Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 685,192 | C→G | 7.7% | S352T (AGC→ACC) ‡ | cadA‑II ← | cadmium translocating P‑type ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 685,192 | 0 | C | G | 7.7% | 199.0 / 6.5 | 65 | S352T (AGC→ACC) ‡ | cadA‑II | cadmium translocating P‑type ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/30); new base G (2/3); total (32/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.96e-01 |
ACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCACGCGCAAGTGGG > NC_002947/685047‑685336 | acGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGt > 6:169750/1‑149 (MQ=255) ggTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCa > 2:71060/1‑149 (MQ=255) cGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑g < 7:243599/149‑1 (MQ=255) gACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACAGCGTCACC‑gg < 6:81742/149‑1 (MQ=255) gACCAGCTTCTGGATCGGCGCGTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACAGCGTCACC‑gg < 5:168179/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACAGCGTCACC‑ggtg > 1:189031/1‑147 (MQ=255) ccAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACAGCGTCACC‑ggtg < 2:189031/149‑3 (MQ=255) cTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCt > 8:98492/1‑149 (MQ=255) cTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCt > 8:1651/1‑149 (MQ=255) cTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTg < 8:141415/148‑1 (MQ=255) cTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTg < 5:169750/148‑1 (MQ=255) cGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTg > 5:95701/1‑149 (MQ=255) ggCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTgg > 3:189010/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTgg > 6:2370/1‑148 (MQ=255) gcgcTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTgg > 1:270896/1‑148 (MQ=255) cgcTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCa < 1:236365/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGct > 6:225993/1‑149 (MQ=255) gTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCTCCGGTTACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCa < 7:167131/149‑1 (MQ=255) gTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCt > 6:81256/1‑105 (MQ=255) gTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCt < 5:81256/105‑1 (MQ=255) ttCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑ggg > 6:75175/1‑149 (MQ=255) accaGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTg < 1:127741/121‑1 (MQ=255) accaGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTg > 2:127741/1‑121 (MQ=255) gatgatGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCAt < 8:142736/149‑1 (MQ=255) atgCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGgct < 5:131879/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGc < 4:55735/132‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGc > 3:55735/1‑132 (MQ=255) gcgcgcCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGgctgc > 8:248972/1‑149 (MQ=255) gcCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGcc < 3:107158/149‑1 (MQ=255) gcCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGcc < 6:259126/149‑1 (MQ=255) gCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCt > 7:78369/1‑149 (MQ=255) cACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCtt < 4:189010/149‑1 (MQ=255) cGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCg < 3:171664/149‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGAc < 5:2370/149‑1 (MQ=255) tctcGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGAcc > 8:245750/1‑149 (MQ=255) tctcGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGAc > 3:131342/1‑148 (MQ=255) ccAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTTTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCATAGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTc < 1:188398/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCg < 6:95701/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑gg > 3:33973/1‑102 (MQ=255) gcCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑gg < 4:33973/102‑1 (MQ=255) tACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGt > 3:73259/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGtt > 7:44073/1‑149 (MQ=255) cGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGtt < 8:78369/148‑1 (MQ=255) gCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCg > 6:67744/1‑149 (MQ=255) agcagcCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCggg < 5:67744/149‑1 (MQ=255) agcagcCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCggg < 4:73259/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGATTg > 1:51950/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGa > 4:141322/1‑149 (MQ=255) gCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCtt < 7:163275/144‑1 (MQ=255) gCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCtt > 8:163275/1‑144 (MQ=255) gCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTAc > 6:239676/1‑147 (MQ=255) cATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGc > 4:2913/1‑82 (MQ=255) cATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGc > 4:6767/1‑82 (MQ=255) cATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGc < 3:6767/82‑1 (MQ=255) cATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGc < 3:2913/82‑1 (MQ=255) aTTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCGTGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGt > 2:206712/1‑149 (MQ=255) aTTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCg > 2:231849/1‑100 (MQ=255) aTTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCg < 1:231849/100‑1 (MQ=255) aTGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGcc < 2:51950/149‑1 (MQ=255) gcgcCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCa < 7:1651/148‑1 (MQ=255) ccACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCAcgcg < 7:245750/149‑1 (MQ=255) aacccGGTGACAGCGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCAcgcg > 6:189571/4‑149 (MQ=255) gTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCCCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGCGAAGCGTTCGCCCGCCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCACGCCCAAGtc > 8:125467/1‑148 (MQ=255) tGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCACGCGCAAGTgg < 4:131342/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGGCGACTGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCACGCGCAAGTggg < 1:71060/148‑1 (MQ=255) | ACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACC‑GGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCGCTGATCA‑GGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGACCAGTACCAGGTCGCCCACGCGCAAGTGGG > NC_002947/685047‑685336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |