New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 581532 | 39 (0.920) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 9.0% | coding (822/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase |
? | NC_002947 | = 581553 | 44 (1.100) | coding (843/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase |
TGCAGCAATTACAGCATCCAGGGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGCTC > NC_002947/581395‑581676 | tGCAGCAATTACAGCATCCAGCGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCCAGCTCGCACGTATCGCCCACCAACATGAAATACCACTGCATGAAGACCTGGGCAGCCGCAGCCTGCTCGACCATACGCGCATCGGCCAGCCC‑GCCGAAc > 2:222106/1‑148 (MQ=255) cagcaATTACAGCATCCAGGGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCa < 6:146613/149‑1 (MQ=255) agcaATTACAGCATCCAGGGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCTACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCAc > 6:76895/1‑149 (MQ=255) aCAGCATCCAGGGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACg < 4:143030/148‑1 (MQ=255) ttCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGa > 7:190393/1‑149 (MQ=255) caccacCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGgcgtaccgtgggttcggcgggcaggccc > 1:152150‑M1/1‑112 (MQ=255) caccacCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGgcgtaccgtgggttcggcgggcaggccc < 2:152150‑M1/140‑29 (MQ=255) caccacCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATg > 5:47539/1‑149 (MQ=255) cAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGa < 8:67792/149‑1 (MQ=255) aaGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGa > 8:190924/1‑148 (MQ=255) tGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCt > 2:128465/1‑149 (MQ=255) gCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGTCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGa > 1:50197/1‑149 (MQ=255) aCGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACa < 6:47539/149‑1 (MQ=255) gCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCGTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAActgct < 5:76895/149‑1 (MQ=255) tccaACATGAATTTCCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGAGTCATCCTTCTCTACCTTACCGGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAAGCCACGGTACGCCAGGCGCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTggg < 4:150064/147‑1 (MQ=255) accaACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCATCCCA‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTACAGTGGCGACAAACTCATgggg > 3:177620/1‑149 (MQ=255) caACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCTGCAGACTGCTCGACCTTACACGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGCTACGCCACGCCCTGGCCCATCGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAAcagctgcg > 3:150064/1‑144 (MQ=255) caACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTggg > 3:11066/1‑146 (MQ=255) caACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCACCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTggg < 4:11066/146‑1 (MQ=255) gAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGACTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGTGCCGc > 3:104647/1‑148 (MQ=255) ttACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGc > 2:142238/1‑149 (MQ=255) ccACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCgg > 1:129112/1‑149 (MQ=255) cACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCgg > 4:173545/1‑148 (MQ=255) tGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCa < 5:265869/139‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCa > 6:265869/1‑139 (MQ=255) gCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGgcgtaccgtgggttcggcgggc < 3:220184‑M1/74‑23 (MQ=255) gCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGgcgtaccgtgggttcggcgggc > 4:220184‑M1/1‑52 (MQ=255) aCCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGc < 3:173545/149‑1 (MQ=255) gggCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCCGGGCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCca > 1:192170/1‑148 (MQ=255) gcCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGTCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATc < 2:50197/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGa < 8:141485/93‑1 (MQ=255) ccTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGa > 7:141485/1‑93 (MQ=255) tGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGa > 8:72448/1‑120 (MQ=255) tGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGa < 7:72448/120‑1 (MQ=255) tCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGa < 3:115130/136‑1 (MQ=255) tCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGa > 4:115130/1‑136 (MQ=255) cTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCaa < 7:190924/149‑1 (MQ=255) ttACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATc > 6:96236/1‑146 (MQ=255) ccGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGaaa > 6:208695/1‑148 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGTTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATcc < 8:190393/147‑1 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCcaggccccagcgggtaaggtcgagcaggctgccgctgcccaggtcttcaagcagtggtaattcatgttggtgggcgatacgtgccagctcggcagtaggcacttgggtggtg < 2:152150‑M2/140‑113 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCcaggccccagcgggtaaggtcgagcaggctgccgctgcccaggtcttcaagcagtggtaattcatgttggtgggcgatacgtgccagctcggcagtaggcacttgggtggtg > 1:152150‑M2/1‑28 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATcc < 2:129112/147‑1 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGc > 5:220726/1‑149 (MQ=255) gggCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGc < 5:96236/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGCt > 3:264390/1‑148 (MQ=255) ccTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTgg < 2:128715/80‑1 (MQ=255) ccTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTgg > 1:128715/1‑80 (MQ=255) ccTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAACCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGCta > 8:46985/1‑147 (MQ=255) cTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGCTc > 8:34191/1‑147 (MQ=255) gCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCcaggccccagcgggtaaggtcgagcaggctgccgctgcccaggtcttcaagc > 4:220184‑M2/1‑22 (MQ=255) gCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCcaggccccagcgggtaaggtcgagcaggctgccgctgcccaggtcttcaagc < 3:220184‑M2/74‑53 (MQ=255) | TGCAGCAATTACAGCATCCAGGGCTTCACCACCCAAGTGCCTACTGCCGAGCTGGCACGTATCGCCCACCAACATGAATTACCACTGCTTGAAGACCTGGGCAGCGGCAGCCTGCTCGACCTTACCCGCTGGGGCCTGCCC‑GCCGAACCCACGGTACGCCAGGCCCTGGCCGATGGTGCCGATATCGTCACCTTCAGTGGCGACAAACTGCTGGGGGGGCCGCAAGCCGGGATCATCGTCGGCCACAAGGACTTGATCACCAGGATCAAGAAAAATCCGCTC > NC_002947/581395‑581676 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |