| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,632,620 | C→G | 6.9% | P31R (CCC→CGC) | PP_3201 → | BNR domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,632,620 | 0 | C | G | 6.9% | 218.6 / 4.4 | 69 | P31R (CCC→CGC) | PP_3201 | BNR domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/32); new base G (2/3); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
CAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAGGCCACTGCCGT > NC_002947/3632476‑3632761 | cAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCcgcg > 7:36185/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTg > 2:80900/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCa > 7:87724/1‑149 (MQ=255) cTGCGCAGGTTCTGTACCGTCTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGTGCAGCGCGGGCTGcgcga < 3:60709/149‑2 (MQ=255) gcAGGTGCTGTACAGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCTCAGCCAGCGCTGCACGGcccc > 8:88517/1‑149 (MQ=255) gTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAgg > 4:108820/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCCCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGctc < 5:80805/149‑1 (MQ=255) cGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTACCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgcgtg > 5:53576/1‑149 (MQ=255) gACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgcgtgc < 8:87724/149‑1 (MQ=255) aCTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgcgtgcg < 4:243510/149‑1 (MQ=255) ctctAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGGCTCGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgcgtgc < 1:80900/149‑1 (MQ=255) tctAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGgt > 6:163918/1‑149 (MQ=255) tAAGTACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCTGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGAAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGgtgt < 7:88517/149‑1 (MQ=255) tAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGccccc < 8:189066/131‑1 (MQ=255) tAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGgtgt > 4:1234/1‑149 (MQ=255) aaGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgc > 1:68183/1‑139 (MQ=255) aaGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCtgc < 2:68183/139‑1 (MQ=255) aGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGtt < 3:108820/148‑1 (MQ=255) gAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGc < 8:36185/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGa > 2:259625/1‑149 (MQ=255) aGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGAtgt > 7:166162/1‑149 (MQ=255) gtgcgATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAg > 1:156244/1‑137 (MQ=255) gtgcgATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAg < 2:156244/137‑1 (MQ=255) tGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGAt < 3:1234/149‑1 (MQ=255) gAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATg > 4:188601/1‑149 (MQ=255) cAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCAc > 3:105506/1‑149 (MQ=255) aGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGc < 5:142827/149‑1 (MQ=255) gATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGcc > 7:216629/1‑149 (MQ=255) tctACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTc > 3:147991/1‑149 (MQ=255) tctACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTc > 2:214150/1‑149 (MQ=255) tACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGc < 4:77265/115‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTcgcg > 8:75595/1‑149 (MQ=255) caacaggctgCCAGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCgg > 4:67303/6‑149 (MQ=255) cGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGCTGACAGCGTGGATGTGCTAGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCgg > 8:61648/1‑149 (MQ=255) ctggctgCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCggtgg < 8:216629/149‑1 (MQ=255) ctggctgCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCggtgg < 8:166162/149‑1 (MQ=255) tgGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAAcgt > 4:84680/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCCGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGCTGCACGCCTGGTCGCggt > 8:11734/1‑137 (MQ=255) gCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCggt < 7:11734/137‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAAcgtgg < 4:147991/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAAc < 7:98794/145‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAAc > 8:98794/1‑145 (MQ=255) aGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAAcgtggcg < 5:153781/149‑1 (MQ=255) ttGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTa < 8:172918/148‑1 (MQ=255) cGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTActgc > 4:24265/1‑149 (MQ=255) ctaccgccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTc < 6:53576/146‑1 (MQ=255) gccgccGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTcc > 3:24144/1‑148 (MQ=255) ccgccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTcc < 7:75595/147‑1 (MQ=255) ccgccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCg < 1:214150/148‑1 (MQ=255) gccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCggtg < 1:167892/118‑1 (MQ=255) gccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCggtg > 2:167892/1‑118 (MQ=255) gccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGAt > 2:33756/1‑148 (MQ=255) gccgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATg < 1:259625/149‑1 (MQ=255) cgG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGa > 3:76690/1‑148 (MQ=255) gTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGAGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTTGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCAcc < 1:161717/149‑1 (MQ=255) 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tgtgCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATgg > 2:47624/1‑129 (MQ=255) tgtgCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATgg < 1:47624/129‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAg < 3:198383/142‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAg > 4:198383/1‑142 (MQ=255) gccgtgcAGCGCGGGCTGCGCGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAGGCCACtgc > 2:255901/6‑149 (MQ=255) ccgtgcAGCGCGGGCTGCGCGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAGGCCACtgcc < 1:255901/145‑1 (MQ=255) cgtgcAGCGCGGGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACCGCTGTCCGATGAc > 3:170054/4‑118 (MQ=255) cgtgcAGCGCGGGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACCGCTGTCCGATGAc < 4:170054/115‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAGGCCACtgccgt < 7:61648/149‑1 (MQ=255) | CAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGG‑‑CGTTCGCCGGTGACAGCGTGGATGTGCTCGCGCAGCCCGCGCTGCACGGCCCCCAGGCTCTGCGTGCGGTGTTGCAGGATGTGGCCCGGGCCGATGCACGCCTGGTCGCGGTGGGTGAACGTGGCGTGGTACTGCTGTCCGATGACAATGGTGCCACCTGGCGCCAGGCCACTGCCGT > NC_002947/3632476‑3632761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |