑149 (MQ=255) ccATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTa < 2:115465/149‑1 (MQ=255) cATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTAc < 1:359659/149‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACa < 4:59862/149‑1 (MQ=255) tCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACaa < 2:346825/149‑1 (MQ=255) tCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGAGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACaa < 4:104561/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACaa < 3:160836/148‑1 (MQ=255) cGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAAt > 5:133583/1‑149 (MQ=255) gAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTCGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAagca < 6:116927/131‑1 (MQ=255) gAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTAGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAagca > 5:116927/1‑131 (MQ=255) | AGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATC‑‑AAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAA‑GCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAAT > NC_002947/5395196‑5395489 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |