| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,963,851 | C→A | 10.0% | I217I (ATC→ATA) | PP_5229 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,963,851 | 0 | C | A | 10.0% | 232.0 / 14.3 | 80 | I217I (ATC→ATA) | PP_5229 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/34); new base A (4/4); total (42/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
TCCTGTTCGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGACCT > NC_002947/5963703‑5963999 | tCCTGTTCGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTAGCCTTTTCCTCGGCTATATc > 4:57132/1‑149 (MQ=255) tGTTCGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGcc > 6:242208/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCGATATAGcc < 7:225731/147‑1 (MQ=255) cGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCGATATAGCCGAg < 6:96709/148‑1 (MQ=255) ccGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGGCGCCGCTCTTGAGTACCACCCGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCCGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCTTtg < 6:162844/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTtgt < 6:146910/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGGGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCAc > 8:38289/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTATCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTg < 6:200313/125‑1 (MQ=255) cAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTATCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTg > 5:200313/1‑125 (MQ=255) cAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCAcc > 8:15222/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTGCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCAcc < 7:144325/148‑1 (MQ=255) cgcCTTGGAAGCTCGTGAGTACCACGTGCTGCATGGGGTTCTGGCGATCGTCAGGATCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACGCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCTTTGTGCCACGCGTCACCCA‑Ga < 6:263049/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GAcc < 8:155965/149‑1 (MQ=255) gttgCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGTTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCt < 7:47538/146‑1 (MQ=255) gTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCt < 5:177316/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCCTCGGCAGCCGCGACCCGCCACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATCTCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGGTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTgcg < 5:62446/149‑1 (MQ=255) ctctTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCg < 5:133527/149‑1 (MQ=255) tctTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCGATATAGCCGAgga > 3:45297/1‑104 (MQ=255) tctTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCGATATAGCCGAgga < 4:45297/105‑2 (MQ=255) aGTACGAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGTCGCGACCCGCAACACTACAAGACCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGc < 3:38437/149‑1 (MQ=255) gTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCt > 3:245422/1‑149 (MQ=255) gTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCt > 1:192436/1‑149 (MQ=255) tACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCt > 2:128317/1‑148 (MQ=255) ccAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑Ga < 5:226240/128‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑Ga > 6:226240/1‑128 (MQ=255) ccAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGAGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtg > 5:1089/1‑147 (MQ=255) cAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtgat > 1:236123/1‑148 (MQ=255) ggggCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtgatga > 7:71435/1‑148 (MQ=255) gggCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGaaa < 8:163639/149‑1 (MQ=255) gCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCa < 5:71443/149‑1 (MQ=255) cATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCa < 4:245422/148‑1 (MQ=255) cATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAg > 4:119/1‑149 (MQ=255) tGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCt > 1:231204/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAgg < 1:128317/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAgg < 6:1089/149‑1 (MQ=255) tGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCCCGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCt > 6:200348/1‑148 (MQ=255) gCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTc < 2:216480/99‑1 (MQ=255) gCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTc > 1:216480/1‑99 (MQ=255) gCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTa < 3:119/148‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTAtt < 5:242208/149‑1 (MQ=255) cATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtga > 4:101179/1‑124 (MQ=255) cATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtga < 3:101179/124‑1 (MQ=255) cATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTg > 7:63464/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTgcg < 7:15222/149‑1 (MQ=255) gCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGcac > 2:266069/1‑149 (MQ=255) ccGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtgatg > 1:33505/1‑117 (MQ=255) ccGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCtgatg < 2:33505/117‑1 (MQ=255) gCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAAc > 6:98718/1‑147 (MQ=255) gCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAAc > 4:31701/1‑147 (MQ=255) cTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAgcgc > 4:232471/1‑147 (MQ=255) tACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAgc > 6:172819/1‑144 (MQ=255) tACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAgc < 5:172819/144‑1 (MQ=255) tACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAg > 2:176518/1‑149 (MQ=255) tACAAGAGAAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCTGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAg > 5:217352/1‑149 (MQ=255) cAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAgg < 5:98718/148‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAg < 8:63464/147‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑AACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGgt > 6:159989/1‑149 (MQ=255) agagCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGgtgt > 5:196223/1‑149 (MQ=255) agcGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAg < 2:192436/149‑1 (MQ=255) tCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGcaca < 1:176518/149‑1 (MQ=255) gTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCt < 1:97372/81‑1 (MQ=255) gTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCt > 2:97372/1‑81 (MQ=255) gTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCt > 5:274573/1‑149 (MQ=255) ccTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCg > 7:1719/1‑147 (MQ=255) ccTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCg > 8:171301/1‑147 (MQ=255) 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cTCGGCGATATAGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCATGACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTa > 1:202240/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGATATAGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTAc > 6:37798/1‑149 (MQ=255) tCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTAcc > 3:245623/1‑149 (MQ=255) tCGGCGATATAGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTgc > 6:20554/1‑107 (MQ=255) tCGGCGATATAGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTgc < 5:20554/107‑1 (MQ=255) ggCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGt > 6:207741/1‑149 (MQ=255) gCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTc < 2:236123/149‑1 (MQ=255) cTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTcg < 3:31701/149‑1 (MQ=255) atCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGAc > 3:181348/1‑149 (MQ=255) atCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGAc > 3:256132/1‑149 (MQ=255) tCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGAcc < 4:245623/149‑1 (MQ=255) cGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGACCt > 6:248669/1‑149 (MQ=255) | TCCTGTTCGGTGAAGAACAGCGCCGGGAAGTAGGCTCCAGCGCCGTGGCAGCTCTTGAGTACCAGGGGCTGCATGGGGTTCTGGCCATCGGCAGCCGCGACCCGCAACACTACAAGAGCAGCGTCGGTACCCTTTTCCTCGGCTATATCGCCGAGGTGCTTGGCCGCGTTGTGCCACGCGTCACCCA‑GACCCTGCGCCCGGTACGCTGATGAAACGCCAGCTGGAGGCTTATTGCGCACACCTGCGCAACGAGCGCCAGGTGTCGGAGCACACCTCGCAGGGCTACCGTCGCGACCT > NC_002947/5963703‑5963999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |