New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6071622 = | 32 (0.760) | 5 (0.120) | 5/246 | NT | 13.4% | intergenic (‑45/+57) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 6071671 = | 34 (0.840) | intergenic (‑94/+8) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
GCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTTGCTGCAT > NC_002947/6071523‑6071819 | caaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGa > 1:159305‑M1/100‑149 (MQ=255) aaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAg > 2:217641‑M1/99‑149 (MQ=255) cGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcg < 4:165745/149‑1 (MQ=255) ctgctgGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGcc < 2:120653/149‑1 (MQ=255) ctgGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCg > 1:115885/1‑147 (MQ=255) ctgGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTGCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTa < 7:54899/149‑1 (MQ=255) tgGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAg > 1:147804/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGAt > 7:213230/1‑144 (MQ=255) tAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGAt < 8:213230/144‑1 (MQ=255) ctttctttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCg > 6:113643/1‑149 (MQ=255) tgttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGc < 2:115885/148‑1 (MQ=255) tgttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTACCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGc < 7:74242/148‑1 (MQ=255) catcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGc > 1:133723/1‑149 (MQ=255) tcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGc < 2:26657/147‑1 (MQ=255) tcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGc > 1:26657/1‑147 (MQ=255) tCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGt < 2:133723/148‑1 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGaa > 2:30681/1‑148 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGaa > 3:43841/1‑148 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCGCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACa < 8:236350/148‑1 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACa < 4:43841/148‑1 (MQ=255) gTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 2:16481/148‑1 (MQ=255) gTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 1:30681/148‑1 (MQ=255) ggCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcgg > 3:90717/1‑148 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTc > 5:90310/1‑149 (MQ=255) ctcgcgaaacaggcaccttggtgtctggcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGttt > 2:217641‑M2/52‑149 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGttt > 3:162651/1‑149 (MQ=255) tcgcgaaacaggcaccttggtgtctggcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTg > 1:159305‑M2/51‑149 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTg > 8:32627/1‑149 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTg < 4:162651/149‑1 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTg > 3:25936/1‑149 (MQ=255) cgcgaaacaggcaccttggtgtctggcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGc > 1:138040‑M2/50‑149 (MQ=255) AACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCAt > 6:90310‑M1/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACa > 8:162330/1‑149 (MQ=255) aaCCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggt > 2:87480/1‑113 (MQ=255) ggTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGgt < 4:90717/149‑1 (MQ=255) ccAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCCTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTaa > 5:70822/1‑149 (MQ=255) cAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAAt > 3:242835/1‑149 (MQ=255) gcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTa < 2:138040‑M2/122‑1 (MQ=255) aGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATc < 5:113643/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGt > 7:23774/1‑124 (MQ=255) cAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGt < 8:23774/124‑1 (MQ=255) aaGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAaca > 7:4327/1‑149 (MQ=255) gccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACAcgc < 1:217641‑M2/135‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTAc < 6:240722/117‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTAc > 5:240722/1‑117 (MQ=255) gcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGt > 6:179823‑M2/4‑99 (MQ=255) gcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGt < 5:179823‑M2/96‑1 (MQ=255) aGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTTGCTGCAt < 7:32627/149‑1 (MQ=255) | GCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTTGCTGCAT > NC_002947/6071523‑6071819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |