Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 274,085 | T→A | 6.1% | D162V (GAC→GTC) | PP_0221 ← | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 274,085 | 0 | T | A | 6.1% | 196.1 / 2.6 | 66 | D162V (GAC→GTC) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/27); new base A (2/2); total (37/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.22e-01 |
ACAGCAACGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTG > NC_002947/273939‑274228 | aCAGCAACGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGt > 2:149915/1‑147 (MQ=255) cAGCAACGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAg < 4:17993/149‑1 (MQ=255) cAACGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCt > 2:60981/1‑149 (MQ=255) cGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCgg < 1:149915/149‑1 (MQ=255) aGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGcc > 2:34643/1‑149 (MQ=255) gTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCtt > 6:236798/1‑149 (MQ=255) gTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCtt < 7:130541/149‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAATGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGCTGACATCCTCgc > 8:2615/1‑137 (MQ=255) cATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGCTGACATCCTCgc > 8:6308/1‑137 (MQ=255) cATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGCTGACATCCTCgc < 7:6308/138‑2 (MQ=255) cATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGCTGACATCCTCgc < 7:2615/138‑2 (MQ=255) ggTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGc < 3:98432/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCt < 4:246760/148‑1 (MQ=255) ctggCGGATGGAGGCCGGGTAACCGTGCACGAGGTCGGCGTCGTGGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCGCGGTGGCCTTGTAGGCCACGCCTGGCTTGa < 2:132798/147‑1 (MQ=255) gTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCATGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATc > 2:252194/1‑148 (MQ=255) ggCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGAGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAcc > 2:124595/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAccc > 6:222204/1‑149 (MQ=255) gCCGGGT‑ACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCg > 6:82028/1‑149 (MQ=255) cccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGc > 3:165350/1‑149 (MQ=255) cccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGc > 3:168761/1‑149 (MQ=255) ccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTgg > 2:242616/1‑102 (MQ=255) ccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTgg < 1:242616/102‑1 (MQ=255) gTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCAGGCCTTGGCcagcagcggcc > 1:18006/1‑148 (MQ=255) cGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAgg > 7:62546/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAg > 3:53373/1‑97 (MQ=255) ggCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAg < 4:53373/97‑1 (MQ=255) tcgtcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCTGCTGCTGCTGGCCaan < 4:168761/149‑3 (MQ=255) tcgtcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCTGCTGCTGCTGGCCaag < 4:165350/149‑3 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAgg < 2:110755/105‑1 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAgg > 1:110755/1‑105 (MQ=255) cgcgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTg > 2:173489/1‑149 (MQ=255) gcgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcagc < 7:253066/130‑1 (MQ=255) gcgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcagc > 8:253066/1‑130 (MQ=255) tACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCg > 8:242886/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAgg > 4:210524/1‑94 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAgg < 3:210524/94‑1 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGt > 4:55004/1‑149 (MQ=255) cACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTgg < 6:241416/149‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGc > 3:144009/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGc > 6:31273/1‑149 (MQ=255) ccGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGc > 5:72856/1‑148 (MQ=255) ccTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATg > 1:131030/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATgg < 1:173489/149‑1 (MQ=255) tCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGACCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGc > 2:224267/1‑149 (MQ=255) gACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGc < 2:131030/147‑1 (MQ=255) gACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCa < 3:55004/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCgg < 8:106384/129‑1 (MQ=255) tGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCt > 3:262503/1‑149 (MQ=255) gAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTg > 1:138240/1‑149 (MQ=255) gAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTg > 5:122107/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCtt > 3:37429/1‑84 (MQ=255) cTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCtt < 4:37429/84‑1 (MQ=255) tCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGACGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCtt > 7:173817/1‑147 (MQ=255) cAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 5:236798/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTTTAGAGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAg > 6:52548/1‑149 (MQ=255) aGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 4:144009/149‑1 (MQ=255) aGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 8:62546/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCATGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAg < 1:252194/148‑1 (MQ=255) gCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCt > 8:142507/1‑149 (MQ=255) gAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 5:174451/132‑1 (MQ=255) gAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg > 6:174451/1‑132 (MQ=255) gAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCttt > 7:145049/1‑149 (MQ=255) aGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 8:173817/149‑1 (MQ=255) aGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 6:122107/149‑1 (MQ=255) ggATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTg > 2:247546/1‑149 (MQ=255) gATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 5:196958/147‑1 (MQ=255) gATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt > 6:196958/1‑147 (MQ=255) | ACAGCAACGCCGAGGTAGCATCGAAGGTGTTGGCCAGGCGGATGTAGGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTG > NC_002947/273939‑274228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |