New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5390643 | 33 (0.780) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 7.9% | noncoding (11/87 nt) | PP_mr56 | C4 ncRNA |
? | NC_002947 | = 5390712 | 38 (0.930) | noncoding (80/87 nt) | PP_mr56 | C4 ncRNA |
GCGTTTCCCAAAGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGTTCCTGA > NC_002947/5390505‑5390788 | gCGTTTCCCAAAGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACCGCGCGCATACCCGTGCATGG‑CGGTTGTGCag > 8:15665/1‑148 (MQ=255) gTTTCCCAAATATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATgg < 5:19211/149‑1 (MQ=255) cccAAAGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCa > 2:63172/1‑149 (MQ=255) aaaGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGc > 6:13591/1‑149 (MQ=255) aGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGCGCACGcaa < 5:20841/149‑3 (MQ=255) aCTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCCGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTCACAGGCCGCAACCAAACACAGCGCGGATAACCGATCATGG‑CGGTTGTGCATGGGCAACGCTtccgt > 8:64636/1‑149 (MQ=255) cctgcGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGCCAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGGTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTtgcgtgc < 7:15665/147‑1 (MQ=255) cctgcGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTgcgc > 8:235396/1‑149 (MQ=255) tGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCAAGCGTGccccat > 4:144415/1‑142 (MQ=255) tGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCAAGCGTGccccat < 3:144415/144‑3 (MQ=255) ttttCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCt < 3:64806/147‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATggg > 4:9608/1‑121 (MQ=255) ttCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATggg < 3:9608/121‑1 (MQ=255) gCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGTCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCg < 2:36957/148‑1 (MQ=255) cGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCCTCAACGTCCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGGACGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCg < 1:63172/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCAt < 3:143172/148‑1 (MQ=255) tttAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTgtgt < 5:178458/123‑1 (MQ=255) tttAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTgtgt > 6:178458/1‑123 (MQ=255) tAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑Cagctgtgcatgggttgacagaccggcgaacacagaaaccggcgcacgcaagcgtgccccatgcacaacc > 5:119200‑M1/1‑80 (MQ=255) ggTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑Cagctgtgcatgggttgacagaccggcgaacacagaaaccggcgcacgcaagcgtgccccatgcacaaccgcca < 6:119200‑M1/146‑74 (MQ=255) ggTCGTAGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑Cagctgtgcatgggttgacagaccggcgaacacagaaaccggcgcacgcaagcgtgccccatgcacaaccgccatgaacgg < 5:67064‑M1/149‑81 (MQ=255) gTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGttt > 5:62742/1‑149 (MQ=255) gCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGa < 2:146779/148‑1 (MQ=255) tcatcaACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTgcca < 1:254153‑M2/133‑5 (MQ=255) tcatcaACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTgcca > 2:254153‑M2/1‑129 (MQ=255) aCGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACGGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGtt > 2:52032/1‑149 (MQ=255) gCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTg > 3:41828/1‑149 (MQ=255) ggCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATc < 6:62742/149‑1 (MQ=255) ccGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATc > 3:123593/1‑147 (MQ=255) gCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCgaga < 5:13591/149‑1 (MQ=255) tACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGt < 7:235396/149‑1 (MQ=255) cacgGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTaa < 1:52032/149‑1 (MQ=255) cgcgcATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGaa > 4:216472/1‑136 (MQ=255) cgcgcATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGaa < 3:216472/136‑1 (MQ=255) gcgcATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCga < 7:22919/132‑1 (MQ=255) gcgcATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCga > 8:22919/1‑132 (MQ=255) gcATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGTCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGATCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGATTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTaa < 1:208142/149‑1 (MQ=255) ccGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTgccatgaacggttatgcgcgctgtgtatcgttgcggcctgtcaaagccggtcgttgatgagctacgacc < 5:67064‑M2/149‑70 (MQ=255) cGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGt > 4:130174/1‑149 (MQ=255) aTGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGTTc < 1:116881/146‑1 (MQ=255) aTGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGTTc > 2:116881/1‑146 (MQ=255) tGG‑Cagctgtgcatgggttgacagaccggcgaacacagaaaccggcgcacgcaagcgtgccccatgcacaaccgccatgaacggttatgcgcgctgtgtatcgttgcggcctgtcaaagccggtcgttgatga > 2:254153‑M1/1‑4 (MQ=255) tGG‑Cagctgtgcatgggttgacagaccggcgaacacagaaaccggcgcacgcaagcgtgccccatgcacaaccgccatgaacggttatgcgcgctgtgtatcgttgcggcctgtcaaagccggtcgttgatga < 1:254153‑M1/133‑130 (MQ=255) tGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTgccatgaacggttatgcgcgctgtgtatcgttgcggcctgtcaaagccggtcgttgatgagcaacgacccacc < 6:119200‑M2/146‑74 (MQ=255) tGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGTTCCTGa > 5:99660/1‑149 (MQ=255) | GCGTTTCCCAAAGATACTGCCTGCGCCTGTTTTCCGTTGCGGTCATTTTTTCAGGGTTTTAGTCTCGGTGGGTCGTTGCTCATCAACGACCGGCTTTGACAGGCCGCAACGATACACAGCGCGCATAACCGTTCATGG‑CGGTTGTGCATGGGGCACGCTTGCGTGCGCCGGTTTCTGTGTTCGCCGGTCTGTCAACCCATGCACAGCTGCCACCATTCCGTTTGACAGCGGGTTGGCGGTGGCCCCTATCGAGAACACAGTAAAATGCTAAAGATCGTTCCTGA > NC_002947/5390505‑5390788 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |