Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,933,664 | G→T | 10.6% | R30R (CGC→CGA) | minD ← | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,933,664 | 0 | G | T | 10.6% | 123.4 / 3.6 | 44 | R30R (CGC→CGA) | minD | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (19/20); new base T (2/3); total (21/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCCTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAG > NC_002947/1933524‑1933809 | tCCTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGc < 2:42638/149‑1 (MQ=255) tCCTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCACAGTGc < 2:134566/149‑1 (MQ=255) cTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGa > 8:95530/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAg > 6:139961/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGAGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCgcg > 7:175577/1‑147 (MQ=255) gATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAg < 1:197830/147‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGcc < 4:62487/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGcc < 6:73407/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGc < 8:175577/148‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGc < 3:233926/148‑1 (MQ=255) tCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCg > 1:246852/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGCCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGcc > 7:245549/1‑142 (MQ=255) ccTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGCCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGcc < 8:245549/142‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTGGCTTCGCCGTGGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATgg < 7:172227/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt > 6:211721/1‑143 (MQ=255) aGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt < 5:211721/143‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTa < 2:78890/133‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTa > 1:78890/1‑133 (MQ=255) gTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCt > 2:228818/1‑149 (MQ=255) ccACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGcc > 5:234820/1‑148 (MQ=255) cGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCcaca < 5:139961/149‑1 (MQ=255) gACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACAcccc > 6:177524/1‑149 (MQ=255) gTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCgg < 3:264311/149‑1 (MQ=255) caccacGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGaa < 2:246852/148‑1 (MQ=255) cacGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTaa < 1:228818/149‑1 (MQ=255) gcggcgTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGGAGGCCGACGTCGAAGTCGACAATGACTGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCa < 1:107724/149‑1 (MQ=255) gcggcgTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCa > 5:142191/1‑149 (MQ=255) aGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTg < 6:50537/149‑1 (MQ=255) cccATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGc > 4:48145/1‑149 (MQ=255) cATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTg > 4:158573/1‑100 (MQ=255) cATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTg < 3:158573/100‑1 (MQ=255) aTGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCcaca > 5:213718/1‑111 (MQ=255) aTGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCcaca < 6:213718/111‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTc < 3:48145/149‑1 (MQ=255) cGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaa < 7:95530/148‑1 (MQ=255) gCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaaaa > 2:225299/1‑149 (MQ=255) aCGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCggg < 5:177524/149‑1 (MQ=255) cGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGAGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGa > 7:125441/1‑149 (MQ=255) aaGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACtt > 4:119725/1‑149 (MQ=255) gACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTccc > 8:97774/1‑149 (MQ=255) gACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCaa > 5:156213/1‑148 (MQ=255) taccggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCACGGTGTTTCACCCCTAAAATTAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTg > 5:156103/5‑148 (MQ=255) gtgGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGa < 6:234820/147‑1 (MQ=255) gCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAg > 1:270457/1‑149 (MQ=255) | TCCTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAG > NC_002947/1933524‑1933809 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |