| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,925,396 | A→G | 9.5% | L250P (CTG→CCG) ‡ | gcvT‑II ← | aminomethyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,925,396 | 0 | A | G | 9.5% | 175.5 / 7.8 | 63 | L250P (CTG→CCG) ‡ | gcvT‑II | aminomethyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/27); new base G (2/4); total (32/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.68e-01 | |||||||||||
GCACGACCTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATC > NC_002947/5925250‑5925544 | gcacgACCTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGTCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAgg > 6:38310/1‑149 (MQ=255)gcacgACCTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAgg > 3:25300/1‑149 (MQ=255) aCCTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGa < 4:80646/149‑1 (MQ=255) ccTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGTCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAg < 5:38310/149‑1 (MQ=255) ccTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAg > 7:144600/1‑149 (MQ=255) cTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgc < 6:52172/149‑2 (MQ=255) tGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAg > 1:87464/1‑147 (MQ=255) tGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAg < 2:87464/147‑1 (MQ=255) aTGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGt > 7:56449/1‑147 (MQ=255) aTGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGt < 3:3022/147‑1 (MQ=255) aTGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgca < 2:138147/147‑3 (MQ=255) cgcgcAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCggg < 4:25300/149‑1 (MQ=255) cacCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGtt < 1:42307/148‑1 (MQ=255) cgcgCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTtcg > 5:52800/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGt > 3:256379/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTc < 8:56449/148‑1 (MQ=255) cAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCTGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCt > 3:219294/1‑149 (MQ=255) cAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTcc < 8:241295/148‑1 (MQ=255) cAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCt > 7:80669/1‑149 (MQ=255) aGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgcatcgc < 7:176045/123‑7 (MQ=255) aGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgcatcgc > 8:176045/1‑117 (MQ=255) ccAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCg > 6:41887/1‑149 (MQ=255) cAGACCGACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGt < 8:125337/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAgg > 3:125722/1‑149 (MQ=255) caGCCTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCa > 7:225258/1‑149 (MQ=255) ccTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTtcgt > 6:211771/1‑117 (MQ=255) ccTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTtcgt < 5:211771/117‑1 (MQ=255) cTGCACGCCGTGCGCGATTTCCCCCAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCtt < 6:189945/149‑1 (MQ=255) gCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTgg < 5:228247/107‑1 (MQ=255) gCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTgg > 6:228247/1‑107 (MQ=255) aCGCCGTGCTCGATTTCTGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAg < 4:219294/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGgc < 8:144600/149‑1 (MQ=255) gATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTAt > 1:58693/1‑149 (MQ=255) aTTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATc < 5:41887/149‑1 (MQ=255) aTTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATc > 8:52228/1‑149 (MQ=255) tttCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATcg > 6:109589/1‑149 (MQ=255) tttCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgcat > 7:39247/1‑77 (MQ=255) tttCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAACCTGGGCTGGAgcat < 8:39247/80‑4 (MQ=255) cGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCgg < 7:37270/148‑1 (MQ=255) aGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAg > 6:109263/1‑149 (MQ=255) cGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGCTGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCTCGGGCGCGCAGGCCg > 5:142273/1‑149 (MQ=255) acacGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCt > 3:230504/1‑149 (MQ=255) cacGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCtt < 8:80669/149‑1 (MQ=255) acGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTg < 5:109589/149‑1 (MQ=255) ggCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGc > 7:7985/1‑141 (MQ=255) ggCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGc < 8:7985/141‑1 (MQ=255) ggCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTggg < 7:52228/149‑1 (MQ=255) ccGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGc < 8:225258/149‑1 (MQ=255) gATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAgg > 4:20370/1‑136 (MQ=255) gATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGa < 4:256379/149‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAgg < 5:71967/110‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAgg > 6:71967/1‑110 (MQ=255) cgcTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGgcgc < 6:52800/148‑1 (MQ=255) gcTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGcc > 4:238814/1‑148 (MQ=255) ggCCGGTTCCCAGGGGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGAc > 3:84056/1‑147 (MQ=255) ggCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGAc > 7:143975/1‑147 (MQ=255) ggCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGAc > 2:242497/1‑147 (MQ=255) cccAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGtt < 1:242497/148‑1 (MQ=255) cAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTg > 8:120184/1‑147 (MQ=255) gATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTgaa > 1:170746/1‑144 (MQ=255) gATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTgaa < 2:170746/144‑1 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCAcc > 5:163428/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGa < 5:109263/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATc > 5:243244/1‑149 (MQ=255) | GCACGACCTGATGGGCGCGCAGTACACCGCGCTCTTCCAGCACCAGACCCACCAGCTTTTCCTGCACGCCGTGCTCGATTTCCGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATC > NC_002947/5925250‑5925544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |