New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3084350 = | 37 (0.880) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 8.0% | coding (760/987 nt) | PP_2693 | putative Dipeptidase |
? | NC_002947 | 3084386 = | 34 (0.860) | coding (724/987 nt) | PP_2693 | putative Dipeptidase |
GCCGCGGGCGCGCAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACGGATAGGTGCTGAAG > NC_002947/3084204‑3084498 | gCCGCGGGCGCGCAGGTCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCa > 6:183902/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGGCGCGCAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAgta > 8:38127/1‑147 (MQ=255) gggatcgcagagtccggcgggctgctgggcttcagcacctatccgttccacctcaagggtgcctcggactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGa < 5:31671‑M1/7‑1 (MQ=255) gggCGCGCAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGAc < 3:41613/149‑1 (MQ=255) gcgcgcAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACaa < 4:132006/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAgg < 5:183902/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGTACCGACAAgg < 7:38127/149‑1 (MQ=255) aGGCCCTGGGCGAGGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTg < 4:63644/149‑1 (MQ=255) gaggAGGTCGAGTCTGTCGAGGAACCACTGCAAGGTCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCTCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACAGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCg < 8:189939/146‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGtt > 2:104092/1‑127 (MQ=255) aGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGtt < 1:104092/127‑1 (MQ=255) agcacctatccgttccacctcaagggtgcctcggactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtgccga > 8:203111‑M1/110‑148 (MQ=255) ggCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtgacgatgcc > 8:182991/1‑148 (MQ=255) cTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTgccgatgccgat < 7:182991/149‑1 (MQ=255) cgGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTc > 8:204518/1‑149 (MQ=255) tcaagggtgcctcggactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtg < 3:162917‑M1/35‑1 (MQ=255) tcaagggtgcctcggactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtg > 4:162917‑M1/91‑125 (MQ=255) tGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTc < 4:121433/140‑1 (MQ=255) tGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTc > 3:121433/1‑140 (MQ=255) gggCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGt > 4:198384/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGt > 6:206926/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGt < 5:49770/149‑1 (MQ=255) gactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGAc > 1:250749‑M1/77‑84 (MQ=255) gactgtagcctggaaagtttctgcgacatggtcgcgcgcaccgccgacctgatgggtgtggagcatatcggcatcgGCACCGAc < 2:250749‑M1/8‑1 (MQ=255) gCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtgccgatgccg > 8:117710/1‑119 (MQ=255) gCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGtgccgatgccg < 7:117710/119‑1 (MQ=255) ccTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCg > 4:6976/1‑148 (MQ=255) ttCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACttt > 7:136267/1‑149 (MQ=255) cGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACttt < 5:206926/147‑1 (MQ=255) gTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGc > 7:253360/1‑149 (MQ=255) tAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGc > 1:76077/1‑148 (MQ=255) tAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACCTTCCAGGc > 2:253434/1‑148 (MQ=255) tccttgCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTcc > 3:256617/1‑147 (MQ=255) cttgCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGc < 6:73514/122‑1 (MQ=255) cttgCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGc > 5:73514/1‑122 (MQ=255) cttgCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTc > 8:253087/1‑132 (MQ=255) cttgCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTc < 7:253087/132‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCAccc > 6:31671/1‑149 (MQ=255) ggCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAgg < 7:204518/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAAc < 8:136267/148‑1 (MQ=255) cgcATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACg < 3:6976/148‑1 (MQ=255) cATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCAccc < 5:26445/129‑1 (MQ=255) cATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCAccc > 6:26445/1‑129 (MQ=255) aTTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACAccc < 3:195530/65‑1 (MQ=255) aTTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACAccc > 4:195530/1‑65 (MQ=255) ttCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACGGATAGGTGc > 3:61748/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACGGATAGGTGCt < 6:253996/148‑1 (MQ=255) GCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACGGATAGGTGCTGAAg > 2:76077‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCCGCGGGCGCGCAGGCCCTGGGCGATGTTGCGGAGGTCGCGGCTGTCGCGGAACCACTGCAAGGGCGCCGGCCAGTTGGCGTTGTCCCTGGAGCCTTCGCCGTAGTCCTTGTCCTTGCTCCAGCGGCCGTTGCGCATCCATTCCAGCACCGACAAGGGTTGCGCCTGGCACAGGTCGGTGCCGATGCCGATATGCTCCACACCCATCAGGTCGGCGGTGCGCGCGACCATGTCGCAGAAACTTTCCAGGCTACAGTCCGAGGCACCCTTGAGGTGGAACGGATAGGTGCTGAAG > NC_002947/3084204‑3084498 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |