New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1784612 | 42 (0.990) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 6.6% | coding (289/783 nt) | map | methionine aminopeptidase |
? | NC_002947 | = 1784627 | 46 (1.160) | coding (274/783 nt) | map | methionine aminopeptidase |
TGGCCTTGTACATGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGACGATATAATCGTG > NC_002947/1784495‑1784765 | tGGCCTTGTACATGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGc > 6:118746/1‑149 (MQ=255) gTACATGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTg < 1:114234/148‑1 (MQ=255) aCATGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCCCCGTGGTAGCCGTCCTTGAAAACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGATTGTCg > 2:139347/1‑149 (MQ=255) aTGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGtt > 6:92113/1‑149 (MQ=255) cATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTggg > 5:10493/1‑149 (MQ=255) cATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGGCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCATGAGCGGCTTGTCGTTggg > 6:151958/1‑149 (MQ=255) ccTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTg > 4:16922/1‑134 (MQ=255) ccTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTg < 3:16922/134‑1 (MQ=255) cTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGa > 7:222060/1‑149 (MQ=255) ggACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGAc < 8:222060/147‑1 (MQ=255) gcTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGtt > 3:185649/1‑148 (MQ=255) tCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACcaca > 2:20786/1‑141 (MQ=255) tCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACcaca < 1:20786/141‑1 (MQ=255) cAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGt > 7:81518/1‑149 (MQ=255) cACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATc > 8:36556/1‑148 (MQ=255) gTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACt > 4:202702/1‑149 (MQ=255) ccGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCg < 1:119374/148‑1 (MQ=255) ccGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCg < 5:118746/148‑1 (MQ=255) cGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCggg < 4:185649/149‑1 (MQ=255) gAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGc < 5:224543/104‑1 (MQ=255) gAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGc > 6:224543/1‑104 (MQ=255) gAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCTAGGTGCAGATCGTCTTCGGGTAGCCCt > 4:183840/1‑149 (MQ=255) aaCATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGAGTAGCCCtt < 8:81518/149‑1 (MQ=255) aCATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTg > 8:141727/1‑149 (MQ=255) cATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTg > 7:204204/1‑148 (MQ=255) aTGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTa > 2:115489/1‑149 (MQ=255) aTGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTa < 7:141727/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGa < 8:204204/149‑1 (MQ=255) tgtCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGt < 1:139347/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCg < 3:202702/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGCCGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCGTGCCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGGTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCgg < 2:156725/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTAGACGTCCTTGATCACGGTGACGTCTATATTGTGCGTGGCACCGTCCTTGAGCGGCTTGGCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGGTGATCGCGGTGCTGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTTCCgg < 5:151958/149‑1 (MQ=255) tCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGt < 6:97213/121‑1 (MQ=255) cTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTgtcaccgtgatcaaggacggctaccacggcgacaccagccgcatgttccacgtcggtaacgtgccggtctgggccgagcgcctgtccaaggtcacccaggaatgcatgtacaaggccat < 7:202124‑M2/149‑120 (MQ=255) cTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGaa > 1:121897/1‑149 (MQ=255) cTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGaa < 6:257074/149‑1 (MQ=255) tGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACg > 6:135831/1‑149 (MQ=255) gATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAAc < 5:92113/147‑1 (MQ=255) cGGTGACGTCGATATTGAGCGTgtcaccgtgatcaaggacggctaccacggcgacaccagc < 2:70127‑M2/61‑40 (MQ=255) cGGTGACATCGATATTGAGCGTgtcaccgtgatcaaggacggctaccacggcgacaccagc > 1:70127‑M2/1‑22 (MQ=255) ggTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGt > 6:112387/1‑74 (MQ=255) ggTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGt < 5:112387/74‑1 (MQ=255) gTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATg < 7:32822/124‑1 (MQ=255) gTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATg > 8:32822/1‑124 (MQ=255) gTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGACGATATAAt > 3:167102/1‑149 (MQ=255) atatTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGACGATATAATCGTg > 2:87576/1‑149 (MQ=255) tatTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGAc > 3:115589/1‑136 (MQ=255) tatTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGAc < 4:115589/136‑1 (MQ=255) atTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTg < 8:33583/97‑1 (MQ=255) gCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTa > 7:100700/1‑94 (MQ=255) gCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTa < 8:100700/94‑1 (MQ=255) | TGGCCTTGTACATGCATTCCTGGGTGACCTTGGACAGGCGCTCGGCCCAGACCGGCACGTTACCGACGTGGAACATGCGGCTGGTGTCGCCGTGGTAGCCGTCCTTGATCACGGTGACGTCGATATTGAGCGTGTCACCGTCCTTGAGCGGCTTGTCGTTGGGGATGCCGTGGCAGACCACATGGTTGATCGAGGTGCAGATCGACTTCGGGTAGCCCTTGTAGTTGAGCGGTGCCGGGATGGCCTGCTGAACGTTGACGATATAATCGTG > NC_002947/1784495‑1784765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |