Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,469,670 | A→G | 6.7% | V158A (GTC→GCC) | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,469,670 | 0 | A | G | 6.7% | 174.3 / 2.8 | 60 | V158A (GTC→GCC) | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/30); new base G (2/2); total (28/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.69e-01 |
GGTGGTGTTCAGCGCGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAG > NC_002947/1469522‑1469812 | ggtggtGTTCAGCGCGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGa > 5:213669/1‑149 (MQ=255) gtTCAGCGCGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTgg < 4:42726/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGa > 1:99462/1‑148 (MQ=255) gcgcGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCAGCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGaaa < 2:148009/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAActct < 2:251076/149‑1 (MQ=255) aGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAg > 5:6710/1‑149 (MQ=255) ttCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCt < 3:84648/144‑1 (MQ=255) tCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAgg > 6:19865/1‑147 (MQ=255) ccACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGa > 2:37179/1‑117 (MQ=255) ccACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGa < 1:37179/117‑1 (MQ=255) cACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAACACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTaga < 3:102747/149‑1 (MQ=255) cACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAACACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTa > 4:102747/1‑147 (MQ=255) aGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAg < 4:158883/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCg > 1:248832/1‑149 (MQ=255) cTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGaa > 7:156253/1‑149 (MQ=255) cTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCACGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGCTCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTCGGGAAACTCTGCGGCTAGCTGAGGTAGAGCATTGcacacgga > 8:52483/1‑141 (MQ=255) tGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAAt > 2:169474/1‑149 (MQ=255) gTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCAtt > 7:112052/1‑136 (MQ=255) gTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCAtt < 8:112052/136‑1 (MQ=255) cATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAgg > 6:221512/1‑149 (MQ=255) tGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTg > 8:92998/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTgg < 5:258194/148‑1 (MQ=255) gCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCt > 3:16986/1‑149 (MQ=255) cagcagCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTcg > 6:104624/1‑149 (MQ=255) agcagcACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTcgc > 8:83009/1‑149 (MQ=255) gcaCCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGGCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCCGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCGGTTTCGCGGcc > 2:120259/1‑149 (MQ=255) gcaCCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGGCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGcc > 2:124385/1‑149 (MQ=255) gcaCCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGcc > 3:92283/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCt > 4:142391/1‑149 (MQ=255) tGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCtt > 4:249629/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGa < 6:213669/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCACGGCCTGCTTGa < 8:156253/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGGTGGCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAg < 1:124385/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCCGCTTCCGGGGTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGGCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGGATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAg < 1:120259/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCa < 2:99462/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAgg > 6:43743/1‑148 (MQ=255) gCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAgg < 5:43743/148‑1 (MQ=255) ccGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGtt > 8:241046/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGtt < 5:19865/149‑1 (MQ=255) gCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTc < 7:241046/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCg < 3:142391/149‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCgg > 5:37684/1‑149 (MQ=255) gggTTGCCGGCGGCGTGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGGGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTc < 7:92998/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGTCGGCGCGCCTGTGGTCGATCTGCTGCTTCGCGTTTAGCTAGGGGAAACTCTGCCGGTAGCGGAGGTAGAGGATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCATGGTTTCGGCTTCCt < 6:205479/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCa < 5:221512/148‑1 (MQ=255) gcgcgcCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGc < 1:169474/149‑1 (MQ=255) cgcgcCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGcc > 4:127042/1‑149 (MQ=255) gcgcCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCt > 1:241032/1‑149 (MQ=255) gcCACTGGTCGTTCTGCTGCTGCGCGTGGACCTTGGGGATACTCTGCGGGGAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGTATCAGGGTATTGCGTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTgg < 7:52483/149‑1 (MQ=255) gcCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTgg < 4:92283/149‑1 (MQ=255) gcCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTgg < 6:6710/149‑1 (MQ=255) aCTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTg < 5:104624/149‑1 (MQ=255) gTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCAc < 2:17148/131‑1 (MQ=255) gTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCAc > 1:17148/1‑131 (MQ=255) gctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTg > 5:247577/1‑149 (MQ=255) ctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCgg < 4:16986/144‑1 (MQ=255) ctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGc < 3:127042/145‑1 (MQ=255) ctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCtt < 6:37684/147‑1 (MQ=255) ctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTgg < 7:83009/149‑1 (MQ=255) ctgctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTg < 2:248832/148‑1 (MQ=255) ctgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGcc < 6:247577/148‑1 (MQ=255) gTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcag > 1:216583/1‑147 (MQ=255) gTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcag > 8:188414/1‑147 (MQ=255) | GGTGGTGTTCAGCGCGGCCTTGCAGATCTTTTCCACTTCACCCAGGTGCTGGTCATAGGTGCCCTGGGTGCGGTACAGCAGCACCTGGGCCAGGCCCGCTTCCGGGTTGCCGGCGGCGCGCCACTGGTCGATCTGCTGCTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAG > NC_002947/1469522‑1469812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |