New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2507988 | 40 (0.950) | 4 (0.100) | 4/250 | NT | 10.2% | coding (186/999 nt) | PP_2201 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | = 2508031 | 32 (0.780) | coding (143/999 nt) | PP_2201 | alpha/beta family hydrolase |
ATGCGCCGGTTTGCTCGACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGAACTGCTGG > NC_002947/2507841‑2508136 | aTGCGCCGGTTTGCTCGACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCC < 3:154730‑M1/148‑1 (MQ=255) cTCGACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTgggcg‑gg > 5:197503/1‑149 (MQ=255) tCGACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTgggcg‑ggc > 7:198531/1‑149 (MQ=255) gtcGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTgggcg‑ggc < 2:15270/145‑1 (MQ=255) gACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTgggcg‑ggc < 6:164765/147‑1 (MQ=255) cGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGt > 8:122711/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATg > 2:15517/1‑148 (MQ=255) gAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGt < 5:80737/149‑1 (MQ=255) aaGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATg > 1:130153/1‑147 (MQ=255) aGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAg < 7:122711/149‑1 (MQ=255) gCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTg < 7:170183/129‑1 (MQ=255) gCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTg > 8:170183/1‑129 (MQ=255) cGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGccc < 8:198531/149‑1 (MQ=255) gACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCa > 2:32762/1‑149 (MQ=255) gACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCa > 2:36752/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGAGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCt > 7:120128/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCa < 2:18284/149‑1 (MQ=255) ggCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGc < 7:76090/149‑1 (MQ=255) gcgcGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCaggccctgcagatgggctacatggacgtgcccgcccaaggc > 8:211607‑M1/1‑107 (MQ=255) gcgATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTg > 7:45953‑M2/1‑148 (MQ=255) gATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCGCGGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTgg > 1:36752‑M2/1‑147 (MQ=255) gATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCGCGGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTgg > 1:32762‑M2/1‑147 (MQ=255) aCCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCaggccctgcagatgggctacatggacgtgcccgcccaaggccaggccaac < 7:211607‑M1/149‑51 (MQ=255) aCCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTg < 2:130153/149‑1 (MQ=255) cccGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTgg < 6:197503/149‑1 (MQ=255) ggTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTTCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGAc < 7:151522/149‑1 (MQ=255) tAGCCGGCCTTGCTCAGCGCGTCGATGGTGGGTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTACTTGCCGTGCAGCAGCACCACGTTGTGGCCGGTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACtt < 8:194077/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGaa < 1:15517/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCtt > 6:56602/1‑96 (MQ=255) tCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCaggccctgcagatgggctacatggacgtgcccgcccaaggccaggccaa < 2:57575‑M1/129‑50 (MQ=255) tCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCaggccctgcagatgggctacatggacgtgcccgcccaaggccaggccaa > 1:57575‑M1/1‑80 (MQ=255) tCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTATTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGc > 3:87031/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCGTCGATCCAGGTTTCCCAGGTGCCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTCTGGCCGTTGGCCTCCCCTTGGCCA‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGCCCTGGCCCAGCGACTTGAACTCGAACTg > 8:102736/1‑148 (MQ=255) aGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGa < 7:72343/131‑1 (MQ=255) aGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGa > 8:72343/1‑131 (MQ=255) tggtggTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGc < 4:87031/149‑1 (MQ=255) gtggtTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCgg > 5:217991/1‑149 (MQ=255) tCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAgg < 6:102512/135‑1 (MQ=255) tCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAgg > 5:102512/1‑135 (MQ=255) ggTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGc < 6:217991/149‑1 (MQ=255) aaGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTgggg > 4:72197/1‑149 (MQ=255) aGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTggggg < 7:102736/149‑1 (MQ=255) ccacGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGACCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCa < 8:120128/149‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCtt < 6:257501/112‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCtt > 5:257501/1‑112 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCgtaggtag < 7:44121/128‑1 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCgtaggtag > 8:44121/1‑128 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGcc > 1:62135/1‑148 (MQ=255) gTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctgagcaaggccggctaccgggt < 7:211607‑M2/149‑100 (MQ=255) ttGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctga < 2:57575‑M2/129‑81 (MQ=255) ttGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctga > 1:57575‑M2/1‑49 (MQ=255) gcctggcctTGGGCG‑GGCACGTCCATGAAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCGGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGGGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGAActgc < 7:191363/148‑1 (MQ=255) cctggcctTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGaa > 2:51282/1‑143 (MQ=255) cctggcctTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGaa < 1:51282/143‑1 (MQ=255) ccaggccctgcagatgggctacatggacgtgccgcgcccaaggccaggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctgagcaaggccggctaccgggtcatc > 1:36752‑M1/1‑2 (MQ=255) ccaggccctgcagatgggctacatggacgtgccgcgcccaaggccaggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctgagcaaggccggctaccgggtcatc > 1:32762‑M1/1‑2 (MQ=255) ctggcctTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGAACTGCTgg > 5:268569/1‑149 (MQ=255) caggccctgcagatgggctacatggacgtgcccgcccaaggccaggccaacggccacaacgtggtgctgatgcacggcaagaacttctgcgccgccacctgggaaaccaccatcgacgccctgagcaaggccggctaccgggtcatcgc > 7:45953‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGCGCCGGTTTGCTCGACGTACAGAAGCCGACCTGGTCGGGCGCGATGACCCGGTAGCCGGCCTTGCTCAGGGCGTCGATGGTGGTTTCCCAGGTGGCGGCGCAGAAGTTCTTGCCGTGCATCAGCACCACGTTGTGGCCGTTGGCCTGGCCTTGGGCG‑GGCACGTCCATGTAGCCCATCTGCAGGGCCTGGCCCTGGGACTTGAAGTCGAAATGCTTGAGGGGGTGCGGGTAGCTGAAGCCTTCGAGCTGGGGGCCGTAGGTAGGCGACTCGGCAGCGATGGCCGAACTGCTGG > NC_002947/2507841‑2508136 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |