| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 857,884 | G→T | 8.7% | P314T (CCG→ACG) | phr ← | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 857,884 | 0 | G | T | 8.7% | 202.2 / 8.4 | 69 | P314T (CCG→ACG) | phr | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (25/38); new base T (2/4); total (27/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.79e-01 | |||||||||||
CAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGTCGAAC > NC_002947/857736‑858032 | cAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCgg > 8:194483/1‑149 (MQ=255)cAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCACCAATGATCGGGACGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCgg > 8:130652/1‑149 (MQ=255)cAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGAGCATCCACCCGCTGAGCAGAAATTGGCGCATGGCGGCACCTATCATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCgg > 8:134334/1‑149 (MQ=255) tCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGc < 6:119434/149‑1 (MQ=255) cagcagGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCgggg < 5:186394/143‑1 (MQ=255) cagcagGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCgggg > 6:186394/1‑143 (MQ=255) agGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCca < 5:144063/149‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCcag < 5:140475/149‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCcag < 8:150523/149‑1 (MQ=255) gTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCcag < 4:99864/148‑1 (MQ=255) cTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCcagggc < 6:257472/148‑1 (MQ=255) gCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCcagggcaggg > 1:55297/1‑149 (MQ=255) gCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGGGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCCTGGCGTGACGCcccggca < 6:30713/146‑1 (MQ=255) cTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCCTGGCGTGACGCcccggcagacc < 2:158594/149‑4 (MQ=255) tGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCt > 1:266184/1‑149 (MQ=255) ggAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCg < 3:89360/149‑1 (MQ=255) aaCATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTCCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGt > 5:137669/1‑149 (MQ=255) aCATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTc > 6:71880/1‑149 (MQ=255) tGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTgg < 2:36163/149‑1 (MQ=255) gCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGGCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTggg < 6:266271/148‑1 (MQ=255) ccATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAg > 7:179620/1‑149 (MQ=255) tGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCAc > 5:144824/1‑114 (MQ=255) tGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCAc < 6:144824/114‑1 (MQ=255) gcAAGCGGTTGTGCATCCACCCGTTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCgg > 7:169213/1‑149 (MQ=255) gcAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGACTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCgg > 8:247441/1‑149 (MQ=255) aaGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGCAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTg < 5:216356/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTg < 7:22564/149‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGgc > 4:155479/1‑149 (MQ=255) gCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCACCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGgc > 2:257128/1‑149 (MQ=255) ttGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGcgcg > 1:230044/1‑148 (MQ=255) gtgCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCgaga > 6:86504/1‑149 (MQ=255) tCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCtgt < 2:266184/149‑1 (MQ=255) tCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCtgt < 8:194242/149‑1 (MQ=255) cACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCtgtg < 8:169213/148‑1 (MQ=255) ggTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAAc < 3:155479/149‑1 (MQ=255) gcagcaATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCt > 6:124726/1‑148 (MQ=255) cagcaATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCa < 2:55297/149‑1 (MQ=255) agcaATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCACGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAg > 8:85466/1‑149 (MQ=255) gcaATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGACGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAg > 4:66240/1‑148 (MQ=255) aTTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCACGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGAtg < 7:85466/149‑1 (MQ=255) gcgcATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGc < 5:71880/148‑1 (MQ=255) gcATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTg < 8:179620/149‑1 (MQ=255) cATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGACTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGt < 7:247441/149‑1 (MQ=255) gcggcATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑Gaa > 7:231071/1‑149 (MQ=255) cggcATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAAc < 7:194483/149‑1 (MQ=255) ccAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACg < 1:257128/148‑1 (MQ=255) aaTGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGc < 2:230044/148‑1 (MQ=255) gATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCa > 6:30271/1‑147 (MQ=255) tCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAgg < 7:123989/87‑1 (MQ=255) tCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGACAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAgg > 8:123989/1‑87 (MQ=255) cGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATcc < 5:124726/148‑1 (MQ=255) cccTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGt > 7:126595/1‑149 (MQ=255) cccTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGCCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGt < 3:66240/149‑1 (MQ=255) cTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAg < 2:148012/145‑1 (MQ=255) cTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAg > 1:148012/1‑145 (MQ=255) gCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCAAGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGCCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGAGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGAA‑GAACTCACGCCAGAGAAGCTCATTGATCCAAGTCTg > 2:209137/1‑148 (MQ=255) cTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAATGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTTGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGc < 6:137669/148‑1 (MQ=255) tCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCAc > 2:118216/1‑149 (MQ=255) tCCCAGGCCGCCAGGTCTGCC‑TGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCaga > 6:40478/1‑123 (MQ=255) tCCCAGGCCGCCAGGTCTGCC‑TGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCaga < 5:40478/123‑1 (MQ=255) ccgccAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCtgtg < 8:231071/149‑1 (MQ=255) cgccAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGtgc > 1:98835/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGtgctg > 4:20068/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCa < 7:134334/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCa < 7:130652/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCa < 5:108222/149‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGc < 5:238821/137‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGc > 6:238821/1‑137 (MQ=255) ccTGCCCTGGCGTGACGCCCCGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCa > 6:134156/2‑133 (MQ=255) ccTGCCCTGGCGTGACGCCCCGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCa < 5:134156/132‑1 (MQ=255) ccGGGTCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGTc < 6:271364/148‑1 (MQ=255) ccGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTg < 5:30271/146‑1 (MQ=255) ccGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGt < 8:126595/147‑1 (MQ=255) ccGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGGGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTATGAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGt < 1:209137/148‑1 (MQ=255) gggCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGTCGAAc > 8:152119/1‑149 (MQ=255) | CAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCGGTTGTGCATCCACCCGGTGTGCAGCAATTGGCGCATGGCGGCATCAATGATCGGGAAGCCGGTGCGGCCCTGCTCCCAGGCCGCCAGGTCTGCCGGGGCGTCACGCCAGGGCAGGGCTTCGGTCTGGGCGCGGAAGGCGCGGTGGCGCGAGACCTGTGGATAACCGCTCAGGATGTGCTTGTA‑GAACTCACGCCAGAGTAGCTCATTGATCCAGGTCTGCACGCCTGTGCTGCCACTGTCGAAC > NC_002947/857736‑858032 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |