New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4768643 = | 35 (0.830) | 3 (0.080) | 3/244 | NT | 8.0% | coding (169/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
? | NC_002947 | 4768685 = | 36 (0.900) | coding (127/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
GCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGC > NC_002947/4768496‑4768790 | cccctctggagaatcgaacgatgtccctgaaccctgacctggcggcctacctgcaactggtggaggccggacgcagcgccggcaaggtgctgcccatgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggcg < 5:15173‑M1/2‑1 (MQ=255) tCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGAt < 3:237826/149‑1 (MQ=255) aTGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATg < 8:75464/148‑1 (MQ=255) aTGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATg < 6:245330/148‑1 (MQ=255) aTGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATg < 5:242136/148‑1 (MQ=255) aTGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATg > 6:15173/1‑148 (MQ=255) ggCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCtcg > 3:47428/1‑149 (MQ=255) gatGCCCTCCAGGTTGCCGCCGGCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGGAGGGTCGGCCTGCTGCGGGCGGTACAAGCGCACCTGCAATGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAATGGTCGCTGATGCAGTCCGGCtcgt < 2:205039/147‑1 (MQ=255) cccACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGc < 4:47428/149‑1 (MQ=255) cacGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCt > 2:187706/1‑123 (MQ=255) cacGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCt < 1:187706/123‑1 (MQ=255) tggcggcctacctgcaactggtggaggccggacggagcgccggcaaggtgctgcgcatgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggCGCTGATGGAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAgc > 2:136345‑M1/109‑149 (MQ=255) cATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCg > 1:58535/1‑107 (MQ=255) cATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCg < 2:58535/107‑1 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGAGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCg < 6:189650/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGcc > 4:208852/1‑147 (MQ=255) actggtggaggccggacgcagcgccggcaaggtgctgcccatgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAgcg > 4:37659‑M1/93‑134 (MQ=255) actggtggaggccggacgcagcgccggcaaggtgctgcccatgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAgcg < 3:37659‑M1/42‑1 (MQ=255) ccgcgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTg‑g < 1:137712/149‑1 (MQ=255) ccgcgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCACACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTc < 4:24729/142‑1 (MQ=255) ccgcgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCACACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTc > 3:24729/1‑142 (MQ=255) cgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTg‑gcgg > 6:202839/1‑149 (MQ=255) cAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCt > 5:235637/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCg > 2:20085/1‑149 (MQ=255) tGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGt > 1:141653/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTcc > 2:41487/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTcc < 2:141653/149‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTccgccg > 8:49693/1‑149 (MQ=255) ggcgggcgGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGAGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcat < 1:20085/149‑1 (MQ=255) cgggcggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcatgca > 6:205735/1‑149 (MQ=255) cACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGc > 4:25446/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGgcg < 7:49693/149‑1 (MQ=255) cAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGgcgc > 2:134034/1‑149 (MQ=255) ggTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGc < 6:235637/149‑1 (MQ=255) ccATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGc > 1:9862/1‑149 (MQ=255) ccATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGc > 7:186608/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTc < 5:202839/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTc < 3:208852/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGGTCAACGAAACGTCGATGAAGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTCACCGCAATAAGAGCCGAGGACTCTTATAAAAG‑TCTGCGCGCCTCCACCGCCGCAAGGGAAGGCATGGTCACCACCTTGCCTGAGCTTCGTCCGGCATc > 4:82589/1‑149 (MQ=255) ggtCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGtt > 4:205664/1‑149 (MQ=255) cAACGAAAGGTCCCTGATGCAGTCCGGCTCCTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAAGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCCCCGCCAGGGCATGCATTGGCAGCACCTTGCCGCCGCTCCGTCCGGCCTACACCACTTg > 8:120762/1‑147 (MQ=255) aaaGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAg > 6:82838/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAg < 1:41487/149‑1 (MQ=255) tCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGgccgc < 5:205735/149‑1 (MQ=255) | GCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTG‑GCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGC > NC_002947/4768496‑4768790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |