Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 819,703 | T→A | 8.1% | A61A (GCT→GCA) | ada → | fused O(6)‑alkylguanine DNA alkyltransferase/transcriptional activator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 819,703 | 0 | T | A | 8.1% | 172.8 / 3.1 | 59 | A61A (GCT→GCA) | ada | fused O(6)‑alkylguanine DNA alkyltransferase/transcriptional activator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/24); new base A (3/2); total (33/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAGAGCCGCGACACTGCCGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGTCAG > NC_002947/819563‑819846 | gagagCCGCGACACTGCCGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTa > 2:155159/1‑149 (MQ=255) cgcgACACTGCCGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGc > 8:76585/1‑149 (MQ=255) cGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCAGCCTCGGCAGCCgcggca > 4:116547/1‑128 (MQ=255) cGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCAGCCTCGGCAGCCgcggca < 3:116547/133‑6 (MQ=255) cTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGt < 3:194566/149‑1 (MQ=255) cACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCaa < 5:163852/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACCACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCAGCCGGCTACCGTGCTTGCCAACGCTGTATCAGCAAgg > 5:172032/1‑149 (MQ=255) tGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGc < 3:243002/147‑1 (MQ=255) accaccGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCAcag > 1:248397/1‑149 (MQ=255) caccGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCaa < 1:66232/126‑1 (MQ=255) caccGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCaa > 2:66232/1‑126 (MQ=255) caccGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCAcagc > 2:75865/1‑148 (MQ=255) ccGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCAcagccag < 2:248397/149‑1 (MQ=255) gCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTg < 8:82017/149‑1 (MQ=255) tACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGGTAc > 3:47409/1‑149 (MQ=255) cTGCGACCCCGGCTGCAATTCACGGCAGGGCAAGCGTATGATCGTCGAGTTGTACGACACTGGCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACtg < 4:47409/149‑2 (MQ=255) tGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCa > 2:12909/1‑149 (MQ=255) aCCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCCCCCGCCCCAGCCCGCTGGTTACTCACGcc > 4:28374/1‑149 (MQ=255) aCCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGcc > 4:171094/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCAc < 5:250975/143‑1 (MQ=255) ccGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCAc > 6:250975/1‑143 (MQ=255) gCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGc < 3:171094/149‑1 (MQ=255) gCTGCAAATAACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGc > 8:207405/1‑149 (MQ=255) cAACTCACGCCAGGCCACGCGTATGAAGGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTg < 6:172032/148‑1 (MQ=255) cAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCa < 7:49903/135‑1 (MQ=255) cAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCa > 8:49903/1‑135 (MQ=255) aaaTCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGAt < 1:155159/149‑1 (MQ=255) aaaTCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGAt < 5:132179/149‑1 (MQ=255) aaTCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATc > 6:84390/1‑149 (MQ=255) aaTCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATc < 3:163949/149‑1 (MQ=255) tCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCg > 5:174420/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAg > 3:75299/1‑97 (MQ=255) gCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAg < 4:75299/97‑1 (MQ=255) ccAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGAc > 2:267033/1‑149 (MQ=255) cAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGAcc > 3:85601/1‑149 (MQ=255) cAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGAcc < 5:84390/149‑1 (MQ=255) gTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGtt < 4:52352/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCt > 1:172078/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAgcg > 4:125417/1‑78 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAgcg < 3:125417/78‑1 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGcc < 2:898/147‑1 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGcc > 1:898/1‑147 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTc > 5:135724/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCAGCCACAGCCCGCTGGTTACTAACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTGCCAAGCCTc > 8:240048/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGc > 1:123019/1‑145 (MQ=255) cGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGc < 2:123019/145‑1 (MQ=255) gAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCgg < 1:75865/149‑1 (MQ=255) cTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCaa < 6:174420/148‑1 (MQ=255) cTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCaa < 2:172078/148‑1 (MQ=255) cTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCaa > 8:233930/1‑148 (MQ=255) gACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAg > 6:31636/1‑149 (MQ=255) acacTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGt > 3:94051/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGc > 7:199198/1‑149 (MQ=255) ccgGCAGCCTCGGCAGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGAt < 3:112129/100‑1 (MQ=255) ccgGCAGCCTCGGCAGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGAt > 4:112129/2‑101 (MQ=255) gCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGt > 6:63685/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGt > 6:237511/1‑149 (MQ=255) gcggCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGTCAg < 5:237511/147‑1 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGTCAg > 7:203249/1‑149 (MQ=255) | GAGAGCCGCGACACTGCCGCTACAGGCCACTTTGTCTACGCCGTACGTACCACCGGCGTCTACTGCCACCCCGGCTGCAAATCACGCCAGGCCAAGCGTATGAACGTCGAGTTCTACGACACTGCCGCGGCTGCCGAGGCTGCCGGCTACCGTGCTTGCAAACGCTGTATCAGCAAGGCCAGCGCCACCCGCCACAGCCAGCTGGTTACTCACGCCTGCCGCTTGATCGAAACCAGCGACCCCGTTCCAAGCCTCGGCCAACTCAGTGCACGGCTGGCCGTCAG > NC_002947/819563‑819846 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |